MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 20755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009767	CTCA	2	8	324069	324076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_009767	CG	3	6	324113	324118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_009767	TGC	2	6	324176	324181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_009767	CG	3	6	324187	324192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_009767	CTCA	2	8	324217	324224	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_009767	GGTCA	2	10	324318	324327	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1007	NC_009767	AC	3	6	324354	324359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_009767	TC	3	6	324400	324405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_009767	CGG	2	6	324490	324495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009767	CA	3	6	326284	326289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_009767	TGC	2	6	326290	326295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_009767	GGC	2	6	326363	326368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_009767	GC	3	6	326367	326372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_009767	CGC	2	6	326384	326389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_009767	CAC	2	6	326398	326403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_009767	CG	3	6	326416	326421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_009767	CT	3	6	326423	326428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_009767	CAG	2	6	326467	326472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_009767	TGGCGC	2	12	326489	326500	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_009767	CCAA	2	8	326524	326531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_009767	TAT	2	6	326580	326585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009767	CTTCG	2	10	326616	326625	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1023	NC_009767	GCT	2	6	326677	326682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_009767	GGC	2	6	326835	326840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_009767	GAGC	2	8	326871	326878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_009767	GCA	2	6	326924	326929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_009767	TGC	2	6	326950	326955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_009767	TCC	2	6	329351	329356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_009767	CGT	2	6	329421	329426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_009767	CGG	2	6	329483	329488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_009767	TCGG	2	8	329499	329506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_009767	T	7	7	329558	329564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009767	TGA	2	6	329608	329613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009767	GCGAT	2	10	329639	329648	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1035	NC_009767	GGC	2	6	329649	329654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_009767	CGGT	2	8	329673	329680	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_009767	GCT	2	6	329705	329710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_009767	GC	3	6	329868	329873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_009767	CG	3	6	329921	329926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_009767	GCC	2	6	329945	329950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_009767	GAA	2	6	332068	332073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009767	CGC	2	6	332151	332156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_009767	GCG	2	6	332157	332162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_009767	CGA	2	6	332163	332168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_009767	CAGG	2	8	332170	332177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_009767	TGG	2	6	332189	332194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009767	CGC	2	6	332209	332214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_009767	GGTC	2	8	332237	332244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_009767	TCC	2	6	334496	334501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_009767	TC	3	6	336309	336314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_009767	GAT	2	6	337019	337024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009767	GCAGGC	2	12	337191	337202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_009767	AAT	2	6	337329	337334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009767	GC	3	6	337412	337417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_009767	GA	3	6	337489	337494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009767	ATC	2	6	338199	338204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_009767	CAGC	2	8	338247	338254	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_009767	ATC	2	6	338273	338278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_009767	TGCGAC	2	12	338311	338322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1062	NC_009767	ACG	2	6	341842	341847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_009767	GC	3	6	341848	341853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_009767	C	6	6	341882	341887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1065	NC_009767	CCA	2	6	341934	341939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_009767	ACC	2	6	341958	341963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_009767	TG	4	8	342024	342031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009767	CATC	2	8	342058	342065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_009767	ATA	2	6	342080	342085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_009767	A	7	7	342094	342100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009767	GTC	2	6	344238	344243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_009767	GC	3	6	344253	344258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_009767	CAGC	2	8	344298	344305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_009767	CGA	2	6	344312	344317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_009767	TCG	2	6	344343	344348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_009767	GC	3	6	344409	344414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_009767	CGT	2	6	344491	344496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_009767	GCT	2	6	344659	344664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_009767	GC	3	6	344665	344670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_009767	A	6	6	345056	345061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_009767	ACG	2	6	345584	345589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_009767	TAA	2	6	346285	346290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_009767	CTGT	2	8	346846	346853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1097	NC_009767	GC	3	6	346872	346877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_009767	GCG	2	6	346890	346895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_009767	G	6	6	346900	346905	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009767	GTC	2	6	346909	346914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_009767	GC	3	6	346922	346927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_009767	GTG	2	6	346945	346950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009767	GC	3	6	346963	346968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_009767	TGG	2	6	347038	347043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009767	AAC	2	6	347169	347174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_009767	GCT	2	6	347189	347194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_009767	AG	3	6	347325	347330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009767	G	6	6	347948	347953	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009767	GGC	2	6	347990	347995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_009767	GC	3	6	347994	347999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_009767	AGGGC	2	10	348030	348039	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_009767	GA	3	6	348049	348054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009767	CGAG	2	8	348130	348137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_009767	CTTCG	2	10	349138	349147	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1115	NC_009767	GCT	2	6	349199	349204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_009767	CAG	2	6	349280	349285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_009767	CCAA	2	8	349294	349301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_009767	CAT	2	6	349306	349311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_009767	TGC	2	6	349326	349331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_009767	CACC	2	8	349376	349383	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1121	NC_009767	GCAA	2	8	349390	349397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_009767	CTC	2	6	349400	349405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_009767	TAT	2	6	349414	349419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009767	CG	3	6	349549	349554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_009767	CTTCG	2	10	349577	349586	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1126	NC_009767	GCT	2	6	349638	349643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1131	NC_009767	TGT	2	6	350750	350755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_009767	AGT	2	6	353713	353718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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