MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 5135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010168	GTT	2	6	517454	517459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010168	TCT	2	6	518502	518507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010168	AGG	2	6	518557	518562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010168	TTG	2	6	521954	521959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010168	GTG	2	6	521960	521965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010168	CGC	2	6	522174	522179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_010168	CTG	2	6	522233	522238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_010168	CTCGG	2	10	522239	522248	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1009	NC_010168	CTC	2	6	522264	522269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_010168	TCT	2	6	523381	523386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_010168	GCC	2	6	523444	523449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_010168	TTCTA	2	10	524880	524889	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_010168	CCAA	2	8	524898	524905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_010168	TGG	2	6	524937	524942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010168	AG	3	6	525345	525350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010168	TGA	2	6	525360	525365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010168	GT	3	6	525397	525402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010168	T	7	7	527542	527548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010168	AGAA	2	8	527568	527575	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010168	CCA	2	6	527661	527666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_010168	GGA	2	6	527710	527715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_010168	TTGATC	2	12	527767	527778	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1023	NC_010168	TTG	2	6	527816	527821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010168	CTC	2	6	527829	527834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_010168	GAT	2	6	527889	527894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010168	GAA	2	6	529756	529761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010168	AAC	2	6	531167	531172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_010168	GCA	2	6	532910	532915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_010168	TCAA	2	8	532963	532970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_010168	TAA	2	6	533294	533299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_010168	CCG	2	6	533320	533325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_010168	CA	3	6	533333	533338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_010168	CAA	2	6	533344	533349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_010168	GGCG	2	8	534546	534553	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_010168	T	6	6	535381	535386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010168	GCT	2	6	535739	535744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_010168	GGA	2	6	535757	535762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010168	ATT	2	6	535773	535778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010168	ATC	2	6	538516	538521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_010168	TC	3	6	538520	538525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_010168	CTGC	2	8	538531	538538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_010168	AGA	2	6	541304	541309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010168	TCT	2	6	541314	541319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_010168	TGT	2	6	541331	541336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010168	CTCA	2	8	543990	543997	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_010168	ACA	2	6	544070	544075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010168	TCA	2	6	544076	544081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_010168	CCA	2	6	545793	545798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_010168	GCAA	2	8	546162	546169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_010168	TGTGC	2	10	546172	546181	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1051	NC_010168	C	6	6	546200	546205	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1052	NC_010168	CAA	2	6	551545	551550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_010168	TGC	2	6	551577	551582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_010168	GT	3	6	553295	553300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010168	TGA	2	6	553327	553332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010168	GAC	2	6	553428	553433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_010168	CAC	2	6	553446	553451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_010168	GT	3	6	554312	554317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010168	GTCGA	2	10	554732	554741	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_010168	ACC	2	6	554773	554778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_010168	TAC	2	6	554789	554794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_010168	AC	3	6	555629	555634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_010168	CAA	2	6	555645	555650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_010168	TCG	2	6	555748	555753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_010168	AGT	2	6	558113	558118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010168	CCGC	2	8	558133	558140	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1067	NC_010168	GGC	2	6	558180	558185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_010168	CTG	2	6	558559	558564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_010168	AAGG	2	8	558580	558587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010168	CAG	2	6	558596	558601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_010168	GTAT	2	8	562095	562102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010168	GCTG	2	8	562103	562110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_010168	GT	3	6	562146	562151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010168	CTACG	2	10	565061	565070	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1075	NC_010168	CGAG	2	8	565154	565161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_010168	CAA	2	6	566864	566869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_010168	GCG	2	6	566906	566911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_010168	TCG	2	6	570489	570494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_010168	TCGC	2	8	570626	570633	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_010168	GC	3	6	572023	572028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_010168	CTA	2	6	572063	572068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_010168	TTG	2	6	572074	572079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010168	GCCG	2	8	577020	577027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_010168	TGC	2	6	577031	577036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_010168	CGT	2	6	577037	577042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_010168	GC	3	6	577054	577059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_010168	GAA	2	6	577074	577079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010168	ATT	2	6	581471	581476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010168	GC	3	6	581557	581562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_010168	TCA	2	6	581623	581628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_010168	GCC	2	6	581727	581732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_010168	GGCT	2	8	581777	581784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_010168	GGCA	2	8	581834	581841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_010168	T	6	6	581877	581882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010168	CAG	3	9	582110	582118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_010168	CGC	2	6	582137	582142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_010168	TAG	2	6	582166	582171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010168	GCC	2	6	582225	582230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_010168	TGT	2	6	583133	583138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010168	AGC	2	6	583150	583155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010168	GCTA	2	8	583168	583175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_010168	CCG	2	6	583281	583286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_010168	TGG	2	6	587211	587216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010168	GGC	2	6	587250	587255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_010168	GGA	2	6	587740	587745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_010168	CATC	2	8	587809	587816	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_010168	GCT	2	6	590558	590563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_010168	GCATT	2	10	590634	590643	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1109	NC_010168	TAC	2	6	591287	591292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_010168	A	6	6	591314	591319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010168	ATTA	2	8	591336	591343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_010168	GCG	2	6	591539	591544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_010168	GC	3	6	591601	591606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_010168	CGG	2	6	591621	591626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_010168	CGGC	2	8	592134	592141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_010168	AGGTG	2	10	592198	592207	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_010168	AG	3	6	592223	592228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010168	AC	3	6	592260	592265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_010168	CTC	2	6	595890	595895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_010168	GAA	2	6	596928	596933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010168	CGACG	2	10	596958	596967	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1122	NC_010168	GATC	2	8	596979	596986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_010168	CG	3	6	597024	597029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_010168	GCC	2	6	598727	598732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_010168	AGC	2	6	598778	598783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_010168	CAA	2	6	599228	599233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_010168	GTG	2	6	599844	599849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010168	CAGAA	2	10	600225	600234	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1129	NC_010168	CGA	2	6	600302	600307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_010168	AGG	2	6	601537	601542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_010168	AGC	2	6	601568	601573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_010168	TGC	2	6	601612	601617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_010168	GAC	2	6	601876	601881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_010168	TTG	2	6	603421	603426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_010168	TTG	2	6	603435	603440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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