MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 7675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010263	TTAAA	2	10	87093	87102	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010263	GCT	2	6	87116	87121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010263	TAGC	2	8	87147	87154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_010263	GAA	2	6	87161	87166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010263	TAA	2	6	87402	87407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010263	CAA	2	6	87409	87414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_010263	ATA	2	6	87484	87489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010263	CAA	2	6	87762	87767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010263	TGC	2	6	87950	87955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010263	TAA	2	6	87981	87986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010263	TA	3	6	88375	88380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010263	TGT	2	6	88410	88415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010263	ATA	2	6	88471	88476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010263	CAA	2	6	88532	88537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010263	TGC	2	6	89740	89745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_010263	TCC	2	6	89766	89771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_010263	TTA	2	6	89772	89777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010263	TAA	2	6	89812	89817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010263	TAA	2	6	89822	89827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010263	AGG	2	6	91583	91588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010263	TAT	2	6	91714	91719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010263	TTTTAA	2	12	92464	92475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010263	T	7	7	92495	92501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010263	CAA	2	6	92542	92547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_010263	TAAA	2	8	92554	92561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010263	AGG	2	6	94795	94800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010263	A	6	6	94882	94887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010263	TGC	2	6	94894	94899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_010263	ATA	2	6	95116	95121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010263	AT	3	6	95128	95133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010263	AT	3	6	95146	95151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010263	AT	3	6	95167	95172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010263	TAAAAA	2	12	95196	95207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010263	AT	3	6	95214	95219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010263	TTTA	2	8	95223	95230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010263	AAAT	2	8	95247	95254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010263	AGA	2	6	95353	95358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010263	ATT	2	6	95368	95373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010263	ACG	2	6	95377	95382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_010263	A	8	8	95409	95416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_010263	TAA	2	6	95419	95424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010263	AATT	2	8	95470	95477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_010263	TAA	2	6	96806	96811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010263	TAA	2	6	96819	96824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010263	TAAA	2	8	96828	96835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010263	TAA	2	6	96866	96871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010263	TAATA	2	10	96889	96898	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010263	A	6	6	96920	96925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010263	TAA	2	6	96939	96944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010263	AT	3	6	96956	96961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010263	TGT	2	6	96964	96969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010263	ATT	2	6	96970	96975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010263	ATT	2	6	96985	96990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010263	TTGTA	2	10	97027	97036	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010263	AAT	2	6	97037	97042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010263	ATTA	2	8	97065	97072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010263	T	6	6	97656	97661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010263	ATT	2	6	98171	98176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010263	CATTT	2	10	98182	98191	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
560	NC_010263	TAT	2	6	98267	98272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010263	AATG	2	8	98274	98281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010263	A	6	6	98297	98302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_010263	AAT	2	6	98319	98324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010263	AATTA	2	10	98332	98341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010263	T	7	7	100051	100057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010263	TCCA	2	8	100104	100111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_010263	AAT	2	6	100187	100192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010263	AAGC	2	8	100199	100206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_010263	T	6	6	100804	100809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_010263	ATGT	2	8	102254	102261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010263	TAT	2	6	102265	102270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010263	A	8	8	102311	102318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010263	A	7	7	102320	102326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_010263	TAT	3	9	103158	103166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_010263	TA	3	6	103181	103186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010263	ATT	2	6	103258	103263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_010263	TAC	2	6	105634	105639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010263	AAG	2	6	105666	105671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010263	T	6	6	105900	105905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_010263	AAT	2	6	105974	105979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010263	CTA	2	6	105984	105989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_010263	TAG	2	6	106047	106052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010263	CAC	3	9	106053	106061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_010263	TAT	2	6	106139	106144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_010263	TAT	2	6	106147	106152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010263	TTTAT	2	10	106154	106163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_010263	ATA	2	6	106179	106184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_010263	ATT	2	6	106224	106229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_010263	TTA	2	6	106230	106235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010263	TC	3	6	106562	106567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_010263	AT	4	8	106771	106778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010263	AAT	2	6	106810	106815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010263	A	6	6	106848	106853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010263	T	6	6	106874	106879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010263	TTA	2	6	106887	106892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010263	TAG	2	6	106893	106898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010263	T	6	6	106974	106979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010263	T	6	6	106990	106995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010263	AAAG	2	8	107027	107034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010263	TAT	2	6	107059	107064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010263	TAATA	2	10	107068	107077	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010263	TAA	3	9	107085	107093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010263	CTA	2	6	107115	107120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_010263	T	6	6	107126	107131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010263	TA	3	6	107151	107156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010263	ATTT	2	8	107178	107185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010263	AAT	2	6	107196	107201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010263	TTTA	2	8	107219	107226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010263	T	6	6	107325	107330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010263	TAA	2	6	107372	107377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010263	TTA	2	6	113083	113088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010263	T	6	6	113089	113094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010263	AAT	2	6	113111	113116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010263	ATTA	2	8	113143	113150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010263	T	6	6	113173	113178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010263	AT	3	6	113195	113200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_010263	T	6	6	113232	113237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010263	GAAA	2	8	113264	113271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010263	TA	3	6	114706	114711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010263	TCA	2	6	114729	114734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010263	TGA	2	6	114777	114782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010263	GCT	2	6	114802	114807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_010263	A	6	6	114836	114841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_010263	AT	3	6	114854	114859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010263	GTT	2	6	115811	115816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_010263	TGGAT	2	10	115820	115829	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010263	ATT	2	6	115883	115888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_010263	TTC	2	6	115954	115959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010263	TAA	2	6	115983	115988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010263	GTT	2	6	117001	117006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010263	T	6	6	117320	117325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010263	TAA	2	6	117332	117337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010263	A	7	7	117802	117808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_010263	GTC	2	6	117881	117886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_010263	CTA	2	6	117943	117948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_010263	GTT	2	6	117957	117962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_010263	AGT	2	6	118323	118328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010263	TAT	2	6	118332	118337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_010263	T	7	7	120496	120502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_010263	AAGT	2	8	120552	120559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
641	NC_010263	GCT	2	6	120607	120612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_010263	ATG	2	6	120617	120622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_010263	TA	3	6	121882	121887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_010263	TCC	2	6	122083	122088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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662	NC_010263	TAA	2	6	125132	125137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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