MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 7675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010263	ATG	3	9	549020	549028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010263	GCA	2	6	549042	549047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_010263	A	6	6	551050	551055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_010263	TAGTTT	2	12	551066	551077	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010263	CTG	2	6	551116	551121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_010263	ATC	2	6	551123	551128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_010263	ACT	2	6	551129	551134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_010263	TAA	2	6	551135	551140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010263	TAT	2	6	551204	551209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010263	TTA	2	6	552231	552236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_010263	TAA	2	6	552277	552282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_010263	ATTT	2	8	552369	552376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_010263	CAG	2	6	552411	552416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_010263	TTTAG	2	10	552458	552467	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010263	CAA	2	6	552486	552491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_010263	TTG	2	6	552517	552522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_010263	T	6	6	552547	552552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_010263	TAA	2	6	552558	552563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010263	GTAAT	2	10	552640	552649	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010263	CAA	2	6	552656	552661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_010263	CTA	2	6	552666	552671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_010263	TTTA	2	8	552699	552706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_010263	ATA	2	6	552720	552725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_010263	TAT	2	6	552748	552753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_010263	TAA	2	6	552788	552793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010263	ATA	2	6	552824	552829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_010263	TA	3	6	552836	552841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_010263	TAA	2	6	552845	552850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_010263	A	6	6	552870	552875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_010263	AAGA	2	8	552882	552889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_010263	TGT	2	6	554393	554398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_010263	TAG	2	6	554434	554439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010263	A	6	6	554447	554452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_010263	T	6	6	554457	554462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_010263	ATTT	2	8	554467	554474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_010263	AT	3	6	554481	554486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_010263	TATTAA	2	12	554494	554505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_010263	GTT	2	6	554507	554512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_010263	T	6	6	554511	554516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_010263	AG	3	6	555166	555171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_010263	CGTAG	2	10	555208	555217	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3042	NC_010263	ATTTTA	3	18	555292	555309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_010263	CGT	2	6	555604	555609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_010263	CGCTC	2	10	555645	555654	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3045	NC_010263	T	6	6	555729	555734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010263	AATT	2	8	555737	555744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010263	ATA	2	6	557258	557263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_010263	T	6	6	557270	557275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_010263	ACA	2	6	559757	559762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_010263	AAT	2	6	559787	559792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_010263	TTAA	2	8	559793	559800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010263	TAT	2	6	559840	559845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010263	TGC	2	6	559948	559953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_010263	TCT	2	6	559962	559967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_010263	TCC	2	6	559974	559979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_010263	TTA	2	6	559980	559985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_010263	TAA	2	6	560006	560011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_010263	AAT	2	6	560021	560026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_010263	AT	3	6	560728	560733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_010263	TGATA	2	10	560745	560754	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_010263	TAT	2	6	560777	560782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010263	TTA	2	6	560783	560788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_010263	TTA	2	6	560826	560831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010263	ATG	2	6	561250	561255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_010263	ATT	2	6	561486	561491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_010263	TAAA	2	8	563665	563672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_010263	GTA	2	6	563675	563680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_010263	CAT	2	6	563696	563701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_010263	ATATTA	2	12	563742	563753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3071	NC_010263	GCA	2	6	564196	564201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_010263	TA	3	6	564247	564252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_010263	ATAA	2	8	564278	564285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_010263	TCG	2	6	564462	564467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_010263	TAG	3	9	564507	564515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_010263	T	6	6	564704	564709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_010263	CATA	2	8	564714	564721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_010263	GCGA	2	8	564730	564737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3081	NC_010263	AAT	2	6	564764	564769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_010263	TAC	2	6	564832	564837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3084	NC_010263	TAA	2	6	564923	564928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_010263	ATC	2	6	564936	564941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3089	NC_010263	AT	3	6	565001	565006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_010263	AC	3	6	565087	565092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_010263	ATA	2	6	565105	565110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_010263	TTA	2	6	565260	565265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_010263	TCA	2	6	565693	565698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_010263	TATCAA	2	12	565914	565925	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3101	NC_010263	ATT	2	6	565933	565938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_010263	GCC	2	6	565988	565993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_010263	TAA	2	6	566054	566059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010263	CTG	2	6	566116	566121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_010263	TCTGC	2	10	566131	566140	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3111	NC_010263	TA	3	6	566398	566403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_010263	ATTTA	2	10	566411	566420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_010263	TAGA	2	8	566456	566463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_010263	TTTG	2	8	566464	566471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_010263	T	6	6	566563	566568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_010263	GGC	2	6	566588	566593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3118	NC_010263	T	6	6	566687	566692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_010263	TAA	2	6	566742	566747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010263	GCT	2	6	566765	566770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3122	NC_010263	ACT	2	6	566862	566867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3126	NC_010263	TAT	2	6	567117	567122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_010263	T	6	6	567122	567127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_010263	AACT	2	8	567129	567136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_010263	TAA	2	6	567152	567157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010263	TA	3	6	567186	567191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010263	TCT	2	6	568575	568580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_010263	T	6	6	568619	568624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_010263	TTA	2	6	568654	568659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_010263	T	6	6	568752	568757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3411	NC_010263	TA	3	6	623950	623955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3412	NC_010263	ATT	2	6	623959	623964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3413	NC_010263	AT	3	6	624613	624618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3414	NC_010263	AGC	2	6	624626	624631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3418	NC_010263	CAT	2	6	624840	624845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3420	NC_010263	TGC	2	6	624911	624916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3421	NC_010263	AGA	2	6	624937	624942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3422	NC_010263	ATGG	2	8	624962	624969	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3432	NC_010263	ATC	2	6	627562	627567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3435	NC_010263	TAT	2	6	627657	627662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3436	NC_010263	T	6	6	628166	628171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3437	NC_010263	CCTAT	2	10	628182	628191	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3438	NC_010263	AT	3	6	628243	628248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3439	NC_010263	AATAG	2	10	628252	628261	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3440	NC_010263	AAT	2	6	628279	628284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3441	NC_010263	AATT	2	8	628307	628314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3442	NC_010263	TAAA	2	8	628590	628597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3443	NC_010263	AT	3	6	628864	628869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3444	NC_010263	ATT	2	6	628900	628905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3451	NC_010263	ATG	2	6	629157	629162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3452	NC_010263	ATG	2	6	629178	629183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3453	NC_010263	ATTA	2	8	629186	629193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3454	NC_010263	ATT	2	6	629217	629222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3455	NC_010263	TATAGT	2	12	629238	629249	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3457	NC_010263	AAAT	2	8	629315	629322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3464	NC_010263	TTA	2	6	629705	629710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3465	NC_010263	TA	4	8	629767	629774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3466	NC_010263	ATGA	2	8	629822	629829	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3471	NC_010263	AAT	2	6	630021	630026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3472	NC_010263	TA	3	6	630043	630048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3473	NC_010263	T	6	6	630134	630139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3474	NC_010263	AT	3	6	630184	630189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3481	NC_010263	AAT	2	6	630518	630523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_010263	A	6	6	631610	631615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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