MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 10863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009900	CAG	2	6	605201	605206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_009900	ATT	2	6	605212	605217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_009900	ATTA	2	8	605259	605266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_009900	ATTT	2	8	605294	605301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_009900	ATG	2	6	605331	605336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_009900	TTA	2	6	605348	605353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_009900	T	6	6	605363	605368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_009900	GCT	2	6	605381	605386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_009900	TCA	2	6	605399	605404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_009900	TA	3	6	605728	605733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_009900	TAT	2	6	605744	605749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_009900	TAA	2	6	605811	605816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_009900	TGA	2	6	605819	605824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_009900	AAT	2	6	605848	605853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_009900	AGT	2	6	605857	605862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_009900	T	7	7	605885	605891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_009900	AAAC	2	8	605940	605947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_009900	ATG	2	6	605961	605966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_009900	GCT	2	6	605990	605995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_009900	TAA	2	6	606005	606010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_009900	T	8	8	606050	606057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_009900	TTA	3	9	606118	606126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_009900	AAC	2	6	606137	606142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_009900	ACTATA	2	12	606231	606242	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4525	NC_009900	ATT	2	6	606326	606331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_009900	ACTT	2	8	606336	606343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_009900	A	6	6	606391	606396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_009900	A	6	6	606401	606406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_009900	ATT	2	6	606414	606419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_009900	TATT	2	8	609252	609259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_009900	A	6	6	609266	609271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_009900	A	7	7	609292	609298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_009900	TAA	2	6	609317	609322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_009900	ATTT	2	8	609331	609338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_009900	A	6	6	609363	609368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_009900	ATT	2	6	609385	609390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_009900	ATT	2	6	609394	609399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_009900	ATG	2	6	609420	609425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_009900	CAT	2	6	609435	609440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_009900	ATT	2	6	609529	609534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_009900	CTAT	3	12	609566	609577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4542	NC_009900	TA	3	6	609621	609626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_009900	TAG	2	6	609635	609640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_009900	AAT	2	6	609718	609723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_009900	TAA	2	6	609772	609777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_009900	ATAA	2	8	609782	609789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_009900	TA	3	6	609790	609795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_009900	TAA	2	6	609825	609830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_009900	A	6	6	609829	609834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_009900	AAAT	2	8	609849	609856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_009900	ATT	2	6	609869	609874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_009900	AT	3	6	609914	609919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_009900	TTG	2	6	609933	609938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_009900	ATAA	2	8	609973	609980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_009900	AAT	2	6	609991	609996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_009900	TCA	2	6	610015	610020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4558	NC_009900	AAG	2	6	610135	610140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_009900	ATAA	2	8	610213	610220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_009900	A	6	6	610255	610260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_009900	TAAC	2	8	610267	610274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_009900	A	6	6	610306	610311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_009900	ATTC	2	8	610345	610352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_009900	AAG	2	6	610388	610393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_009900	TAT	2	6	610462	610467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_009900	T	6	6	610535	610540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_009900	ATT	2	6	610546	610551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_009900	TA	3	6	612072	612077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_009900	GAG	2	6	612082	612087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_009900	ACG	2	6	612129	612134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_009900	TAA	2	6	612777	612782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_009900	TTA	2	6	612785	612790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_009900	TGA	2	6	612807	612812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_009900	GAT	2	6	612820	612825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_009900	CAT	2	6	612847	612852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_009900	TGA	2	6	612864	612869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_009900	AT	3	6	612910	612915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_009900	T	6	6	612959	612964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_009900	TGT	2	6	612993	612998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_009900	TA	3	6	613000	613005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_009900	TCTT	2	8	613011	613018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4582	NC_009900	TTC	2	6	613081	613086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_009900	AGT	2	6	613121	613126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_009900	TTA	2	6	613128	613133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_009900	CTT	2	6	613147	613152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_009900	CTG	2	6	613167	613172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_009900	T	6	6	613215	613220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_009900	ATTG	2	8	613221	613228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_009900	ATA	2	6	613229	613234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_009900	GATTTT	2	12	613252	613263	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_009900	CTT	2	6	613279	613284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_009900	ATA	2	6	613291	613296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_009900	AT	3	6	613302	613307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_009900	TAGC	2	8	613330	613337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4595	NC_009900	TAT	2	6	613378	613383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_009900	CTTT	2	8	613405	613412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_009900	TTA	2	6	613458	613463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_009900	T	6	6	613465	613470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_009900	GCTTGT	2	12	613476	613487	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4600	NC_009900	AT	3	6	613533	613538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_009900	TAA	2	6	613550	613555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_009900	TTATT	2	10	613594	613603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_009900	T	6	6	613612	613617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_009900	TG	3	6	613644	613649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_009900	TGT	2	6	613660	613665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_009900	CAC	2	6	613680	613685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_009900	TTCA	2	8	613729	613736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4608	NC_009900	CAG	3	9	613746	613754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_009900	ATTG	2	8	613758	613765	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_009900	AT	3	6	613775	613780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_009900	ATTTA	2	10	613837	613846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_009900	T	6	6	613922	613927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_009900	TAAA	2	8	613951	613958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_009900	TAA	2	6	614014	614019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_009900	TAT	2	6	614049	614054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_009900	TAT	2	6	614057	614062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_009900	TAT	2	6	614156	614161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_009900	CAT	2	6	614164	614169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_009900	T	6	6	614171	614176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_009900	AGCA	2	8	614180	614187	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4621	NC_009900	TCT	2	6	614220	614225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_009900	TAA	2	6	614242	614247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_009900	ATA	2	6	614275	614280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_009900	TTC	2	6	614303	614308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_009900	CTT	2	6	614365	614370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_009900	CTA	2	6	614392	614397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_009900	AGA	2	6	614459	614464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_009900	A	6	6	614486	614491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_009900	ATTA	2	8	614513	614520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_009900	TTC	2	6	614573	614578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_009900	T	6	6	614589	614594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_009900	T	6	6	614613	614618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_009900	TCT	2	6	614638	614643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_009900	T	6	6	614682	614687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_009900	TTC	2	6	614690	614695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4636	NC_009900	ATT	2	6	614711	614716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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