MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 10863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009900	AAT	2	6	102319	102324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009900	AAGC	2	8	102331	102338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_009900	T	6	6	102936	102941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_009900	AAG	2	6	102952	102957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009900	A	7	7	104443	104449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009900	A	7	7	104451	104457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009900	CAA	2	6	104509	104514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_009900	TAT	3	9	105289	105297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009900	TA	3	6	105312	105317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_009900	ATT	2	6	105389	105394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_009900	T	6	6	108029	108034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009900	TAA	2	6	108072	108077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009900	AAT	2	6	108103	108108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009900	CTA	2	6	108113	108118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_009900	TAG	2	6	108176	108181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009900	CAC	3	9	108182	108190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_009900	GAA	2	6	108225	108230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009900	TAT	2	6	108268	108273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009900	TAT	2	6	108276	108281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009900	TTTAT	2	10	108283	108292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009900	ATA	2	6	108308	108313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009900	ATT	2	6	108353	108358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009900	TTA	2	6	108359	108364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009900	TC	3	6	108691	108696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_009900	TTG	2	6	108717	108722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009900	AAC	2	6	108838	108843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_009900	AT	4	8	108900	108907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009900	AAT	2	6	108939	108944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009900	A	6	6	108977	108982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009900	T	6	6	109003	109008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009900	TTA	2	6	109016	109021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009900	AT	3	6	109037	109042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009900	T	6	6	109104	109109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009900	T	6	6	109120	109125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_009900	AAAG	2	8	109157	109164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009900	TAT	2	6	109189	109194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_009900	TAATA	2	10	109198	109207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009900	TAA	3	9	109215	109223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009900	CTA	2	6	109245	109250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009900	ACA	2	6	109266	109271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_009900	AT	3	6	109303	109308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009900	T	6	6	109310	109315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009900	TA	3	6	109335	109340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009900	TTG	2	6	109348	109353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009900	AAT	2	6	109380	109385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009900	TTTA	2	8	109403	109410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009900	TTTA	2	8	109442	109449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009900	T	6	6	109509	109514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009900	TAA	2	6	109557	109562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009900	TTA	2	6	115064	115069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009900	T	7	7	115070	115076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009900	TA	3	6	115095	115100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009900	ATTA	2	8	115124	115131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009900	AT	3	6	115176	115181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009900	T	6	6	115213	115218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009900	AGT	2	6	115223	115228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_009900	TAC	2	6	115236	115241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_009900	GAAA	2	8	115246	115253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009900	TAAA	2	8	115271	115278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_009900	TA	3	6	116686	116691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009900	GTC	2	6	116708	116713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_009900	AT	3	6	116725	116730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009900	TAA	2	6	116732	116737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_009900	TGA	2	6	116762	116767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009900	GCT	2	6	116787	116792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_009900	A	6	6	116821	116826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009900	AT	3	6	116839	116844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009900	GTT	2	6	117794	117799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009900	TTC	2	6	117927	117932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_009900	ATA	2	6	117954	117959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009900	GTT	2	6	118973	118978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009900	AAC	2	6	119042	119047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_009900	T	7	7	119105	119111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_009900	CAA	2	6	119119	119124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_009900	CTCA	2	8	119175	119182	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_009900	CAAA	2	8	119196	119203	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_009900	TC	3	6	119249	119254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_009900	CTAT	2	8	119268	119275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_009900	TAA	2	6	119276	119281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_009900	T	6	6	119293	119298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009900	TAA	2	6	119313	119318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009900	TAA	2	6	119335	119340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009900	AAT	3	9	119354	119362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_009900	TAT	2	6	119363	119368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_009900	TGC	2	6	119414	119419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_009900	ATG	2	6	119466	119471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_009900	TTA	2	6	119487	119492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_009900	TAG	2	6	119601	119606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009900	TA	3	6	119639	119644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009900	CTC	2	6	119739	119744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_009900	A	7	7	119778	119784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009900	GGTA	2	8	119787	119794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009900	GTC	2	6	119857	119862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_009900	CTA	2	6	119918	119923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_009900	GTT	2	6	119932	119937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009900	TAC	2	6	120075	120080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_009900	AGA	2	6	120081	120086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009900	T	6	6	120162	120167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009900	AGT	2	6	120297	120302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009900	TAT	2	6	120382	120387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009900	AAGT	2	8	122533	122540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009900	GCT	2	6	122588	122593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_009900	AAAT	2	8	123881	123888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009900	CTAC	2	8	124401	124408	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_009900	ATT	3	9	124464	124472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009900	TAT	2	6	124501	124506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_009900	AGTA	2	8	124509	124516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009900	TTA	2	6	126999	127004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009900	CAA	2	6	127062	127067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_009900	CGCT	2	8	127072	127079	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_009900	ACA	2	6	127091	127096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_009900	A	7	7	129227	129233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009900	A	6	6	129236	129241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009900	T	6	6	130165	130170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009900	TCT	2	6	131329	131334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_009900	C	7	7	131378	131384	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1117	NC_009900	TAT	2	6	131442	131447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009900	ATT	3	9	131457	131465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009900	AGT	2	6	131481	131486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009900	GAT	2	6	131509	131514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_009900	ATT	2	6	131536	131541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_009900	TTA	2	6	131549	131554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_009900	AATT	2	8	131569	131576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009900	TAAT	2	8	131591	131598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009900	TGT	2	6	131608	131613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009900	TATTT	2	10	131637	131646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_009900	TAA	2	6	131675	131680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_009900	ATC	2	6	131795	131800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_009900	ATT	2	6	131867	131872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009900	T	7	7	131943	131949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_009900	TTA	2	6	131963	131968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009900	T	6	6	131986	131991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_009900	TAC	2	6	131999	132004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_009900	ATA	2	6	132030	132035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_009900	AAT	2	6	132036	132041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_009900	ATT	2	6	132058	132063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_009900	TGTT	2	8	132073	132080	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_009900	TAC	2	6	132130	132135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_009900	T	6	6	132137	132142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_009900	T	6	6	132159	132164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_009900	GCT	2	6	132173	132178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1143	NC_009900	AAT	2	6	132265	132270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1149	NC_009900	TCT	2	6	132465	132470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1156	NC_009900	TA	3	6	133547	133552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1259	NC_009900	AAT	2	6	154341	154346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_009900	AGC	2	6	154634	154639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1412	NC_009900	ATT	2	6	183281	183286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_009900	CAA	2	6	183298	183303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1414	NC_009900	AAATC	2	10	183315	183324	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1417	NC_009900	ATTTT	2	10	183420	183429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_009900	TAA	2	6	183584	183589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_009900	GAGAG	2	10	183597	183606	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1423	NC_009900	A	7	7	183621	183627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_009900	TCAG	2	8	183720	183727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1425	NC_009900	A	6	6	187882	187887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_009900	T	6	6	187892	187897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_009900	GAG	2	6	188004	188009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_009900	TGGCA	2	10	192413	192422	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1441	NC_009900	T	6	6	192594	192599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_009900	ATT	2	6	193815	193820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_009900	ATA	2	6	193956	193961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_009900	GTC	2	6	195515	195520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1448	NC_009900	TCA	2	6	195551	195556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1453	NC_009900	TA	3	6	197080	197085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_009900	TA	3	6	198931	198936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_009900	GTT	2	6	198937	198942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_009900	TTA	2	6	198948	198953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1458	NC_009900	T	8	8	199063	199070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1488	NC_009900	AT	3	6	208414	208419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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