MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 7675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010263	AAG	2	6	210775	210780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010263	GTT	2	6	210955	210960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_010263	TAA	2	6	211039	211044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010263	TGC	2	6	211061	211066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_010263	TATT	2	8	211078	211085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010263	ATG	2	6	211325	211330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010263	A	6	6	211336	211341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010263	TAA	2	6	211965	211970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010263	TTA	2	6	212002	212007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010263	TTG	3	9	212021	212029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010263	T	6	6	212041	212046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010263	TC	4	8	212056	212063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_010263	TAT	2	6	212105	212110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010263	T	6	6	212131	212136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010263	T	6	6	212185	212190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010263	ATA	2	6	212247	212252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010263	T	7	7	212274	212280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010263	ATT	2	6	212329	212334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010263	AGA	2	6	212386	212391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010263	ATTAT	2	10	212477	212486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010263	CGA	2	6	212530	212535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_010263	A	6	6	212561	212566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010263	CTT	2	6	214954	214959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_010263	ATTTA	2	10	214964	214973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010263	ATA	2	6	215025	215030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010263	AAT	2	6	215092	215097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010263	CTAA	2	8	215109	215116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_010263	TAAT	2	8	215129	215136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010263	TAG	2	6	215148	215153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010263	ATA	2	6	215154	215159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_010263	AGCA	2	8	215168	215175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_010263	TAA	2	6	216279	216284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010263	ATT	2	6	216285	216290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010263	TCG	2	6	216325	216330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010263	A	8	8	216392	216399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010263	AAATT	2	10	216514	216523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010263	TTTCT	2	10	216529	216538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1038	NC_010263	TAT	2	6	217042	217047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010263	TTC	2	6	217113	217118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_010263	ATTT	2	8	217119	217126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010263	ATTT	2	8	217865	217872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010263	T	7	7	217870	217876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010263	T	6	6	218979	218984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010263	A	6	6	218987	218992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010263	GTCAA	2	10	218994	219003	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_010263	TAT	2	6	219013	219018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010263	TAAA	2	8	219019	219026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010263	AATTA	2	10	219084	219093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010263	TGC	2	6	220755	220760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_010263	CT	3	6	220783	220788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_010263	GCT	2	6	221642	221647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_010263	TTG	2	6	221939	221944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010263	TG	3	6	221943	221948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010263	TAT	2	6	222014	222019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010263	CAA	2	6	222085	222090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_010263	AAT	2	6	222102	222107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010263	CTA	2	6	222132	222137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_010263	TAT	2	6	222143	222148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010263	ATT	2	6	225226	225231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_010263	TA	3	6	225262	225267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_010263	TA	3	6	225307	225312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010263	T	6	6	225316	225321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010263	A	6	6	225325	225330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010263	T	6	6	225338	225343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010263	TAC	2	6	225372	225377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010263	TAATA	2	10	225482	225491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_010263	TA	3	6	225495	225500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010263	A	6	6	225565	225570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010263	AAG	2	6	225995	226000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010263	TAA	2	6	226018	226023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_010263	AAT	2	6	226078	226083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010263	CTT	2	6	226114	226119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_010263	ACA	2	6	226982	226987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_010263	AT	3	6	226990	226995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_010263	T	8	8	227007	227014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010263	ATTTA	2	10	227068	227077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_010263	GTA	2	6	227108	227113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010263	TA	3	6	227112	227117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010263	TAAAT	2	10	227137	227146	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010263	TAT	2	6	228509	228514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010263	T	7	7	228809	228815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010263	AGT	2	6	228825	228830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010263	ATA	2	6	228831	228836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010263	TTAA	2	8	228865	228872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010263	A	6	6	228895	228900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010263	CACTAC	2	12	228942	228953	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_010263	AAGT	2	8	228980	228987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010263	T	8	8	229000	229007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010263	TTC	2	6	229028	229033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_010263	GCT	2	6	229052	229057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_010263	T	6	6	229128	229133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010263	TCT	2	6	229147	229152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_010263	AATG	2	8	229179	229186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010263	GA	3	6	229502	229507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010263	TTCA	2	8	229834	229841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_010263	TAC	2	6	229862	229867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_010263	CT	3	6	229942	229947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_010263	ATA	2	6	229958	