MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 7675

< Previous12345678910111213141516Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_010263	AAT	2	6	1242605	1242610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_010263	TAA	2	6	1242630	1242635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_010263	A	6	6	1242649	1242654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_010263	AG	3	6	1242680	1242685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_010263	GCA	2	6	1242719	1242724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_010263	TA	3	6	1242725	1242730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_010263	AAG	2	6	1242793	1242798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_010263	TAAA	2	8	1243511	1243518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_010263	TA	3	6	1243546	1243551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_010263	TTA	2	6	1243993	1243998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_010263	CCT	2	6	1243999	1244004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7512	NC_010263	TAT	2	6	1244012	1244017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_010263	GCA	2	6	1244114	1244119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_010263	T	6	6	1244131	1244136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_010263	TTC	2	6	1244149	1244154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_010263	TTG	2	6	1244210	1244215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_010263	T	7	7	1244216	1244222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_010263	TGT	2	6	1244266	1244271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_010263	ATT	2	6	1244284	1244289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_010263	TCA	2	6	1244329	1244334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_010263	CTC	2	6	1244505	1244510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7522	NC_010263	T	6	6	1244524	1244529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_010263	ATA	2	6	1244579	1244584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_010263	A	6	6	1244598	1244603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_010263	ATT	2	6	1244632	1244637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_010263	TA	3	6	1244691	1244696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_010263	GAA	2	6	1244955	1244960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_010263	GGAGC	2	10	1245009	1245018	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7529	NC_010263	GAC	2	6	1245055	1245060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7530	NC_010263	T	6	6	1245069	1245074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_010263	TAAT	2	8	1245095	1245102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_010263	TTTATC	2	12	1245122	1245133	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7533	NC_010263	A	6	6	1247299	1247304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_010263	A	6	6	1247310	1247315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_010263	T	6	6	1247320	1247325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_010263	ATT	2	6	1247367	1247372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_010263	AGA	2	6	1247376	1247381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_010263	GAT	2	6	1247681	1247686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_010263	CCAT	2	8	1247931	1247938	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7540	NC_010263	T	6	6	1249588	1249593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_010263	TTG	2	6	1249727	1249732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_010263	AT	3	6	1251239	1251244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_010263	GAA	2	6	1251263	1251268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_010263	T	6	6	1251380	1251385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_010263	CTA	2	6	1251388	1251393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_010263	TGT	2	6	1251398	1251403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_010263	TTTA	2	8	1251485	1251492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_010263	TAT	2	6	1251518	1251523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_010263	TAT	2	6	1251539	1251544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_010263	TTC	2	6	1251563	1251568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_010263	AAT	2	6	1251569	1251574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_010263	TGT	2	6	1251579	1251584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_010263	AGA	2	6	1251597	1251602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_010263	TAT	2	6	1251655	1251660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_010263	CAA	2	6	1252378	1252383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7556	NC_010263	CTG	2	6	1252400	1252405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_010263	CAT	2	6	1252423	1252428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_010263	ATTA	2	8	1252495	1252502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_010263	TAT	2	6	1252503	1252508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_010263	TAA	2	6	1252601	1252606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_010263	T	6	6	1252668	1252673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_010263	CGC	2	6	1252692	1252697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7563	NC_010263	TATC	2	8	1252710	1252717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7564	NC_010263	GTAAT	2	10	1252763	1252772	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_010263	CAC	2	6	1252800	1252805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7566	NC_010263	TATT	2	8	1252808	1252815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_010263	ATA	2	6	1252853	1252858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_010263	ATT	2	6	1252882	1252887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_010263	GTT	2	6	1252902	1252907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_010263	TAA	2	6	1252914	1252919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_010263	AAT	2	6	1252927	1252932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_010263	AT	3	6	1252931	1252936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_010263	ATT	2	6	1252992	1252997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_010263	T	6	6	1253275	1253280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_010263	TAT	2	6	1253286	1253291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_010263	T	7	7	1253485	1253491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_010263	TAAT	2	8	1253493	1253500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_010263	TCT	2	6	1253508	1253513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7579	NC_010263	A	6	6	1253545	1253550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_010263	AGTT	2	8	1253563	1253570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_010263	TCT	2	6	1253590	1253595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7582	NC_010263	TTA	2	6	1253598	1253603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_010263	TAG	2	6	1253629	1253634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_010263	AGC	2	6	1254440	1254445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7585	NC_010263	TAA	2	6	1254474	1254479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7586	NC_010263	ATT	2	6	1254499	1254504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7587	NC_010263	AGTAA	2	10	1254539	1254548	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_010263	T	7	7	1256470	1256476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_010263	TA	3	6	1256478	1256483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7590	