MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 5135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010168	GCT	2	6	1030367	1030372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_010168	TAGAA	2	10	1032106	1032115	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_010168	CAG	2	6	1033274	1033279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_010168	CGG	2	6	1036728	1036733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_010168	TAA	2	6	1039510	1039515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_010168	CAC	2	6	1041864	1041869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_010168	ACG	2	6	1041884	1041889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_010168	GTG	2	6	1041905	1041910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_010168	GTT	2	6	1042527	1042532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_010168	CAC	2	6	1042557	1042562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_010168	GTG	2	6	1042598	1042603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_010168	T	6	6	1042609	1042614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_010168	GTA	2	6	1043469	1043474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_010168	TTC	2	6	1045295	1045300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_010168	ATT	2	6	1045336	1045341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_010168	GTGAGT	2	12	1045425	1045436	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_010168	GGC	2	6	1053066	1053071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_010168	CGG	2	6	1054268	1054273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_010168	GCG	2	6	1054299	1054304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_010168	GTC	2	6	1054306	1054311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_010168	GGCTG	2	10	1060157	1060166	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2022	NC_010168	CCG	2	6	1060208	1060213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2023	NC_010168	CAG	2	6	1060269	1060274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_010168	TTG	2	6	1060298	1060303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_010168	CCA	2	6	1060357	1060362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2026	NC_010168	AAAG	2	8	1061638	1061645	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2030	NC_010168	AGA	2	6	1065094	1065099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_010168	GCG	2	6	1065162	1065167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_010168	CG	3	6	1065500	1065505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2033	NC_010168	GC	3	6	1066227	1066232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2034	NC_010168	CAG	2	6	1069892	1069897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_010168	GGCA	2	8	1070444	1070451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2036	NC_010168	ACG	2	6	1070457	1070462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_010168	GC	3	6	1070911	1070916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2038	NC_010168	GTT	2	6	1070925	1070930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2040	NC_010168	TCA	3	9	1070980	1070988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2042	NC_010168	CGG	2	6	1071082	1071087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_010168	AGC	2	6	1071111	1071116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2056	NC_010168	CTG	2	6	1078337	1078342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_010168	GTAG	2	8	1078347	1078354	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_010168	CTA	2	6	1080524	1080529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2059	NC_010168	GCCGC	2	10	1080545	1080554	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2060	NC_010168	CGC	2	6	1080624	1080629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2061	NC_010168	GAC	2	6	1080640	1080645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_010168	GCCGA	2	10	1082839	1082848	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2063	NC_010168	ACA	2	6	1082854	1082859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_010168	GC	4	8	1082884	1082891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2065	NC_010168	CGG	2	6	1084616	1084621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2074	NC_010168	GAGG	2	8	1088265	1088272	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2082	NC_010168	T	8	8	1101037	1101044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2087	NC_010168	GA	3	6	1101423	1101428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2088	NC_010168	AG	3	6	1101543	1101548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2092	NC_010168	AC	3	6	1102973	1102978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2093	NC_010168	TGC	2	6	1103983	1103988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2096	NC_010168	GCG	2	6	1104793	1104798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NC_010168	TG	3	6	1104816	1104821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_010168	TTCT	2	8	1104855	1104862	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2099	NC_010168	ATG	2	6	1104882	1104887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2101	NC_010168	GTT	2	6	1104913	1104918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_010168	TTG	3	9	1104932	1104940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_010168	GCA	2	6	1104951	1104956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2106	NC_010168	AAC	2	6	1105149	1105154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2107	NC_010168	AGT	2	6	1105267	1105272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_010168	GT	3	6	1105289	1105294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_010168	TCT	2	6	1105354	1105359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2110	NC_010168	TGC	2	6	1105386	1105391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2112	NC_010168	GTG	2	6	1105478	1105483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_010168	GTA	2	6	1105535	1105540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2114	NC_010168	TGCCG	2	10	1105561	1105570	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2115	NC_010168	CA	3	6	1109834	1109839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2116	NC_010168	CGT	2	6	1110722	1110727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2121	NC_010168	CAA	2	6	1113698	1113703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2122	NC_010168	CGGTA	2	10	1113719	1113728	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2123	NC_010168	ACGC	2	8	1113766	1113773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2124	NC_010168	CGG	2	6	1115885	1115890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_010168	CAA	2	6	1117572	1117577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2126	NC_010168	CTGG	2	8	1117588	1117595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2127	NC_010168	TCG	2	6	1117621	1117626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_010168	GCC	2	6	1121240	1121245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2129	NC_010168	GCT	2	6	1123911	1123916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_010168	CAGA	2	8	1123922	1123929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2131	NC_010168	ATC	2	6	1137189	1137194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_010168	CG	3	6	1140844	1140849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2133	NC_010168	TGG	2	6	1140881	1140886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2134	NC_010168	GGC	2	6	1140903	1140908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2135	NC_010168	ATT	2	6	1140942	1140947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2136	NC_010168	