229963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010263	AGCT	2	8	229970	229977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_010263	TCT	2	6	229987	229992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010263	AGA	2	6	229996	230001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010263	ATTT	2	8	230126	230133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010263	T	6	6	230131	230136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010263	ATA	2	6	230389	230394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_010263	T	6	6	230473	230478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_010263	A	6	6	230510	230515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010263	T	6	6	230600	230605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010263	T	6	6	230612	230617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_010263	ATCC	2	8	230717	230724	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_010263	TTTC	2	8	230797	230804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_010263	TCT	2	6	230889	230894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010263	TA	3	6	230917	230922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010263	ATT	2	6	230930	230935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010263	A	6	6	230956	230961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010263	AGA	2	6	231080	231085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_010263	T	6	6	231132	231137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_010263	TAA	2	6	231147	231152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010263	A	7	7	231183	231189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010263	A	6	6	231206	231211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010263	ATT	2	6	232442	232447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010263	ATT	2	6	232469	232474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010263	A	6	6	233197	233202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010263	TCTGTC	2	12	233295	233306	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_010263	A	6	6	233349	233354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010263	TAT	2	6	233376	233381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010263	T	6	6	233381	233386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010263	TGT	2	6	233416	233421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010263	TAA	2	6	233458	233463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010263	AT	3	6	233478	233483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010263	CTT	2	6	233560	233565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_010263	GCA	2	6	233583	233588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_010263	T	7	7	233803	233809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_010263	T	6	6	233818	233823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010263	ATT	3	9	233841	233849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_010263	TTTC	2	8	233914	233921	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_010263	ATTGT	2	10	233943	233952	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_010263	T	6	6	233980	233985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_010263	TCC	2	6	233998	234003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_010263	CAT	2	6	234007	234012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_010263	ATT	2	6	234020	234025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_010263	ATG	2	6	234048	234053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_010263	AAT	2	6	234055	234060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_010263	CTT	2	6	234064	234069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_010263	TCT	2	6	234109	234114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_010263	TTAG	2	8	234340	234347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_010263	TACT	2	8	235560	235567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1147	NC_010263	TAT	2	6	236442	236447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1150	NC_010263	ATT	2	6	240636	240641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_010263	GTT	2	6	240656	240661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_010263	TTC	2	6	240713	240718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_010263	TTA	2	6	240765	240770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_010263	TAT	2	6	242270	242275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1158	NC_010263	T	7	7	244999	245005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1159	NC_010263	ATA	2	6	245211	245216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1161	NC_010263	GAC	2	6	246501	246506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1163	NC_010263	TAT	2	6	248424	248429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_010263	TTTGA	2	10	248434	248443	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_010263	AT	3	6	249997	250002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_010263	TGT	2	6	250017	250022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1167	NC_010263	TTA	2	6	250024	250029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1170	NC_010263	TTG	2	6	250156	250161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1171	NC_010263	ATAC	2	8	250167	250174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1172	NC_010263	ATA	2	6	250223	250228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1173	NC_010263	A	6	6	250287	250292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1174	NC_010263	CAC	2	6	250304	250309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1176	NC_010263	A	6	6	250401	250406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1177	NC_010263	T	7	7	250411	250417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1178	NC_010263	T	6	6	250421	250426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1179	NC_010263	A	6	6	250429	250434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1184	NC_010263	CTT	2	6	250518	250523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1186	NC_010263	ATA	2	6	250588	250593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1187	NC_010263	ATG	2	6	250606	250611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1198	NC_010263	TAA	2	6	251542	251547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1232	NC_010263	ATT	2	6	255289	255294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1242	NC_010263	CTACA	2	10	257637	257646	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1260	NC_010263	AGA	2	6	258362	258367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1266	NC_010263	AAGA	2	8	258637	258644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_010263	TTA	2	6	258924	258929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_010263	T	7	7	259435	259441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_010263	CGC	2	6	259666	259671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1273	NC_010263	TAA	3	9	259687	259695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_010263	A	6	6	259771	259776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_010263	TGT	2	6	259777	259782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1412	NC_010263	T	6	6	267053	267058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_010263	GCT	2	6	267081	267086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1414	NC_010263	ATA	2	6	267138	267143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_010263	T	6	6	269621	269626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1417	NC_010263	TA	4	8	270020	270027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1426	NC_010263	A	7	7	275150	275156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1433	NC_010263	TC	3	6	275679	275684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1451	NC_010263	AT	3	6	277150	277155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_010263	TGA	2	6	277161	277166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1472	NC_010263	GTC	2	6	278158	278163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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