MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 10863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009900	CAG	2	6	653055	653060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_009900	TAC	2	6	653090	653095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_009900	CAT	2	6	653137	653142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_009900	A	6	6	653144	653149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_009900	A	6	6	653232	653237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_009900	ATA	2	6	653248	653253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_009900	AAGA	2	8	653319	653326	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_009900	TA	3	6	653329	653334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_009900	TCAA	2	8	653353	653360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5010	NC_009900	A	6	6	653400	653405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_009900	CTA	2	6	653419	653424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_009900	TAGTT	2	10	653432	653441	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_009900	AAG	2	6	653446	653451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_009900	ATT	2	6	653466	653471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_009900	TGT	2	6	653486	653491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_009900	AAG	2	6	653572	653577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_009900	AAT	2	6	653661	653666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_009900	AAG	2	6	653674	653679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_009900	T	6	6	654813	654818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_009900	TGC	2	6	654836	654841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_009900	CTC	2	6	654858	654863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_009900	TCA	2	6	654931	654936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_009900	TGT	2	6	655013	655018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_009900	TTA	2	6	655155	655160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_009900	CAA	2	6	655230	655235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_009900	TGAT	2	8	655241	655248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_009900	ATT	2	6	655267	655272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_009900	TTAAT	2	10	655283	655292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_009900	AT	3	6	655302	655307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_009900	ATA	2	6	655311	655316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_009900	AAT	2	6	655328	655333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_009900	ATT	2	6	656743	656748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_009900	TTG	2	6	656782	656787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_009900	CAA	2	6	656853	656858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_009900	TCGC	2	8	656869	656876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_009900	TTG	2	6	657639	657644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_009900	GTAA	2	8	657682	657689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_009900	T	8	8	657729	657736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_009900	ATT	2	6	657738	657743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_009900	CTT	2	6	657759	657764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_009900	ATT	2	6	659967	659972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_009900	TAT	2	6	659975	659980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_009900	AGC	3	9	660016	660024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_009900	ATA	2	6	660051	660056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_009900	GCT	2	6	662470	662475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_009900	AATG	2	8	662479	662486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_009900	ATC	2	6	662490	662495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_009900	AT	3	6	663890	663895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_009900	T	6	6	665477	665482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_009900	TA	3	6	665503	665508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_009900	A	6	6	665581	665586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_009900	AAAT	2	8	665590	665597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_009900	TTTAA	2	10	665604	665613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_009900	AAT	2	6	665614	665619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_009900	TAA	2	6	665700	665705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_009900	TAAT	2	8	665741	665748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_009900	TAT	3	9	668862	668870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_009900	A	7	7	668925	668931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_009900	T	7	7	668936	668942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_009900	ATATT	2	10	669417	669426	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_009900	TAT	3	9	669433	669441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_009900	TTA	2	6	669453	669458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_009900	GTAG	2	8	669489	669496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_009900	T	6	6	669541	669546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_009900	T	6	6	669550	669555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_009900	ATT	2	6	669574	669579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_009900	ATT	2	6	669595	669600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_009900	ATT	2	6	669635	669640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_009900	ATTT	2	8	669672	669679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_009900	A	7	7	669704	669710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_009900	TAT	2	6	669724	669729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_009900	ATTA	2	8	669820	669827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_009900	TCA	2	6	670734	670739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_009900	TAAT	2	8	670764	670771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_009900	A	6	6	670830	670835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_009900	T	7	7	670857	670863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_009900	TAAA	2	8	672444	672451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_009900	TCA	2	6	672489	672494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_009900	AAT	2	6	672532	672537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_009900	T	6	6	672561	672566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_009900	CAA	2	6	672628	672633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_009900	GCTC	2	8	672635	672642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_009900	ATCT	2	8	672654	672661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_009900	CT	3	6	673370	673375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_009900	ATTTAA	2	12	673413	673424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_009900	ATTA	2	8	673444	673451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_009900	AATT	2	8	673657	673664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_009900	AAG	2	6	673712	673717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_009900	A	6	6	673719	673724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_009900	TTC	2	6	673744	673749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_009900	TGA	2	6	673774	673779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_009900	TAT	2	6	673863	673868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_009900	AT	3	6	673973	673978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_009900	ATG	2	6	674024	674029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_009900	AAGT	2	8	674097	674104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_009900	GTA	2	6	674120	674125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_009900	TGT	2	6	674870	674875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_009900	TAC	2	6	674975	674980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_009900	ATG	2	6	674992	674997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_009900	AAT	2	6	675013	675018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_009900	CA	3	6	675021	675026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_009900	CAA	2	6	675047	675052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_009900	T	6	6	676888	676893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_009900	A	6	6	676953	676958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_009900	A	6	6	676963	676968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_009900	CAA	2	6	677110	677115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_009900	A	7	7	679828	679834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_009900	TAG	2	6	679835	679840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5111	NC_009900	TTA	2	6	679892	679897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_009900	TTAAT	2	10	679904	679913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_009900	A	8	8	679943	679950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_009900	TTA	2	6	679953	679958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_009900	A	6	6	679968	679973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_009900	TAA	2	6	680015	680020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_009900	TGA	2	6	680098	680103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_009900	TA	3	6	680104	680109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_009900	TAT	2	6	680179	680184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_009900	CCA	2	6	680423	680428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_009900	ATAA	2	8	680537	680544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_009900	TAA	2	6	680632	680637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_009900	CTT	2	6	681375	681380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_009900	TG	3	6	681405	681410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_009900	GCT	2	6	681420	681425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_009900	GTAC	2	8	681447	681454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5127	NC_009900	GTGCT	2	10	681461	681470	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5128	NC_009900	AAAT	2	8	682286	682293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_009900	ACC	2	6	682949	682954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_009900	ACA	2	6	682985	682990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_009900	TCAT	2	8	683008	683015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5132	NC_009900	A	7	7	683017	683023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_009900	CAA	2	6	686980	686985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5135	NC_009900	TAA	2	6	687880	687885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_009900	AT	3	6	687886	687891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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