AAAGG	2	10	1140987	1140996	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_010168	ACA	2	6	1142108	1142113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2138	NC_010168	CAG	2	6	1142154	1142159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2139	NC_010168	CAC	2	6	1142169	1142174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2140	NC_010168	TGT	2	6	1142179	1142184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2141	NC_010168	GT	3	6	1142412	1142417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2142	NC_010168	AC	3	6	1142981	1142986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2143	NC_010168	TGC	2	6	1143006	1143011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2144	NC_010168	ATC	2	6	1143072	1143077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2145	NC_010168	GAG	2	6	1143121	1143126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2147	NC_010168	TCG	2	6	1147574	1147579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2148	NC_010168	AGGCA	2	10	1147586	1147595	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2149	NC_010168	CAA	2	6	1148758	1148763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2150	NC_010168	GT	3	6	1148810	1148815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2151	NC_010168	AGC	2	6	1150991	1150996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2152	NC_010168	ACT	2	6	1151012	1151017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2154	NC_010168	GCT	2	6	1155378	1155383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2162	NC_010168	CGC	2	6	1161661	1161666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2165	NC_010168	AGC	2	6	1161806	1161811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2169	NC_010168	AGC	2	6	1163086	1163091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2171	NC_010168	AG	3	6	1163144	1163149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2172	NC_010168	GTT	2	6	1163162	1163167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2173	NC_010168	C	6	6	1163305	1163310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2174	NC_010168	TCC	2	6	1164585	1164590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2175	NC_010168	AGA	2	6	1164860	1164865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2177	NC_010168	TTCG	2	8	1164920	1164927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2184	NC_010168	CTG	2	6	1167998	1168003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2192	NC_010168	GGC	2	6	1170805	1170810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2203	NC_010168	T	6	6	1177261	1177266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2227	NC_010168	TACGT	2	10	1188004	1188013	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2230	NC_010168	GCTT	2	8	1193798	1193805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2231	NC_010168	CAT	2	6	1193812	1193817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2238	NC_010168	ACG	2	6	1197665	1197670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2239	NC_010168	CTG	2	6	1200131	1200136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2240	NC_010168	ATG	2	6	1200146	1200151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2242	NC_010168	ACC	2	6	1201679	1201684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2243	NC_010168	CTG	2	6	1202361	1202366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2244	NC_010168	TGCC	2	8	1202425	1202432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2245	NC_010168	GGCT	2	8	1202563	1202570	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2246	NC_010168	AATG	2	8	1202599	1202606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2247	NC_010168	GCC	2	6	1202610	1202615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2248	NC_010168	TAT	2	6	1203220	1203225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2249	NC_010168	TA	3	6	1203239	1203244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2250	NC_010168	CAC	2	6	1203255	1203260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2251	NC_010168	GTG	2	6	1203296	1203301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_010168	G	16	16	1203341	1203356	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2253	NC_010168	A	6	6	1208222	1208227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2254	NC_010168	CAGA	2	8	1208243	1208250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2255	NC_010168	TGA	2	6	1208934	1208939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2256	NC_010168	ACC	2	6	1209590	1209595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2257	NC_010168	A	7	7	1209681	1209687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2258	NC_010168	TGA	2	6	1212626	1212631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2259	NC_010168	TTCC	2	8	1215662	1215669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2260	NC_010168	GCA	2	6	1218840	1218845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2261	NC_010168	ACC	2	6	1222279	1222284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2262	NC_010168	TTG	2	6	1222330	1222335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2263	NC_010168	GTT	2	6	1222374	1222379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2264	NC_010168	CAC	2	6	1222381	1222386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2265	NC_010168	GAG	2	6	1224691	1224696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2266	NC_010168	CCT	2	6	1224739	1224744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2267	NC_010168	T	6	6	1224751	1224756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2268	NC_010168	CTG	2	6	1229373	1229378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2269	NC_010168	TTC	2	6	1230340	1230345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2270	NC_010168	AAGCT	2	10	1230387	1230396	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2272	NC_010168	AG	3	6	1234304	1234309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2273	NC_010168	T	7	7	1235122	1235128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2274	NC_010168	GAA	2	6	1235135	1235140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2277	NC_010168	GAG	2	6	1236904	1236909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2278	NC_010168	GCT	2	6	1238571	1238576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2280	NC_010168	CAG	2	6	1238603	1238608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2281	NC_010168	GCC	2	6	1238619	1238624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2282	NC_010168	T	7	7	1239571	1239577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2283	NC_010168	TC	3	6	1242009	1242014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2284	NC_010168	TTTTG	2	10	1242461	1242470	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2292	NC_010168	ACA	2	6	1252962	1252967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2295	NC_010168	CAC	2	6	1254773	1254778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2377	NC_010168	TGT	2	6	1320457	1320462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2380	NC_010168	AGC	2	6	1322510	1322515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2383	NC_010168	GCA	2	6	1322618	1322623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2384	NC_010168	GTT	2	6	1322632	1322637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2386	NC_010168	GCTT	2	8	1325074	1325081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2387	NC_010168	CGT	2	6	1325120	1325125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2388	NC_010168	ATT	2	6	1326124	1326129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2390	NC_010168	GCT	2	6	1329351	1329356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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