MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 16791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009523	TCG	3	9	3461421	3461429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_009523	CCG	2	6	3461431	3461436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_009523	ACG	2	6	3461456	3461461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_009523	CCGC	2	8	3461511	3461518	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10005	NC_009523	GCCC	2	8	3461530	3461537	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10006	NC_009523	CAC	2	6	3461599	3461604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_009523	GC	3	6	3461616	3461621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_009523	TCC	2	6	3461627	3461632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10009	NC_009523	GC	3	6	3461699	3461704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_009523	GCGTC	2	10	3461756	3461765	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10011	NC_009523	CGG	2	6	3461837	3461842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_009523	GCC	2	6	3461864	3461869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_009523	CGTC	2	8	3461916	3461923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10014	NC_009523	CAGC	2	8	3461966	3461973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_009523	GA	3	6	3461974	3461979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_009523	GCA	2	6	3462001	3462006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_009523	GC	4	8	3462012	3462019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_009523	GCGG	2	8	3462027	3462034	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10019	NC_009523	GCC	2	6	3462063	3462068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_009523	CTC	2	6	3462125	3462130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_009523	CCT	2	6	3462169	3462174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_009523	GGAT	2	8	3462191	3462198	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_009523	T	6	6	3462216	3462221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_009523	CCG	2	6	3462450	3462455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10027	NC_009523	TGCG	2	8	3462708	3462715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10029	NC_009523	GCAG	2	8	3467750	3467757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10030	NC_009523	CT	3	6	3467779	3467784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10031	NC_009523	TG	3	6	3467786	3467791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_009523	TGT	2	6	3471378	3471383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10037	NC_009523	GT	3	6	3471521	3471526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10042	NC_009523	AC	3	6	3471833	3471838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10045	NC_009523	CGT	2	6	3471888	3471893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10050	NC_009523	AATA	2	8	3474421	3474428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10054	NC_009523	ATT	2	6	3475783	3475788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_009523	CG	3	6	3475839	3475844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10056	NC_009523	CGG	2	6	3475848	3475853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_009523	CTG	2	6	3475881	3475886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_009523	CAC	2	6	3475979	3475984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_009523	CAGC	2	8	3475985	3475992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_009523	CCA	2	6	3475995	3476000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_009523	CATC	2	8	3477078	3477085	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10063	NC_009523	ATTC	2	8	3477135	3477142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_009523	TAAA	2	8	3477229	3477236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_009523	GAT	2	6	3477241	3477246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10068	NC_009523	AT	3	6	3478296	3478301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10077	NC_009523	CTCGC	2	10	3480743	3480752	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10078	NC_009523	CCT	2	6	3483363	3483368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10087	NC_009523	ATT	2	6	3485120	3485125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10099	NC_009523	GCC	3	9	3490068	3490076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_009523	CACC	2	8	3490083	3490090	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10101	NC_009523	CGC	2	6	3490116	3490121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10109	NC_009523	GCG	2	6	3493143	3493148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_009523	GCG	2	6	3493186	3493191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_009523	GCG	2	6	3493206	3493211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_009523	TG	3	6	3493234	3493239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_009523	AGG	2	6	3493245	3493250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_009523	TGA	2	6	3496110	3496115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10119	NC_009523	GC	3	6	3496488	3496493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_009523	TGA	2	6	3496502	3496507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_009523	AAAT	2	8	3496563	3496570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_009523	AAT	2	6	3496647	3496652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10126	NC_009523	T	6	6	3496844	3496849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_009523	CAGC	2	8	3496888	3496895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10128	NC_009523	TGC	2	6	3497455	3497460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10130	NC_009523	AGG	2	6	3499388	3499393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_009523	AGC	2	6	3501705	3501710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_009523	GTT	2	6	3502743	3502748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_009523	ACA	2	6	3506085	3506090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_009523	ACC	2	6	3506545	3506550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10135	NC_009523	ACT	2	6	3506607	3506612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10136	NC_009523	GAG	2	6	3508098	3508103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_009523	AT	3	6	3509462	3509467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_009523	CGC	2	6	3509688	3509693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10139	NC_009523	GTTTT	2	10	3509706	3509715	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_009523	ATT	2	6	3509783	3509788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_009523	TCT	2	6	3510937	3510942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10142	NC_009523	CTG	2	6	3511020	3511025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10143	NC_009523	GT	3	6	3511127	3511132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_009523	AGAAA	2	10	3511135	3511144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_009523	CAA	2	6	3511291	3511296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10146	NC_009523	GGA	2	6	3511298	3511303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10147	NC_009523	G	9	9	3512795	3512803	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10148	NC_009523	CGC	2	6	3512804	3512809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10149	NC_009523	TCC	2	6	3512810	3512815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10150	NC_009523	GCG	2	6	3514733	3514738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10151	NC_009523	C	6	6	3514763	3514768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10152	NC_009523	C	6	6	3514835	3514840	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10153	NC_009523	C	6	6	3514907	3514912	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10154	NC_009523	GA	3	6	3515080	3515085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_009523	GATG	2	8	3515155	3515162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10158	NC_009523	CA	3	6	3515237	3515242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10159	NC_009523	GGACG	2	10	3515272	3515281	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10160	NC_009523	GGACG	2	10	3515320	3515329	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10161	NC_009523	TCC	2	6	3516472	3516477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10162	NC_009523	ACAGC	2	10	3516479	3516488	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10163	NC_009523	GAC	2	6	3516534	3516539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10164	NC_009523	GC	3	6	3516565	3516570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10165	NC_009523	GAGG	2	8	3516614	3516621	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10166	NC_009523	GTT	2	6	3519395	3519400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10169	NC_009523	GAC	2	6	3519638	3519643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10170	NC_009523	GCTG	2	8	3519647	3519654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10171	NC_009523	CTG	3	9	3519652	3519660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10172	NC_009523	ACCT	2	8	3519690	3519697	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10173	NC_009523	GT	3	6	3519776	3519781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10174	NC_009523	GC	3	6	3519795	3519800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10175	NC_009523	GTT	2	6	3519821	3519826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10176	NC_009523	TCTG	2	8	3519881	3519888	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10177	NC_009523	TCTTG	2	10	3519926	3519935	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10197	NC_009523	CATG	2	8	3524254	3524261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10213	NC_009523	TCTT	2	8	3534461	3534468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10214	NC_009523	CT	3	6	3534475	3534480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10221	NC_009523	C	6	6	3537143	3537148	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10222	NC_009523	GTTT	2	8	3537173	3537180	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10224	NC_009523	GAG	2	6	3537217	3537222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10242	NC_009523	TTG	2	6	3548790	3548795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10243	NC_009523	TC	3	6	3548840	3548845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10244	NC_009523	TG	3	6	3548863	3548868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10245	NC_009523	CCT	2	6	3549877	3549882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10246	NC_009523	AGCGC	2	10	3550061	3550070	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10247	NC_009523	TGGAC	2	10	3550084	3550093	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10248	NC_009523	CG	3	6	3550121	3550126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10249	NC_009523	AT	3	6	3550152	3550157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_009523	TGAA	2	8	3550201	3550208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_009523	GAG	2	6	3550244	3550249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_009523	TGAA	2	8	3550313	3550320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_009523	GAG	2	6	3550356	3550361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_009523	ATT	2	6	3550427	3550432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_009523	ATT	2	6	3550495	3550500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_009523	CAGG	2	8	3550526	3550533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10257	NC_009523	CTG	2	6	3552643	3552648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10259	NC_009523	GC	3	6	3552727	3552732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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