NC_010263	GCTT	2	8	1256496	1256503	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7591	NC_010263	GAA	2	6	1256531	1256536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_010263	CGA	2	6	1256550	1256555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7593	NC_010263	GT	3	6	1256572	1256577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_010263	TAT	2	6	1256578	1256583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_010263	GCT	2	6	1256610	1256615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7596	NC_010263	TA	3	6	1256636	1256641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_010263	TGA	2	6	1256699	1256704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_010263	AGAGA	2	10	1256760	1256769	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_010263	CA	3	6	1256884	1256889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7600	NC_010263	ATG	2	6	1256907	1256912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_010263	AC	3	6	1256916	1256921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7602	NC_010263	ATT	2	6	1257474	1257479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_010263	TTA	2	6	1257480	1257485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_010263	AG	3	6	1257553	1257558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_010263	TAAA	2	8	1259699	1259706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_010263	TTG	2	6	1259755	1259760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_010263	GTAA	2	8	1259798	1259805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_010263	CA	3	6	1259843	1259848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7609	NC_010263	GCTG	2	8	1259879	1259886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7610	NC_010263	AAT	2	6	1259918	1259923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_010263	A	6	6	1260017	1260022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_010263	A	6	6	1260041	1260046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_010263	TTAT	2	8	1260455	1260462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_010263	TAAC	2	8	1260470	1260477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7615	NC_010263	CTT	2	6	1260486	1260491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7616	NC_010263	ATTTA	2	10	1260498	1260507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_010263	AGG	2	6	1260543	1260548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_010263	A	7	7	1260561	1260567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_010263	GAA	2	6	1260586	1260591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_010263	AATT	2	8	1260618	1260625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_010263	GAA	2	6	1260683	1260688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_010263	AAAAGA	2	12	1260691	1260702	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_010263	ACA	2	6	1261195	1261200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7624	NC_010263	AGA	2	6	1261201	1261206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_010263	ATA	4	12	1261323	1261334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7626	NC_010263	TAT	2	6	1261373	1261378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_010263	TAA	2	6	1261940	1261945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_010263	T	6	6	1264075	1264080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_010263	GT	3	6	1264115	1264120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_010263	T	7	7	1264163	1264169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7631	NC_010263	AT	3	6	1264206	1264211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7632	NC_010263	A	6	6	1264224	1264229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7633	NC_010263	T	6	6	1264265	1264270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7634	NC_010263	AAT	2	6	1264292	1264297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7635	NC_010263	T	6	6	1264314	1264319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7636	NC_010263	TCC	2	6	1264365	1264370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7637	NC_010263	TTC	2	6	1264392	1264397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7638	NC_010263	ATT	2	6	1264410	1264415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7639	NC_010263	CTA	2	6	1264421	1264426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7640	NC_010263	AATT	2	8	1264462	1264469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7641	NC_010263	TTCA	2	8	1264474	1264481	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7642	NC_010263	TGA	2	6	1264555	1264560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7643	NC_010263	ATA	2	6	1264561	1264566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7644	NC_010263	ATTC	2	8	1264583	1264590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7645	NC_010263	ATTT	2	8	1264628	1264635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7646	NC_010263	CAT	2	6	1264650	1264655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7647	NC_010263	GTT	2	6	1264658	1264663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7648	NC_010263	TA	3	6	1264852	1264857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7649	NC_010263	T	7	7	1264858	1264864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7650	NC_010263	T	6	6	1264914	1264919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7651	NC_010263	TTC	2	6	1264944	1264949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7652	NC_010263	ACT	2	6	1264964	1264969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7653	NC_010263	CTA	2	6	1264984	1264989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7654	NC_010263	ACT	2	6	1264995	1265000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7655	NC_010263	ACC	2	6	1265005	1265010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7656	NC_010263	TAAT	2	8	1265129	1265136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7657	NC_010263	CCAA	2	8	1265154	1265161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7658	NC_010263	TTA	2	6	1265241	1265246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7659	NC_010263	TA	3	6	1265265	1265270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7660	NC_010263	ATTA	2	8	1266677	1266684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7661	NC_010263	ATAGA	2	10	1266695	1266704	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7662	NC_010263	T	6	6	1266735	1266740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7663	NC_010263	ATA	2	6	1267815	1267820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7664	NC_010263	AT	3	6	1267822	1267827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7665	NC_010263	TTA	2	6	1267828	1267833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7666	NC_010263	TGT	2	6	1267836	1267841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7667	NC_010263	TA	3	6	1267843	1267848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7668	NC_010263	CAA	2	6	1267888	1267893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7669	NC_010263	ATT	3	9	1267934	1267942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7670	NC_010263	T	6	6	1268016	1268021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7671	NC_010263	TATT	2	8	1268062	1268069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7672	NC_010263	TAA	2	6	1268100	1268105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7673	NC_010263	ATA	2	6	1268144	1268149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7674	NC_010263	TTA	2	6	1268152	1268157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7675	NC_010263	A	6	6	1268157	1268162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12345678910111213141516Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.