MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009881	GTTA	2	8	9541	9548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009881	CTAC	2	8	9618	9625	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009881	ATTA	2	8	9844	9851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009881	ACTT	2	8	10158	10165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009881	ATTA	2	8	10222	10229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009881	ATAA	2	8	12849	12856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009881	TTAA	2	8	12915	12922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009881	TAAA	2	8	13337	13344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009881	TAAA	2	8	13479	13486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009881	TTTA	2	8	14116	14123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009881	TAAC	2	8	15427	15434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009881	ATTT	2	8	16117	16124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009881	AAGT	2	8	18248	18255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009881	TATC	2	8	18300	18307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009881	ATTA	2	8	20768	20775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009881	ATTG	2	8	20936	20943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009881	TTTA	2	8	21059	21066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009881	ATTA	2	8	21451	21458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009881	TATT	2	8	21763	21770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009881	ATTA	2	8	21814	21821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009881	TTAT	2	8	21830	21837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009881	GTTT	2	8	21888	21895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009881	TTCT	2	8	22869	22876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009881	ATTT	2	8	24214	24221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009881	ACAG	2	8	24912	24919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009881	ATTC	2	8	24997	25004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009881	AAAT	2	8	25191	25198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009881	AATT	2	8	25269	25276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009881	ATTT	2	8	25295	25302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009881	ATTA	2	8	35365	35372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009881	TTTA	2	8	36890	36897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009881	TATC	2	8	43253	43260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009881	ATTA	2	8	44050	44057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009881	GCTT	2	8	49756	49763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009881	TAAA	2	8	50593	50600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009881	GATT	2	8	50779	50786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009881	ATTT	2	8	51075	51082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009881	AACG	2	8	51484	51491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009881	GAAC	2	8	53551	53558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009881	ACTT	2	8	57046	57053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009881	ATTT	2	8	57071	57078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009881	GCAA	2	8	57494	57501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009881	TTTA	2	8	57520	57527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009881	ATCA	2	8	57844	57851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009881	ATGT	2	8	57852	57859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009881	AAGA	2	8	58200	58207	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009881	AAAT	2	8	58715	58722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009881	AATA	2	8	67269	67276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009881	TAGA	2	8	69062	69069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009881	TAAA	2	8	69083	69090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009881	AAAT	2	8	69204	69211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009881	TCTT	2	8	76624	76631	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009881	ATTT	2	8	79768	79775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009881	TTTA	2	8	79802	79809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009881	CGAG	2	8	80252	80259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009881	AGTA	2	8	80351	80358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009881	TACA	2	8	80887	80894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009881	AATA	2	8	81420	81427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009881	ATAA	2	8	85564	85571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009881	TGGT	2	8	88190	88197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009881	ATCT	2	8	88363	88370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009881	TTTA	2	8	88737	88744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009881	AAAT	2	8	90516	90523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009881	ATTA	2	8	90731	90738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009881	ATCA	2	8	91464	91471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009881	TAAT	2	8	92101	92108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009881	ATTA	2	8	97023	97030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009881	GATA	2	8	99500	99507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009881	AGAA	2	8	99707	99714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009881	TAAT	2	8	106901	106908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009881	TTCA	2	8	112622	112629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009881	TAAA	2	8	112789	112796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009881	GTTT	2	8	116579	116586	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009881	GCTT	2	8	116739	116746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009881	TACT	2	8	117021	117028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009881	AGTA	2	8	117586	117593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009881	TAAC	2	8	117981	117988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009881	TAAA	2	8	124449	124456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009881	GATT	2	8	124635	124642	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009881	AGAA	2	8	124680	124687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009881	AATT	2	8	125377	125384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009881	TTAT	2	8	125449	125456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009881	TTAC	2	8	126536	126543	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009881	CTCG	2	8	128602	128609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009881	GATT	2	8	129999	130006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009881	CTTT	2	8	134747	134754	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009881	GCAA	2	8	136435	136442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009881	TTAA	2	8	136784	136791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009881	GAAT	2	8	137345	137352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009881	ATAA	2	8	155237	155244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009881	ATTA	2	8	155313	155320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009881	AAAG	2	8	157714	157721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009881	GCAA	2	8	159645	159652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009881	ATAA	2	8	172842	172849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009881	GATG	2	8	175004	175011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009881	TTTA	2	8	178146	178153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009881	TTAG	2	8	178581	178588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009881	TAAT	2	8	181219	181226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009881	ATTG	2	8	185340	185347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009881	TGAA	2	8	185371	185378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009881	AACA	2	8	185397	185404	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009881	ATAA	2	8	185563	185570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009881	ATTA	2	8	185612	185619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009881	TTTA	2	8	190062	190069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009881	GTAT	2	8	190076	190083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009881	ACGA	2	8	190137	190144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009881	AAAT	2	8	190166	190173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009881	CTAG	2	8	194672	194679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009881	AGCA	2	8	201028	201035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009881	CTTG	2	8	209735	209742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009881	CTAA	2	8	210122	210129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009881	TAAA	2	8	213642	213649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009881	TATT	2	8	213721	213728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009881	GTAT	2	8	214558	214565	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009881	AATC	2	8	214661	214668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009881	AAAT	2	8	214886	214893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009881	GTAA	2	8	214918	214925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009881	CAAT	2	8	215097	215104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009881	ATTT	2	8	215285	215292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009881	TTTA	2	8	216049	216056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009881	TAAT	2	8	218898	218905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009881	AGCA	2	8	218937	218944	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009881	CTTT	2	8	220203	220210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009881	TAAA	2	8	225206	225213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009881	TATT	2	8	225389	225396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009881	GTTT	2	8	226518	226525	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009881	AATA	2	8	227128	227135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009881	AAAT	2	8	227455	227462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009881	TTCT	2	8	227592	227599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009881	TAAT	2	8	231997	232004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009881	AAGT	2	8	232111	232118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009881	TAAC	2	8	232203	232210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009881	AAAT	2	8	232382	232389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009881	AGTA	2	8	232590	232597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009881	TAAT	2	8	232894	232901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009881	TAGC	2	8	233031	233038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009881	ATTT	2	8	233268	233275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009881	GAAA	2	8	234878	234885	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009881	ACGA	2	8	234928	234935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009881	AAGC	2	8	235146	235153	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009881	TAAA	2	8	237059	237066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009881	CATT	2	8	237159	237166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009881	TAAA	2	8	237998	238005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009881	TTGT	2	8	238017	238024	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009881	TACT	2	8	239429	239436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009881	ATTT	2	8	241522	241529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009881	AATC	2	8	241631	241638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009881	TTGT	2	8	244462	244469	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009881	GCGA	2	8	244486	244493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009881	GCTT	2	8	244528	244535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009881	TAAA	2	8	249492	249499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_009881	AAAC	2	8	252778	252785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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