MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 chromosome 1

Total Repeats: 462

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009049	GGTGG	2	10	9798	9807	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009049	CAAAG	2	10	14182	14191	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009049	CAGGG	2	10	19163	19172	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009049	CGGGG	2	10	21452	21461	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009049	GGCGG	2	10	32779	32788	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009049	AGGTG	2	10	38354	38363	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009049	CCGCA	2	10	45914	45923	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_009049	CGGCA	2	10	65904	65913	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009049	CGTTC	2	10	68157	68166	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009049	GATCG	2	10	82305	82314	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009049	TGTGG	2	10	87286	87295	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009049	TCGTG	2	10	88778	88787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009049	GATCA	2	10	89891	89900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009049	CTCAT	2	10	92438	92447	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009049	ATCCC	2	10	92946	92955	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_009049	TCGGC	2	10	95942	95951	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009049	CGGCT	2	10	97339	97348	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009049	TCCGG	2	10	122815	122824	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009049	GCCGT	2	10	122936	122945	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009049	CTGGC	2	10	123347	123356	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009049	CCGGC	2	10	123626	123635	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009049	GAGTC	2	10	125391	125400	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009049	GCGCC	2	10	131851	131860	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_009049	GATCG	2	10	141243	141252	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009049	CCGGG	2	10	154538	154547	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009049	GCGGA	2	10	154584	154593	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009049	TTCCG	2	10	168399	168408	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009049	CGGTC	2	10	173048	173057	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009049	GCCTT	2	10	173087	173096	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009049	GGACG	2	10	189367	189376	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009049	TCGAA	2	10	206314	206323	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009049	GTCGG	2	10	223543	223552	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009049	CATGC	2	10	226466	226475	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009049	CCGCG	2	10	227715	227724	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_009049	GCGCG	2	10	232122	232131	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009049	TCCTG	2	10	236761	236770	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009049	GCGCC	2	10	244842	244851	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_009049	GGGAG	2	10	261744	261753	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009049	CGGGT	2	10	266901	266910	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009049	AAGGG	2	10	279663	279672	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009049	CCTCC	2	10	283318	283327	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
42	NC_009049	CGGGG	2	10	297516	297525	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009049	GGCGC	2	10	309138	309147	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009049	GAAAG	2	10	311367	311376	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009049	GGCGG	2	10	319023	319032	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009049	GTCGG	2	10	342767	342776	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009049	CGGAC	2	10	349891	349900	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_009049	AGAGG	2	10	349930	349939	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009049	CTGTC	2	10	351157	351166	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009049	CCTTT	2	10	361056	361065	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_009049	TCGCG	2	10	361134	361143	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009049	CACCC	2	10	365376	365385	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
53	NC_009049	CGGAC	2	10	368568	368577	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_009049	AGAGG	2	10	368607	368616	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009049	CTGTC	2	10	369834	369843	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009049	CCTTT	2	10	379733	379742	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009049	TCGCG	2	10	379811	379820	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_009049	CACCC	2	10	384053	384062	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
59	NC_009049	CGCAC	2	10	399391	399400	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_009049	GGGAT	2	10	399941	399950	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009049	TTGAC	2	10	405757	405766	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009049	GAACC	2	10	409649	409658	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_009049	CGCGG	2	10	411091	411100	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_009049	CCGGG	2	10	411126	411135	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_009049	GCGGT	2	10	412578	412587	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009049	TCCCG	2	10	415019	415028	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_009049	GTTTC	2	10	415204	415213	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009049	GAAAG	2	10	420851	420860	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009049	CGGCA	2	10	427957	427966	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009049	GTCCT	2	10	429018	429027	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009049	CGGGC	2	10	430991	431000	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_009049	TTGCC	2	10	440075	440084	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_009049	GGACC	2	10	453691	453700	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009049	GTCGG	2	10	456929	456938	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009049	CCGGG	2	10	457564	457573	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_009049	CCGAT	2	10	481833	481842	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_009049	GCTCG	2	10	481908	481917	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_009049	CGGCG	2	10	487021	487030	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_009049	GCGTG	2	10	490353	490362	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009049	CCCGG	2	10	494129	494138	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_009049	GGCGC	2	10	496675	496684	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_009049	GCGCC	2	10	518804	518813	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_009049	ATTGC	2	10	566585	566594	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009049	CTGCC	2	10	585350	585359	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_009049	AAGGA	2	10	587279	587288	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009049	CGGCC	2	10	587399	587408	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_009049	GGGCG	2	10	590187	590196	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009049	AATTG	2	10	593335	593344	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009049	GCGCT	2	10	625692	625701	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_009049	GCGCC	2	10	626669	626678	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
91	NC_009049	CCTCG	2	10	626964	626973	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_009049	CCGCG	2	10	631285	631294	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_009049	CGCGG	2	10	631410	631419	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009049	CGCTG	2	10	633408	633417	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_009049	CCGAT	2	10	634073	634082	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_009049	CGTGC	2	10	691967	691976	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_009049	GGCGC	2	10	696817	696826	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_009049	GCCGA	2	10	702599	702608	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_009049	AGGGC	2	10	702639	702648	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009049	CCTGG	2	10	708992	709001	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009049	CCCGC	2	10	730452	730461	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
