MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 16791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009523	CAGG	2	8	2021752	2021759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_009523	TGCCG	2	10	2022086	2022095	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6003	NC_009523	GT	3	6	2024181	2024186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_009523	CAT	2	6	2024244	2024249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_009523	CCGTT	2	10	2024250	2024259	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6006	NC_009523	CAA	2	6	2024260	2024265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_009523	GTA	2	6	2024291	2024296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_009523	CTTC	2	8	2024360	2024367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_009523	GAA	2	6	2024378	2024383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_009523	ATCGT	2	10	2024415	2024424	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6011	NC_009523	AG	3	6	2025017	2025022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_009523	GCG	2	6	2027074	2027079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_009523	TGGTAG	2	12	2027092	2027103	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_009523	G	6	6	2027105	2027110	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_009523	T	6	6	2027188	2027193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_009523	G	6	6	2027269	2027274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_009523	G	6	6	2027276	2027281	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_009523	GCGCA	2	10	2027309	2027318	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6019	NC_009523	GCA	2	6	2027334	2027339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_009523	TGCGC	2	10	2029012	2029021	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6021	NC_009523	TGT	2	6	2029022	2029027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_009523	CGG	2	6	2029895	2029900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_009523	GTG	2	6	2030001	2030006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_009523	GCA	2	6	2035975	2035980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_009523	ATC	2	6	2036006	2036011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_009523	GGA	2	6	2036027	2036032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_009523	ATG	2	6	2036517	2036522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_009523	ATC	2	6	2036535	2036540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_009523	CGC	2	6	2036637	2036642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_009523	CCG	2	6	2036646	2036651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_009523	CGT	2	6	2037083	2037088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_009523	GAA	2	6	2037166	2037171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_009523	GC	3	6	2037172	2037177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_009523	GC	3	6	2037183	2037188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_009523	ACG	2	6	2037213	2037218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_009523	GAA	2	6	2043046	2043051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_009523	AACG	2	8	2045819	2045826	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6038	NC_009523	GCG	2	6	2045839	2045844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_009523	CTC	2	6	2045845	2045850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_009523	GAT	2	6	2045925	2045930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_009523	CCG	2	6	2048681	2048686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_009523	GCG	2	6	2048729	2048734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_009523	ATG	2	6	2048739	2048744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_009523	GAC	2	6	2052056	2052061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_009523	CA	3	6	2052078	2052083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_009523	AGG	2	6	2059932	2059937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_009523	GAT	2	6	2069127	2069132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_009523	CG	3	6	2069135	2069140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_009523	TCA	2	6	2069189	2069194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_009523	GAA	2	6	2069559	2069564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_009523	GAC	2	6	2069578	2069583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_009523	GCAA	2	8	2069658	2069665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_009523	TTG	2	6	2069681	2069686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_009523	CCG	2	6	2069698	2069703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_009523	GCG	2	6	2069709	2069714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_009523	GAC	2	6	2069735	2069740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_009523	ATC	2	6	2069815	2069820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_009523	CGA	2	6	2069829	2069834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_009523	GTG	2	6	2069939	2069944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_009523	CAGC	2	8	2069976	2069983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_009523	GCA	2	6	2070000	2070005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_009523	CCG	3	9	2070431	2070439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_009523	GCG	2	6	2070506	2070511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_009523	GC	3	6	2070521	2070526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_009523	AGC	2	6	2070580	2070585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_009523	GAG	2	6	2071270	2071275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_009523	CAT	3	9	2071288	2071296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_009523	CG	3	6	2071342	2071347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_009523	TCCGC	2	10	2071361	2071370	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6070	NC_009523	GAT	2	6	2071408	2071413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_009523	AAG	2	6	2071430	2071435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_009523	TCG	2	6	2071446	2071451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_009523	TTA	2	6	2071839	2071844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_009523	TTC	2	6	2071867	2071872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_009523	AGG	2	6	2071886	2071891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_009523	CG	3	6	2074477	2074482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_009523	CGC	2	6	2074491	2074496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_009523	GTC	3	9	2074501	2074509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_009523	GGA	2	6	2074524	2074529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_009523	GCG	2	6	2074538	2074543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_009523	CCG	2	6	2074576	2074581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_009523	CG	3	6	2075379	2075384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_009523	ATA	2	6	2075470	2075475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_009523	AGA	2	6	2075669	2075674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_009523	GTT	2	6	2075679	2075684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_009523	GCC	2	6	2075748	2075753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6087	NC_009523	CTC	2	6	2076442	2076447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6089	NC_009523	CCG	2	6	2076997	2077002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_009523	CCG	2	6	2077007	2077012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_009523	TCG	2	6	2077066	2077071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_009523	ATGC	2	8	2077075	2077082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6093	NC_009523	GC	3	6	2077093	2077098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_009523	GTCGG	2	10	2077114	2077123	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6095	NC_009523	GTT	2	6	2077137	2077142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_009523	