MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 chromosome

Total Repeats: 1161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009428	CCAT	2	8	2264	2271	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009428	AAGG	2	8	7659	7666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009428	ATCT	2	8	9782	9789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009428	GGCC	2	8	32869	32876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009428	CCGG	2	8	38733	38740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009428	GCCC	2	8	43274	43281	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_009428	AGGG	2	8	55101	55108	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009428	CTTC	2	8	63351	63358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009428	CGGA	2	8	63612	63619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009428	CGGC	3	12	66547	66558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009428	GGAT	2	8	76138	76145	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009428	CGCC	2	8	77212	77219	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_009428	TCCC	2	8	80802	80809	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_009428	GCGG	2	8	82440	82447	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009428	AAAG	2	8	89501	89508	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009428	GGCC	2	8	94468	94475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009428	AGCA	2	8	99628	99635	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009428	AGGT	2	8	101120	101127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009428	TGAG	2	8	101474	101481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009428	TATC	2	8	101484	101491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009428	ATCG	2	8	102609	102616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009428	CCGG	2	8	108533	108540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009428	TCAT	2	8	108704	108711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009428	GCCC	2	8	108850	108857	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_009428	GACG	2	8	108951	108958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009428	GGAT	2	8	112396	112403	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009428	ACGA	2	8	112427	112434	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009428	GCCA	2	8	115740	115747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009428	CGGA	2	8	127552	127559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009428	GACC	2	8	135732	135739	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009428	CGAC	2	8	141191	141198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009428	GCAG	2	8	141208	141215	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009428	TCGC	2	8	145420	145427	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009428	CCGG	2	8	145484	145491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009428	CGGC	2	8	149234	149241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009428	CGAA	2	8	154922	154929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009428	GCGG	2	8	156429	156436	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009428	GCCT	2	8	157188	157195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009428	CCGG	2	8	158652	158659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009428	CGGC	2	8	160430	160437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009428	GCGG	2	8	160875	160882	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009428	CGGA	2	8	161254	161261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009428	GCGG	2	8	164228	164235	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009428	GGCA	2	8	168284	168291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009428	TCGG	2	8	169959	169966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009428	CACC	2	8	171344	171351	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_009428	CGGC	2	8	172286	172293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009428	CGGG	2	8	172374	172381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009428	CGGG	2	8	172392	172399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009428	TGCC	2	8	179757	179764	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009428	CGGA	2	8	179825	179832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009428	CCGG	2	8	182656	182663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009428	CCGG	2	8	182681	182688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009428	GGCC	2	8	183872	183879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009428	GGGC	2	8	184791	184798	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009428	GGAT	2	8	188362	188369	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009428	GCGG	2	8	191804	191811	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009428	GCGG	2	8	192083	192090	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009428	CGGG	2	8	199465	199472	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009428	TGCG	2	8	205787	205794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009428	CGTC	2	8	205831	205838	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009428	TGCC	2	8	205999	206006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009428	CGAC	2	8	211406	211413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009428	TGCC	2	8	215332	215339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009428	CAGG	2	8	217628	217635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009428	CGGG	2	8	217674	217681	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009428	GGGC	2	8	217700	217707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009428	TTTC	2	8	226052	226059	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009428	CGGA	2	8	226115	226122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009428	ATTT	2	8	227440	227447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009428	GCCC	2	8	234332	234339	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_009428	GGGC	2	8	236361	236368	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009428	GCCC	2	8	236386	236393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_009428	CCTT	2	8	237449	237456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009428	GCCC	2	8	247384	247391	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_009428	GGGC	2	8	247399	247406	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009428	GGCC	2	8	250376	250383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009428	TGCG	2	8	250409	250416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009428	CCCG	2	8	254167	254174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_009428	CGTG	2	8	254247	254254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009428	GCCT	2	8	276271	276278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009428	CCAC	2	8	276300	276307	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_009428	GCCC	2	8	281809	281816	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_009428	CGCC	2	8	286593	286600	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_009428	GGCG	2	8	301664	301671	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009428	GCCT	2	8	303895	303902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009428	GTCC	2	8	305082	305089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009428	ATGG	2	8	305142	305149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009428	CAAG	2	8	305297	305304	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009428	TAGC	2	8	305603	305610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009428	TGCC	2	8	306837	306844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009428	CCGG	2	8	308198	308205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009428	CCCG	2	8	310638	310645	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_009428	GCCG	2	8	310754	310761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009428	GGGT	2	8	311551	311558	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009428	CGAC	2	8	311652	311659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009428	AGCG	2	8	311698	311705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009428	CCCT	2	8	311732	311739	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_009428	GACG	2	8	312687	312694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009428	GCCG	2	8	313171	313178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009428	TCGG	2	8	313514	313521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009428	CCTT	2	8	315813	315820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009428	CCGC	2	8	321029	321036	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_009428	CGGC	2	8	321075	321082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009428	CCTG	2	8	323428	323435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009428	GCCG	2	8	335389	335396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009428	GCTG	2	8	336660	336667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009428	GGTC	2	8	336686	336693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009428	GGTG	2	8	336728	336735	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009428	GCCG	2	8	336747	336754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009428	GCGG	2	8	336833	336840	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009428	GTCC	2	8	337616	337623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009428	TCGG	2	8	337635	337642	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009428	CCAC	2	8	338610	338617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_009428	CCGT	2	8	343359	343366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009428	TTCC	2	8	346998	347005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009428	CGAG	2	8	347702	347709	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009428	GCCG	2	8	352047	352054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009428	GCCC	2	8	352055	352062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_009428	CTGG	2	8	352595	352602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009428	AAGG	2	8	355546	355553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009428	CGGG	2	8	359046	359053	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009428	CGGG	2	8	359136	359143	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009428	CGGG	2	8	359151	359158	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009428	GGCG	2	8	361755	361762	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009428	CGGG	2	8	367196	367203	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009428	CGCC	2	8	370999	371006	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_009428	CCGC	2	8	371094	371101	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_009428	CATC	2	8	381394	381401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009428	CTGC	2	8	384637	384644	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009428	GGGA	2	8	384651	384658	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009428	GCAC	2	8	386930	386937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009428	CCCG	2	8	386954	386961	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_009428	GGTC	2	8	391143	391150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009428	TCGG	2	8	395238	395245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009428	GCGG	2	8	395270	395277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009428	TGCC	2	8	395334	395341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009428	GCGG	2	8	396817	396824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009428	CCGG	2	8	399283	399290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009428	CCCG	2	8	403031	403038	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_009428	GCCG	2	8	403041	403048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009428	GCTG	2	8	403055	403062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009428	GCCG	3	12	403126	403137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009428	GCCC	3	12	405282	405293	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145	NC_009428	GGCC	2	8	405330	405337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009428	CGGG	2	8	410005	410012	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009428	CCGG	2	8	414070	414077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009428	CGGG	2	8	416670	416677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009428	TGGC	2	8	419065	419072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009428	GCGT	2	8	420596	420603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009428	CCTC	2	8	420777	420784	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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485	NC_009428	GGCG	2	8	1280226	1280233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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487	NC_009428	CGCC	2	8	1286737	1286744	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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489	NC_009428	GCCC	2	8	1288110	1288117	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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492	NC_009428	GCCG	2	8	1296137	1296144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_009428	CGAG	2	8	1313310	1313317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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