MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 10863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009900	A	7	7	457019	457025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_009900	A	8	8	457047	457054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_009900	GAG	2	6	457564	457569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_009900	TTA	2	6	458975	458980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_009900	TTA	2	6	461406	461411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_009900	TTA	2	6	461427	461432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_009900	TTCTAA	2	12	461462	461473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3508	NC_009900	TA	3	6	461482	461487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_009900	ATA	2	6	461551	461556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_009900	CAA	2	6	461626	461631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_009900	CAT	2	6	461647	461652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_009900	T	6	6	461654	461659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_009900	CT	3	6	461726	461731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_009900	ATTT	2	8	461737	461744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_009900	TTA	2	6	461831	461836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_009900	CTA	2	6	461861	461866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_009900	ACT	2	6	461869	461874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_009900	CTT	2	6	461966	461971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_009900	T	6	6	461991	461996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_009900	AT	4	8	462009	462016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_009900	GCT	2	6	462072	462077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_009900	TA	3	6	462109	462114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_009900	CTT	2	6	462117	462122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_009900	AAT	2	6	462129	462134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_009900	CTT	2	6	462155	462160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_009900	GCA	2	6	462167	462172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3528	NC_009900	CTA	2	6	462186	462191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_009900	TAT	2	6	462204	462209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3531	NC_009900	TAA	2	6	462271	462276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_009900	TGA	2	6	462302	462307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_009900	TGC	2	6	462429	462434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3535	NC_009900	TTAA	2	8	462448	462455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3538	NC_009900	AAT	2	6	462547	462552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_009900	ATT	2	6	462562	462567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_009900	CAA	2	6	462638	462643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_009900	TAA	2	6	462679	462684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_009900	ATTA	2	8	463312	463319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_009900	TGATA	2	10	463326	463335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_009900	TA	3	6	463334	463339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_009900	ATT	3	9	463346	463354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_009900	AAT	2	6	463357	463362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3549	NC_009900	A	7	7	464361	464367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_009900	TA	3	6	464392	464397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_009900	T	7	7	464398	464404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_009900	AAAG	2	8	464436	464443	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3554	NC_009900	GTT	2	6	464464	464469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3556	NC_009900	AATA	2	8	464517	464524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3558	NC_009900	TAA	2	6	464583	464588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_009900	ATC	2	6	464609	464614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3561	NC_009900	ATT	2	6	464637	464642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_009900	TA	4	8	464655	464662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_009900	T	6	6	464665	464670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_009900	AAT	2	6	464671	464676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_009900	AAT	2	6	464679	464684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_009900	GAG	2	6	466769	466774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_009900	TTG	2	6	466775	466780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3570	NC_009900	T	7	7	466872	466878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_009900	A	8	8	466892	466899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_009900	AT	3	6	467321	467326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3598	NC_009900	ATT	2	6	478545	478550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_009900	TTG	2	6	478620	478625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3601	NC_009900	CAT	2	6	478754	478759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3603	NC_009900	GT	3	6	478814	478819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_009900	T	6	6	478823	478828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_009900	TAA	2	6	478833	478838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_009900	TTA	2	6	478843	478848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3608	NC_009900	TTA	2	6	478880	478885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_009900	AATA	2	8	478929	478936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_009900	AT	3	6	479561	479566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3612	NC_009900	ATATA	2	10	479634	479643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_009900	ATA	2	6	479683	479688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_009900	TGCAA	2	10	479716	479725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3620	NC_009900	TAA	2	6	479983	479988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3623	NC_009900	T	6	6	480050	480055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_009900	ATA	2	6	480169	480174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3627	NC_009900	AAT	2	6	480222	480227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3633	NC_009900	ATT	2	6	480410	480415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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