GCG	2	6	2077187	2077192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_009523	ATC	2	6	2077230	2077235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_009523	TAC	2	6	2077249	2077254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_009523	CCG	2	6	2077272	2077277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_009523	CAC	2	6	2077318	2077323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_009523	GCT	2	6	2077832	2077837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_009523	CG	3	6	2079397	2079402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_009523	CGC	2	6	2079411	2079416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_009523	GTC	3	9	2079421	2079429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_009523	GGA	2	6	2079444	2079449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6107	NC_009523	CCG	2	6	2079496	2079501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_009523	GCG	2	6	2080250	2080255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_009523	CAG	2	6	2080272	2080277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6111	NC_009523	GAC	2	6	2080321	2080326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_009523	GGC	2	6	2080336	2080341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_009523	GCG	2	6	2080380	2080385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_009523	GGC	2	6	2080406	2080411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_009523	GGT	2	6	2080426	2080431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_009523	G	7	7	2080432	2080438	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_009523	GCC	2	6	2080468	2080473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_009523	GCG	2	6	2080600	2080605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_009523	CGC	2	6	2080633	2080638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_009523	TCA	2	6	2082723	2082728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_009523	ATT	2	6	2082777	2082782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_009523	GCG	2	6	2082791	2082796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_009523	GAA	2	6	2082812	2082817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_009523	CATC	2	8	2082852	2082859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_009523	CCG	2	6	2082938	2082943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6126	NC_009523	GGC	2	6	2082982	2082987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_009523	CGT	2	6	2083039	2083044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_009523	TCT	2	6	2083046	2083051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_009523	TCA	2	6	2083595	2083600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6132	NC_009523	ACG	2	6	2084794	2084799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6134	NC_009523	TGA	2	6	2087020	2087025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6240	NC_009523	GC	3	6	2143724	2143729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6241	NC_009523	CTG	2	6	2143778	2143783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6242	NC_009523	CTG	2	6	2143940	2143945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6244	NC_009523	CGC	2	6	2144049	2144054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6246	NC_009523	CGA	2	6	2144206	2144211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6248	NC_009523	GTGAC	2	10	2144265	2144274	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6249	NC_009523	C	6	6	2144324	2144329	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6250	NC_009523	CTC	2	6	2146256	2146261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6251	NC_009523	CGTG	2	8	2146311	2146318	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6252	NC_009523	CCGA	2	8	2146349	2146356	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6253	NC_009523	GC	3	6	2149834	2149839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6254	NC_009523	GCAG	2	8	2149863	2149870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6255	NC_009523	CGC	2	6	2149871	2149876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6256	NC_009523	GCAG	2	8	2149900	2149907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6257	NC_009523	GCAG	2	8	2149949	2149956	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6258	NC_009523	CGC	2	6	2149957	2149962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6260	NC_009523	GCAG	2	8	2149998	2150005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6265	NC_009523	GCC	2	6	2150354	2150359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6392	NC_009523	TCG	2	6	2185432	2185437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6393	NC_009523	CGAG	2	8	2185464	2185471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6394	NC_009523	TTTCG	2	10	2185521	2185530	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6395	NC_009523	GCAGG	2	10	2188672	2188681	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6396	NC_009523	CGC	2	6	2188691	2188696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6397	NC_009523	CCCG	2	8	2188699	2188706	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6398	NC_009523	TC	3	6	2188718	2188723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6399	NC_009523	TTG	2	6	2189163	2189168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6400	NC_009523	GGC	2	6	2189180	2189185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6406	NC_009523	TAC	2	6	2191115	2191120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6410	NC_009523	CAG	2	6	2191892	2191897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6411	NC_009523	CAG	2	6	2192110	2192115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6414	NC_009523	GCG	2	6	2192425	2192430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6422	NC_009523	ATC	2	6	2194065	2194070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6423	NC_009523	GAT	2	6	2195699	2195704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6424	NC_009523	GAT	2	6	2195738	2195743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6425	NC_009523	CGTTG	2	10	2195774	2195783	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6426	NC_009523	ACCG	2	8	2195802	2195809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6427	NC_009523	TCG	2	6	2197278	2197283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6431	NC_009523	AC	3	6	2199176	2199181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6432	NC_009523	ATC	2	6	2199227	2199232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6433	NC_009523	GCA	2	6	2199237	2199242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6434	NC_009523	CCT	2	6	2200201	2200206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6435	NC_009523	CTT	2	6	2200287	2200292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6436	NC_009523	AAG	2	6	2202086	2202091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6437	NC_009523	ATAG	2	8	2202108	2202115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6439	NC_009523	CG	3	6	2202359	2202364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6440	NC_009523	TAT	2	6	2202409	2202414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6453	NC_009523	TCGCT	2	10	2208902	2208911	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6478	NC_009523	TCG	2	6	2226003	2226008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6486	NC_009523	AATA	2	8	2227789	2227796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6487	NC_009523	AATA	2	8	2227857	2227864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6490	NC_009523	TCC	2	6	2229521	2229526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6496	NC_009523	ATT	2	6	2230952	2230957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_009523	TCG	2	6	2230986	2230991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6498	NC_009523	TGT	2	6	2231024	2231029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6499	NC_009523	GTGTT	2	10	2231666	2231675	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6500	NC_009523	TGC	2	6	2231686	2231691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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