MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA02

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009430	CGGC	2	8	84	91	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009430	CCGG	2	8	8445	8452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009430	CGGG	2	8	8479	8486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009430	CTGT	2	8	10380	10387	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009430	CCCG	2	8	11299	11306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_009430	CCGG	2	8	12617	12624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009430	CAAG	2	8	12695	12702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009430	GGGC	2	8	12728	12735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009430	TGCC	2	8	22222	22229	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009430	GCAG	2	8	22329	22336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009430	ATCG	2	8	32228	32235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009430	CCCG	2	8	36791	36798	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_009430	CGGC	2	8	37300	37307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009430	CCTC	2	8	39045	39052	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_009430	CTGA	2	8	40346	40353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009430	CGCC	2	8	40951	40958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_009430	CGGC	2	8	42637	42644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009430	GCCC	2	8	42652	42659	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_009430	CGGG	2	8	44213	44220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009430	CCGG	2	8	44225	44232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009430	ATTT	2	8	44274	44281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009430	CGCT	2	8	44349	44356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009430	ATCC	2	8	44433	44440	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009430	GTTT	2	8	53999	54006	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009430	GCGG	2	8	54050	54057	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009430	GCGA	2	8	56735	56742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009430	CGTC	2	8	57446	57453	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009430	CTGT	2	8	57702	57709	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009430	GAAC	2	8	59119	59126	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009430	TTCG	2	8	63295	63302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009430	TGAT	2	8	71842	71849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009430	ATGG	2	8	74180	74187	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009430	CAGG	2	8	85568	85575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009430	TTTC	2	8	87377	87384	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009430	CCCT	2	8	103697	103704	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_009430	GACC	2	8	112191	112198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009430	TTGC	2	8	130778	130785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009430	TGAT	2	8	130803	130810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009430	GGCC	2	8	131673	131680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009430	CCGG	2	8	133329	133336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009430	CCGG	2	8	134070	134077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009430	TCCG	2	8	134095	134102	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009430	GGCC	2	8	134822	134829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009430	GCCC	2	8	135489	135496	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_009430	GGGC	2	8	135515	135522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009430	GCCG	2	8	135542	135549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009430	GCCG	2	8	136494	136501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009430	TCTT	2	8	137011	137018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009430	CGCC	2	8	137029	137036	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_009430	GAGG	2	8	141264	141271	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009430	ATAC	2	8	143274	143281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009430	CGTC	2	8	150354	150361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009430	CCCA	2	8	151880	151887	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_009430	CGGG	2	8	156191	156198	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009430	CCGG	2	8	156287	156294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009430	ATGG	2	8	157911	157918	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009430	GCGG	2	8	157990	157997	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009430	CGGG	2	8	158587	158594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009430	GCCG	2	8	159251	159258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009430	CGCC	2	8	159988	159995	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_009430	TGCG	2	8	161190	161197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009430	CCCG	2	8	161267	161274	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_009430	ATGA	2	8	161280	161287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009430	GCCC	2	8	163165	163172	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_009430	CCCG	2	8	163423	163430	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_009430	CGCC	2	8	163525	163532	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_009430	TCCG	2	8	163585	163592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009430	GGCA	2	8	163636	163643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009430	GTCC	2	8	163711	163718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009430	CGGG	2	8	164213	164220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009430	AGCG	2	8	165751	165758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009430	CATA	2	8	165782	165789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009430	TCCG	2	8	165802	165809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009430	GATG	2	8	167927	167934	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009430	CGGG	2	8	167950	167957	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009430	CCCG	2	8	169373	169380	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_009430	CCTC	2	8	171197	171204	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_009430	TCGA	2	8	172048	172055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009430	TCCG	2	8	172069	172076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009430	CGGG	2	8	173048	173055	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009430	GTCC	2	8	175938	175945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009430	GAAG	2	8	176096	176103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009430	TCCT	2	8	176763	176770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009430	TTCC	2	8	176814	176821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009430	CGGG	2	8	176911	176918	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009430	CCGC	2	8	177027	177034	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_009430	GCGG	2	8	183795	183802	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009430	GCCC	2	8	183886	183893	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_009430	GGTC	2	8	185835	185842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009430	TTTC	2	8	186217	186224	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009430	TGTT	2	8	186578	186585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009430	GACA	2	8	186635	186642	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009430	TGCA	2	8	191693	191700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009430	TGGG	2	8	191707	191714	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009430	CCCA	2	8	191896	191903	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_009430	AGAT	2	8	200994	201001	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009430	CCTT	2	8	202525	202532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009430	CGTG	2	8	203219	203226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009430	AGGA	2	8	203355	203362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009430	CCGC	2	8	203428	203435	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_009430	CCGC	2	8	206569	206576	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_009430	GAAG	2	8	206663	206670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009430	CTTC	2	8	206756	206763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009430	GCCG	2	8	208503	208510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009430	GCCC	2	8	208586	208593	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_009430	GGCA	2	8	212929	212936	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009430	GTCG	2	8	212947	212954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009430	CCGA	2	8	213055	213062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009430	ATGA	2	8	213136	213143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009430	TGCA	2	8	214094	214101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009430	AGTG	2	8	221487	221494	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009430	GGAG	2	8	221551	221558	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009430	TCCT	2	8	227332	227339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009430	TCGG	2	8	227436	227443	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009430	ACCC	2	8	229937	229944	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_009430	ACCG	2	8	230058	230065	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009430	CAGC	2	8	230993	231000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009430	GGAT	2	8	231157	231164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009430	CAGG	2	8	231269	231276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009430	GAAC	2	8	231940	231947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009430	AGAC	2	8	232032	232039	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009430	GGAT	2	8	232077	232084	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009430	GGCC	2	8	232751	232758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009430	CCGC	2	8	232867	232874	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_009430	TGCC	2	8	233567	233574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009430	CCGC	2	8	233688	233695	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_009430	TGCG	2	8	233739	233746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009430	GTCG	2	8	234288	234295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009430	ACCC	2	8	239652	239659	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_009430	CCGC	2	8	240775	240782	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_009430	ACGG	2	8	240824	240831	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009430	TTCC	2	8	242938	242945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009430	GGCA	2	8	243128	243135	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009430	TCCC	2	8	245625	245632	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_009430	CGCT	2	8	247654	247661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009430	CGAA	2	8	248621	248628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009430	GCCA	2	8	248720	248727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009430	TCCT	2	8	249859	249866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009430	TCGC	2	8	250744	250751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009430	AACC	2	8	250921	250928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009430	CAGG	2	8	252781	252788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009430	GCAG	2	8	253319	253326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009430	GGCC	2	8	253342	253349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009430	CGGG	2	8	253454	253461	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009430	TCCC	2	8	254028	254035	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_009430	GGGC	2	8	254972	254979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009430	GAGG	2	8	254996	255003	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009430	CGGC	2	8	262685	262692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009430	GGCA	2	8	262781	262788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009430	TATT	2	8	263542	263549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009430	GCCG	2	8	265196	265203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_009430	GTCC	2	8	266435	266442	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_009430	TGGG	2	8	268438	268445	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009430	AGCC	2	8	268495	268502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_009430	CGAT	2	8	269768	269775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_009430	GGCT	2	8	273955	273962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_009430	CAAT	3	12	273973	273984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_009430	CCCT	2	8	281668	281675	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
159	NC_009430	ACCC	2	8	284207	284214	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
160	NC_009430	CCGC	2	8	285994	286001	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
161	NC_009430	AACT	2	8	286468	286475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.