MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 16791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009523	CCT	2	6	978171	978176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_009523	CTG	2	6	978373	978378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_009523	CCG	2	6	978395	978400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_009523	AT	3	6	978445	978450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_009523	CTG	2	6	978458	978463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_009523	GCC	2	6	978495	978500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_009523	ACC	2	6	982752	982757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_009523	ATG	2	6	982779	982784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_009523	CCG	2	6	982791	982796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_009523	GAT	2	6	982895	982900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_009523	ATT	2	6	983060	983065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_009523	ATT	2	6	983128	983133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_009523	GTC	2	6	983158	983163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_009523	CTC	2	6	983208	983213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_009523	CT	3	6	984471	984476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_009523	TGCAC	2	10	984503	984512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3017	NC_009523	TGCA	2	8	984552	984559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_009523	TGCG	2	8	984678	984685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_009523	CGT	2	6	984722	984727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_009523	GC	3	6	984764	984769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_009523	T	6	6	986351	986356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_009523	TGA	2	6	987620	987625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_009523	CCT	2	6	987662	987667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_009523	TCACGC	2	12	987681	987692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_009523	GCG	2	6	987700	987705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_009523	AG	3	6	987725	987730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_009523	GC	3	6	987758	987763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_009523	CCCT	2	8	987785	987792	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3029	NC_009523	GC	3	6	987838	987843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_009523	GC	4	8	987849	987856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_009523	TC	3	6	987870	987875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3032	NC_009523	ATT	2	6	988047	988052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_009523	AAT	2	6	988115	988120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_009523	GC	3	6	988350	988355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_009523	CG	3	6	988413	988418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_009523	TCC	2	6	988513	988518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_009523	CCT	2	6	989531	989536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_009523	CG	3	6	989618	989623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_009523	GC	4	8	989624	989631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_009523	AGG	2	6	989660	989665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_009523	CCT	2	6	991636	991641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_009523	CCCT	2	8	991661	991668	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3043	NC_009523	GAA	2	6	991787	991792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_009523	ATTT	2	8	991874	991881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_009523	ATTT	2	8	991922	991929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_009523	TCA	2	6	991938	991943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_009523	CCG	2	6	991946	991951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_009523	A	6	6	992614	992619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_009523	GGA	2	6	992620	992625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_009523	GGGT	2	8	993154	993161	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_009523	G	7	7	993248	993254	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_009523	CGT	2	6	993321	993326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_009523	CG	4	8	993362	993369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_009523	GAC	2	6	993386	993391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_009523	GGA	2	6	993419	993424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_009523	CGT	2	6	993427	993432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_009523	TGA	2	6	995347	995352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_009523	CGG	2	6	995420	995425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_009523	TTC	2	6	995433	995438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_009523	GTGAC	2	10	995472	995481	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3061	NC_009523	GC	3	6	995551	995556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_009523	AAGC	2	8	995579	995586	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_009523	TCG	2	6	996968	996973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_009523	AACCG	2	10	996980	996989	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3065	NC_009523	AG	3	6	997015	997020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_009523	TGGA	2	8	997021	997028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_009523	TGC	2	6	997048	997053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_009523	ATT	2	6	1000150	1000155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_009523	GCAG	2	8	1000170	1000177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_009523	GAA	2	6	1000213	1000218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_009523	GCGCT	2	10	1000453	1000462	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3072	NC_009523	GC	3	6	1000616	1000621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_009523	TCC	2	6	1000734	1000739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_009523	TTG	2	6	1000745	1000750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_009523	TGA	2	6	1000759	1000764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_009523	AGA	2	6	1000771	1000776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_009523	AAC	2	6	1000777	1000782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_009523	GCC	2	6	1000799	1000804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_009523	GTC	2	6	1000805	1000810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_009523	TGC	2	6	1000830	1000835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_009523	ATT	2	6	1000875	1000880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_009523	AGT	2	6	1000913	1000918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_009523	TGT	2	6	1000933	1000938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_009523	TC	3	6	1000965	1000970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_009523	ATG	2	6	1001003	1001008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_009523	GGA	2	6	1001057	1001062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_009523	CGG	2	6	1002381	1002386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_009523	CG	3	6	1003094	1003099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_009523	GCT	2	6	1003109	1003114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_009523	GGAGA	2	10	1003143	1003152	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_009523	TGCT	2	8	1004161	1004168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3093	NC_009523	TGA	2	6	1004180	1004185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_009523	TGCT	2	8	1004234	1004241	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3095	NC_009523	TGA	2	6	1004253	1004258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_009523	AAAT	2	8	1004270	1004277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_009523	G	6	6	1004417	1004422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_009523	GCG	2	6	1004562	1004567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_009523	TCG	2	6	1006850	1006855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_009523	TGA	2	6	1007469	1007474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_009523	AT	3	6	1007775	1007780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_009523	GCC	2	6	1009019	1009024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_009523	TTG	2	6	1009035	1009040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_009523	GTG	2	6	1009101	1009106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_009523	GAA	2	6	1009242	1009247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_009523	GAA	2	6	1009310	1009315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_009523	TCA	2	6	1009460	1009465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_009523	CGT	2	6	1009601	1009606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_009523	ACT	2	6	1009633	1009638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_009523	CGA	2	6	1009844	1009849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_009523	GAT	2	6	1009907	1009912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_009523	CAA	2	6	1010068	1010073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_009523	AGA	2	6	1010079	1010084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_009523	GGA	2	6	1010105	1010110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_009523	TTCC	2	8	1011299	1011306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_009523	TGT	2	6	1011307	1011312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_009523	GCG	2	6	1011318	1011323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_009523	TGA	2	6	1011403	1011408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_009523	GTC	2	6	1011454	1011459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_009523	GCG	2	6	1011741	1011746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_009523	TCG	2	6	1015713	1015718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_009523	GCA	2	6	1015822	1015827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_009523	CG	3	6	1015901	1015906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_009523	ATTT	2	8	1015939	1015946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_009523	GC	3	6	1015962	1015967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_009523	ACT	2	6	1016017	1016022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_009523	ACA	2	6	1016047	1016052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_009523	ATGGTG	2	12	1016056	1016067	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_009523	GCTGA	2	10	1016158	1016167	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3130	NC_009523	ATTT	2	8	1016201	1016208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_009523	CGC	2	6	1016309	1016314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_009523	TCC	2	6	1016374	1016379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_009523	AGGG	2	8	1016434	1016441	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_009523	AAT	2	6	1016459	1016464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_009523	ATTT	2	8	1016651	1016658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3142	NC_009523	TC	3	6	1016883	1016888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3253	NC_009523	GCG	2	6	1043953	1043958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3262	NC_009523	GA	3	6	1045648	1045653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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