MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 chromosome 1

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009049	ACGGAA	2	12	61231	61242	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009049	GCGGGA	2	12	74386	74397	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009049	GCCAGC	2	12	89549	89560	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009049	TCCGGG	2	12	92141	92152	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009049	CGCCAT	2	12	96214	96225	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009049	CCGAGG	2	12	122645	122656	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009049	GCCGCG	2	12	125907	125918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009049	TCTGCC	2	12	135590	135601	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009049	GCGCGG	2	12	220692	220703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009049	CCGGAA	2	12	222480	222491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009049	GGCTTG	2	12	227726	227737	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009049	GCCCGC	2	12	269427	269438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_009049	CGGCCC	2	12	276207	276218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009049	CCGGGC	2	12	279750	279761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009049	TCGAAC	2	12	295069	295080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009049	TCTGGA	2	12	312912	312923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009049	CTGCGG	2	12	313917	313928	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009049	CCCCTG	2	12	348854	348865	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_009049	TAAGGC	2	12	349306	349317	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009049	CCCCTG	2	12	367531	367542	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009049	TAAGGC	2	12	367983	367994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009049	CTTTTT	2	12	399899	399910	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009049	GCGGCC	2	12	423622	423633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009049	CGGACG	2	12	423690	423701	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009049	CGGGTT	2	12	445349	445360	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009049	GACCGT	2	12	446925	446936	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009049	GTCCGC	2	12	483682	483693	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009049	AGCGGG	2	12	487935	487946	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009049	GGGGGC	2	12	511577	511588	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009049	GGGCGC	2	12	515672	515683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009049	GCCCTT	2	12	518876	518887	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009049	CGGTGC	2	12	537120	537131	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009049	GCGGCC	2	12	538094	538105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009049	CGGCCG	2	12	607993	608004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009049	CTGGCT	2	12	626700	626711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009049	CTCGAT	2	12	631370	631381	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009049	GGCCTC	2	12	643448	643459	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009049	GCACCC	2	12	655030	655041	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009049	ACCGAG	2	12	673964	673975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009049	GGCCCG	2	12	674023	674034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009049	CCGGTT	2	12	682024	682035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009049	GCGGTC	2	12	708397	708408	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009049	GGTTCC	2	12	713662	713673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009049	GGCGCG	2	12	734952	734963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009049	GCCATG	2	12	750734	750745	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009049	CTCTCC	2	12	790271	790282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009049	GGGCGC	2	12	809938	809949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009049	TTTTCG	2	12	883299	883310	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009049	CCCGCG	2	12	885849	885860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_009049	TTGACG	2	12	899352	899363	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009049	GGAGGG	2	12	915070	915081	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009049	GCGGGG	2	12	918479	918490	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009049	CGTCCG	2	12	927547	927558	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009049	GCCCCG	2	12	944514	944525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009049	GGCCGG	2	12	944992	945003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009049	CGGAGG	2	12	948733	948744	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009049	GCGCGG	2	12	969149	969160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009049	GCAAGG	21	126	987890	988015	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009049	TTGGTG	2	12	988184	988195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009049	CGGGCG	2	12	988921	988932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009049	CCCGTT	2	12	989062	989073	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009049	TGCCGG	2	12	1037350	1037361	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009049	CGCGGA	2	12	1192430	1192441	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009049	TCACCC	2	12	1252482	1252493	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009049	AAGGGA	2	12	1267209	1267220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009049	CGGGCG	2	12	1281216	1281227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009049	TCCCGG	2	12	1286644	1286655	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009049	GATGCG	2	12	1295899	1295910	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009049	CCGCGC	2	12	1328476	1328487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009049	CGAAGC	2	12	1352591	1352602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009049	GAACGG	2	12	1376599	1376610	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009049	TGCCAC	2	12	1377067	1377078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009049	