MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia bellii OSU 85-389 chromosome

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009883	ATAAAC	2	12	26732	26743	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009883	TTTCTT	2	12	32304	32315	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009883	AATTCT	2	12	35726	35737	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009883	TGCTAA	2	12	52295	52306	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009883	TTAAAG	2	12	68950	68961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009883	ATATAA	2	12	79363	79374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009883	GTTTAT	2	12	89068	89079	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009883	TGCCTC	2	12	97864	97875	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009883	CATCTT	2	12	98088	98099	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009883	ATTTGT	2	12	102528	102539	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009883	ACAATA	2	12	116444	116455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009883	CTAATT	2	12	184636	184647	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009883	TTTTAA	2	12	199931	199942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009883	ATTGTA	2	12	203513	203524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009883	GATATT	2	12	217169	217180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009883	TTTTAA	2	12	223795	223806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009883	AATATC	2	12	229187	229198	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009883	AAATTT	2	12	233909	233920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009883	TGGTAC	2	12	234110	234121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009883	CTATTT	2	12	241418	241429	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009883	TCATCT	2	12	243160	243171	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009883	TTTCTA	2	12	243602	243613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009883	ATCTTT	2	12	252127	252138	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009883	AATTTA	2	12	284294	284305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009883	TTAAAA	2	12	287573	287584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009883	TTAAAT	2	12	291096	291107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009883	CTAATT	2	12	328889	328900	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009883	CTTTTT	2	12	349185	349196	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009883	ATTTTT	2	12	362246	362257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009883	AATCAA	2	12	362304	362315	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009883	ACCCAA	2	12	364932	364943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009883	ATTCCT	2	12	373857	373868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009883	TTTTAA	2	12	378029	378040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009883	CTAAAA	2	12	403524	403535	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009883	TTTTAA	2	12	404144	404155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009883	AGTTAA	2	12	408546	408557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009883	AGAAGT	2	12	408615	408626	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009883	TTAAAA	2	12	410114	410125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009883	GATAAC	2	12	411914	411925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009883	CTTTTA	2	12	430241	430252	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009883	TACTAA	2	12	430372	430383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009883	TTAAAA	2	12	433603	433614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009883	TTATAA	2	12	440796	440807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009883	TTATAA	2	12	447869	447880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009883	TTGGCG	2	12	466577	466588	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009883	TATTTA	2	12	483184	483195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009883	TTTTAA	2	12	486627	486638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009883	TCGCTA	2	12	488702	488713	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009883	TTTAAA	2	12	491334	491345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009883	TTATGG	2	12	500289	500300	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009883	AATATA	2	12	500408	500419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009883	ATATAG	2	12	519758	519769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009883	AAAGTA	2	12	524056	524067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009883	TAATTA	2	12	572816	572827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009883	TTAAAA	2	12	577917	577928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009883	GCTTTG	2	12	589234	589245	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009883	TACATT	2	12	590952	590963	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009883	AAAGCA	2	12	597352	597363	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009883	TTTTAA	2	12	609865	609876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009883	TAAAAA	2	12	625915	625926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009883	AACTTT	2	12	628138	628149	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009883	TGCTTC	2	12	628482	628493	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009883	TAAATT	2	12	629992	630003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009883	TTTTAA	2	12	657654	657665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009883	TATAAA	2	12	665622	665633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009883	TCTACT	2	12	666869	666880	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009883	TTAATT	2	12	669069	669080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009883	TAATTA	2	12	683214	683225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009883	ATTTAC	2	12	687754	687765	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009883	TACTAT	2	12	710002	710013	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009883	TATATT	2	12	713213	713224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009883	TTTTAA	2	12	716055	716066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009883	AATATT	2	12	730286	730297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009883	GGTGTA	2	12	752560	752571	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009883	TACTAG	2	12	771387	771398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009883	TAAAAT	2	12	771801	771812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009883	TAAAAT	2	12	782699	782710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009883	ATTACT	2	12	787224	787235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009883	TTATGT	2	12	793559	793570	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009883	GTTTAT	2	12	794614	794625	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009883	AATTAA	2	12	809158	809169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009883	TTTGTA	2	12	812005	812016	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009883	TGATAA	2	12	835864	835875	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009883	TTTTCA	2	12	839195	839206	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009883	TTAATA	2	12	841956	841967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009883	TTTTTA	2	12	843126	843137	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009883	TTTAGA	2	12	847880	847891	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009883	TTATCA	2	12	859338	859349	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009883	AATGAC	2	12	860444	860455	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_009883	AAAAGA	2	12	867617	867628	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009883	TTAATT	2	12	903883	903894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009883	TTTTTA	2	12	931694	931705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009883	ATATTT	2	12	950423	950434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009883	TAAATT	2	12	952659	952670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009883	TTTGTT	2	12	957531	957542	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009883	TACAAC	2	12	967992	968003	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009883	TTTTAA	2	12	1004908	1004919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009883	TTTATT	2	12	1009854	1009865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009883	TATAAA	2	12	1010626	1010637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009883	TTATAA	2	12	1040063	1040074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009883	AAATTA	2	12	1066203	1066214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009883	ATCTTG	2	12	1077991	1078002	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009883	TATCAA	2	12	1084466	1084477	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009883	GCTATT	2	12	1100035	1100046	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009883	GTTAAA	2	12	1124175	1124186	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009883	TTCAGG	2	12	1127847	1127858	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_009883	AATTTA	2	12	1130374	1130385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009883	ATATTT	2	12	1132851	1132862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009883	CCTGGA	2	12	1135104	1135115	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009883	GCAGAA	2	12	1156183	1156194	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_009883	TTAAAA	2	12	1156228	1156239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009883	TTAAAA	2	12	1160610	1160621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009883	TAATAT	2	12	1171131	1171142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009883	TAAATA	2	12	1173355	1173366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009883	TCTAGC	2	12	1196742	1196753	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009883	CAGGTA	2	12	1197746	1197757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009883	TGCCTA	2	12	1197857	1197868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009883	ATATTT	2	12	1203371	1203382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009883	TTTTAA	2	12	1222064	1222075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009883	ATTTTG	2	12	1237362	1237373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009883	TAATAT	2	12	1239559	1239570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009883	ATTTTT	2	12	1240894	1240905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009883	AATGAT	2	12	1257044	1257055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009883	ACGAAA	2	12	1262166	1262177	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009883	TTTTTA	2	12	1265947	1265958	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009883	ATATCA	2	12	1267679	1267690	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_009883	TTAAAA	2	12	1280851	1280862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009883	AAATTC	2	12	1289876	1289887	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009883	ATTAAA	2	12	1293963	1293974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009883	TTAAAA	2	12	1304747	1304758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009883	AATTTA	2	12	1323934	1323945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009883	GTTTAA	2	12	1326529	1326540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_009883	ATGATA	2	12	1333747	1333758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009883	ATATTA	2	12	1334770	1334781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.