MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009429	CGGCG	2	10	1788	1797	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009429	ATCGC	2	10	18497	18506	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009429	CCCGG	2	10	27716	27725	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_009429	GCCGT	2	10	48043	48052	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009429	CGGCG	2	10	54421	54430	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009429	GCCCG	2	10	70179	70188	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_009429	CGGCG	2	10	82279	82288	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009429	GCGTC	2	10	82398	82407	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009429	GGCCG	2	10	89971	89980	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009429	GCCGC	2	10	101391	101400	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_009429	TCCGA	2	10	113055	113064	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009429	GCCGT	2	10	121224	121233	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009429	CCGGC	2	10	134260	134269	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_009429	CGGCC	2	10	134331	134340	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_009429	CGCGC	2	10	170868	170877	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_009429	TCCTA	2	10	173546	173555	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009429	CGGCG	2	10	175161	175170	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009429	CGGGG	2	10	182421	182430	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009429	CCGCG	2	10	183141	183150	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_009429	CCGGC	2	10	186813	186822	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_009429	CCGGG	2	10	187025	187034	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009429	GCCAT	2	10	190846	190855	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009429	GCCTC	2	10	192578	192587	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_009429	GCCGC	2	10	197314	197323	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_009429	CGGCC	2	10	197791	197800	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009429	CGGCC	2	10	212576	212585	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_009429	GGAGG	2	10	217497	217506	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009429	CCCGA	2	10	219250	219259	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_009429	GGGCC	2	10	221046	221055	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009429	AGGGA	2	10	234276	234285	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009429	GCGCC	2	10	248314	248323	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_009429	TATCT	2	10	259005	259014	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009429	GCAGC	2	10	259416	259425	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009429	ACAGC	2	10	259482	259491	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009429	TGGTC	2	10	259528	259537	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009429	CGGCC	2	10	262595	262604	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_009429	TGACC	2	10	263421	263430	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009429	GCGCA	2	10	264970	264979	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009429	CGCCT	2	10	265150	265159	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_009429	AGCCC	2	10	265756	265765	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_009429	TCGCG	2	10	266023	266032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009429	ACTGC	2	10	266133	266142	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009429	CTTCC	2	10	267432	267441	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_009429	CACAG	2	10	270842	270851	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009429	TTGCC	2	10	291520	291529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009429	GTCGC	2	10	293727	293736	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_009429	CCCGG	2	10	326010	326019	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_009429	TGGCA	2	10	326027	326036	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009429	GCGCG	2	10	326610	326619	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009429	CGTTT	2	10	327707	327716	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009429	AGCGC	2	10	328593	328602	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009429	CCGGG	2	10	331228	331237	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_009429	GTCAG	2	10	333221	333230	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009429	GGAAC	2	10	336022	336031	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009429	CGCGG	2	10	339633	339642	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009429	GCACG	2	10	356054	356063	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009429	TCGCC	2	10	356844	356853	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_009429	CTCGT	2	10	363332	363341	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009429	GCCCG	2	10	364749	364758	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_009429	CTGCC	3	15	364869	364883	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_009429	TCCGA	2	10	364911	364920	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_009429	GATCA	2	10	366217	366226	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009429	GGCGC	2	10	369923	369932	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_009429	CGGCG	2	10	369971	369980	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_009429	CGGCA	2	10	381622	381631	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009429	TCGGG	2	10	385114	385123	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009429	CTTCA	2	10	389119	389128	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_009429	TGCAG	2	10	390567	390576	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009429	CACGG	2	10	396143	396152	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009429	GGCAT	2	10	397722	397731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009429	CGGCT	2	10	401404	401413	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_009429	AAGCT	2	10	407033	407042	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009429	GCTCG	2	10	434086	434095	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009429	GCGCC	2	10	434147	434156	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_009429	ACGGC	2	10	434737	434746	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_009429	GCCCC	2	10	461961	461970	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
77	NC_009429	GGCCC	2	10	479249	479258	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_009429	GCGCC	2	10	482983	482992	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_009429	CGCAG	2	10	487751	487760	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009429	GGATC	2	10	491418	491427	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009429	CAGAG	2	10	495742	495751	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009429	CCCTA	2	10	508081	508090	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_009429	CCCGG	2	10	508137	508146	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_009429	CGGTG	2	10	514442	514451	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009429	GATCG	2	10	514788	514797	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009429	GATCG	2	10	514988	514997	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009429	CGGAT	2	10	515394	515403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009429	CGGCG	2	10	515674	515683	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_009429	AGGAA	2	10	516404	516413	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009429	GCAGA	2	10	531150	531159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009429	AGACG	2	10	542495	542504	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009429	CGGCC	2	10	542577	542586	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_009429	GCCGG	2	10	542949	542958	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009429	GCCCG	2	10	546764	546773	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_009429	ACCTT	2	10	546867	546876	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_009429	CCTTG	2	10	558997	559006	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_009429	GATCG	2	10	580947	580956	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009429	TCGTG	2	10	591368	591377	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009429	CTCGT	2	10	591850	591859	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_009429	GATCA	2	10	592518	592527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009429	TTGAA	2	10	594437	594446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009429	ATGTG	2	10	594659	594668	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009429	CTCAT	2	10	595066	595075	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_009429	ATCCC	2	10	595574	595583	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_009429	TAAGC	2	10	596139	596148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009429	GTGTC	2	10	612240	612249	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009429	CCGGA	2	10	638325	638334	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009429	AAGGG	2	10	644019	644028	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009429	GAAGG	2	10	650646	650655	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009429	CGGGC	2	10	667780	667789	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009429	GCGCC	2	10	667841	667850	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
112	NC_009429	GCGGG	2	10	672511	672520	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009429	GTCGC	2	10	673952	673961	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_009429	TCGGC	2	10	675662	675671	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009429	TCCGC	2	10	676063	676072	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_009429	GCATC	2	10	676187	676196	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_009429	GGTCC	2	10	681106	681115	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009429	AAACG	2	10	684370	684379	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009429	CGCGC	2	10	697942	697951	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_009429	CCGGC	2	10	711569	711578	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_009429	CGGGC	2	10	711829	711838	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_009429	TCGTG	2	10	718344	718353	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009429	CTCGT	2	10	718826	718835	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_009429	GATCA	2	10	719494	719503	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009429	TTGAA	2	10	721413	721422	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009429	ATGTG	2	10	721635	721644	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009429	CTCAT	2	10	722042	722051	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_009429	ATCCC	2	10	722550	722559	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_009429	CCCGA	2	10	724836	724845	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_009429	CCGCG	2	10	727663	727672	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_009429	GATGC	2	10	730348	730357	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009429	CGGGG	2	10	734616	734625	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009429	GTCGC	2	10	752844	752853	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_009429	GCGAC	2	10	762180	762189	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_009429	TGGCG	2	10	776439	776448	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009429	GGCCC	2	10	786999	787008	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_009429	GCCAA	2	10	790887	790896	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_009429	CAAGT	2	10	799275	799284	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009429	CTCGT	2	10	801723	801732	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_009429	GCCGA	2	10	802249	802258	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_009429	CGGCG	2	10	802500	802509	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_009429	CGGGG	2	10	803472	803481	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009429	TCGGG	2	10	813308	813317	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009429	CCCTC	2	10	820686	820695	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
145	NC_009429	GGCCG	2	10	822831	822840	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_009429	CCGGA	2	10	823551	823560	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_009429	CGACG	2	10	831262	831271	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_009429	CACGC	2	10	832934	832943	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
149	NC_009429	CCGGC	2	10	852979	852988	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
150	NC_009429	GGGCG	2	10	860583	860592	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.