CCCGGG	2	12	1383361	1383372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009049	CAGCCG	2	12	1388900	1388911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009049	CGGGCC	2	12	1449510	1449521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009049	CGGCCT	2	12	1459390	1459401	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009049	CCGGCC	2	12	1461624	1461635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009049	AGGCGC	2	12	1506497	1506508	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009049	GCCGGG	2	12	1554510	1554521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009049	CCGGCC	2	12	1558077	1558088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009049	CCCTCT	2	12	1612709	1612720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009049	GGCAGG	2	12	1641075	1641086	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009049	GCACCT	2	12	1648409	1648420	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009049	GCCCGC	2	12	1707493	1707504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009049	GGTCCC	2	12	1718493	1718504	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009049	CAAAAG	2	12	1725367	1725378	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009049	GACGGC	2	12	1745740	1745751	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009049	CGGCCC	2	12	1765343	1765354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009049	GCCCCT	2	12	1827663	1827674	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009049	GCGGGC	2	12	1868995	1869006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009049	CCCCCG	2	12	1874032	1874043	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_009049	GCATCG	2	12	1874304	1874315	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009049	GCCGGC	2	12	1887438	1887449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009049	CGAAGC	2	12	1893313	1893324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009049	GCGGGG	2	12	1897630	1897641	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009049	GGCAAG	2	12	1909890	1909901	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009049	GCCCCC	2	12	1929365	1929376	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
98	NC_009049	GCGAAG	2	12	1954840	1954851	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009049	TGTCGA	2	12	1955388	1955399	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009049	TCGGAA	2	12	2042759	2042770	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009049	CCTGCC	2	12	2050800	2050811	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009049	CGCCGG	2	12	2058251	2058262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009049	GCGCGG	2	12	2061355	2061366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009049	TAGCGG	2	12	2069116	2069127	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009049	CCGCCC	2	12	2111129	2111140	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
106	NC_009049	CTGCCG	2	12	2115602	2115613	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009049	CCCTTT	2	12	2121124	2121135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009049	ATCGTG	2	12	2146044	2146055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_009049	TGCGGC	2	12	2256620	2256631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009049	CGGGCG	2	12	2263283	2263294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009049	GGCTTC	3	18	2273859	2273876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009049	CTTCCA	2	12	2280867	2280878	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009049	CCCCGC	2	12	2340756	2340767	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
114	NC_009049	TCCCCC	2	12	2368759	2368770	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
115	NC_009049	CGGGGC	2	12	2373828	2373839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009049	CGTCTC	2	12	2385145	2385156	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009049	GGTTCA	2	12	2435467	2435478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_009049	CCGGGC	2	12	2472972	2472983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009049	TCTGCC	2	12	2488190	2488201	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009049	GGCCCG	2	12	2499093	2499104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009049	GCGCCC	2	12	2568989	2569000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009049	CGCCCC	2	12	2577978	2577989	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
123	NC_009049	CATTCC	2	12	2611330	2611341	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009049	CCTCCC	2	12	2612968	2612979	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
125	NC_009049	GCCCGG	2	12	2616549	2616560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009049	GGGCGC	2	12	2654928	2654939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009049	AAGGGG	2	12	2656455	2656466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009049	GCAGGA	2	12	2658670	2658681	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009049	GAACCG	2	12	2662606	2662617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009049	CTTTGC	2	12	2665364	2665375	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009049	CCCGAG	2	12	2680357	2680368	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009049	GGGCGC	2	12	2683383	2683394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009049	CCTTTC	2	12	2707778	2707789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009049	GGCGCG	2	12	2736905	2736916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009049	CCGCGC	2	12	2736924	2736935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_009049	GCCCGC	2	12	2806491	2806502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009049	CTCCGG	2	12	2816424	2816435	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009049	GCCCTT	2	12	2879108	2879119	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009049	AGGCCG	2	12	2880096	2880107	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009049	TTGATA	2	12	2881486	2881497	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009049	GCCGGG	2	12	2980203	2980214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009049	CCGAGG	2	12	3004214	3004225	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009049	GCGGCA	2	12	3129232	3129243	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.