102	NC_009049	CCCGA	2	10	730515	730524	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_009049	TTTCG	2	10	740092	740101	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009049	GGGCC	2	10	745470	745479	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009049	GGGCC	2	10	749549	749558	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_009049	CGCCC	2	10	753047	753056	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
107	NC_009049	AGAGG	2	10	753830	753839	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009049	TCTGA	2	10	758132	758141	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009049	TGGCT	2	10	787273	787282	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009049	CATGC	2	10	787301	787310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009049	AGGGG	2	10	787445	787454	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009049	GGGCA	2	10	789458	789467	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009049	CGGTC	2	10	789659	789668	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_009049	TCCGT	2	10	790338	790347	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009049	TGCCG	2	10	805903	805912	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009049	CGGGG	2	10	808852	808861	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009049	GCCCC	2	10	808882	808891	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
118	NC_009049	TTCGG	2	10	823860	823869	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009049	CGGCG	2	10	826660	826669	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_009049	CAGGA	2	10	831017	831026	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009049	GCTCT	2	10	849638	849647	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_009049	CGGGG	2	10	850935	850944	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009049	GGAAG	2	10	857359	857368	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009049	CCGCG	2	10	865885	865894	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_009049	CCGGC	2	10	875602	875611	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_009049	GGCCC	2	10	881821	881830	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_009049	CCCTT	2	10	882773	882782	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_009049	TCCGG	2	10	882787	882796	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_009049	ACGTG	2	10	899367	899376	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009049	GCAGG	2	10	918401	918410	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009049	TCCGG	2	10	927629	927638	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_009049	CGGAC	2	10	932887	932896	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_009049	AGGGC	2	10	940255	940264	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009049	CCGCC	2	10	948807	948816	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
135	NC_009049	CAGGT	2	10	953751	953760	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009049	CGGGC	2	10	963294	963303	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_009049	CGGCT	2	10	963305	963314	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_009049	TTCGG	2	10	970358	970367	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009049	CAGGG	2	10	993059	993068	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009049	GTCGG	2	10	996849	996858	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009049	GTCGC	2	10	997858	997867	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_009049	ACGAT	2	10	997979	997988	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009049	TCCTG	2	10	1000528	1000537	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_009049	CCTTT	2	10	1001463	1001472	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_009049	AGGGG	2	10	1007592	1007601	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009049	GACCT	2	10	1007662	1007671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_009049	CGGGG	2	10	1007821	1007830	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_009049	CCCTG	2	10	2654775	2654784	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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421	NC_009049	CCGCG	2	10	2725334	2725343	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
422	NC_009049	GGGCG	2	10	2727780	2727789	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
423	NC_009049	GCCCC	2	10	2738973	2738982	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
424	NC_009049	GCGCC	2	10	2746472	2746481	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
425	NC_009049	CGGCG	2	10	2746491	2746500	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
426	NC_009049	CCGCG	2	10	2746772	2746781	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
427	NC_009049	GATCC	2	10	2746931	2746940	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
428	NC_009049	TGTCC	2	10	2751550	2751559	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
429	NC_009049	GCGCC	2	10	2751577	2751586	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
430	NC_009049	CGGTC	2	10	2758718	2758727	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
431	NC_009049	GGCGA	2	10	2768364	2768373	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
432	NC_009049	CCCGT	2	10	2786194	2786203	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
433	NC_009049	GCCGC	2	10	2786216	2786225	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
434	NC_009049	GCCCG	2	10	2786230	2786239	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
435	NC_009049	GCCCG	2	10	2794920	2794929	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
436	NC_009049	TGTCG	2	10	2811972	2811981	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
437	NC_009049	GGGGC	2	10	2814343	2814352	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
438	NC_009049	CCCCG	2	10	2817653	2817662	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
439	NC_009049	CCCGC	2	10	2824040	2824049	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
440	NC_009049	CCCGC	2	10	2841371	2841380	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
441	NC_009049	GCCCC	2	10	2844909	2844918	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
442	NC_009049	TGTCT	2	10	2846007	2846016	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
443	NC_009049	GGACG	2	10	2858925	2858934	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
444	NC_009049	CGGCG	2	10	2879191	2879200	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
445	NC_009049	CGGGG	2	10	2909898	2909907	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
446	NC_009049	GCGGG	2	10	2911016	2911025	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
447	NC_009049	GCCCT	2	10	2913208	2913217	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
448	NC_009049	TCCCG	2	10	2914560	2914569	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
449	NC_009049	CTTTC	2	10	2915518	2915527	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
450	NC_009049	CAGGA	2	10	2916070	2916079	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
451	NC_009049	GCCCG	2	10	2920960	2920969	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
452	NC_009049	CGGCG	2	10	2950629	2950638	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
453	NC_009049	GGCCC	2	10	2959608	2959617	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
454	NC_009049	TTGAC	2	10	2980159	2980168	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
455	NC_009049	CGTCT	2	10	2983117	2983126	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
456	NC_009049	AAAGT	2	10	2996858	2996867	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
457	NC_009049	AAGAA	2	10	3052026	3052035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
458	NC_009049	TTTGA	2	10	3074161	3074170	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
459	NC_009049	GTGAG	2	10	3074324	3074333	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
460	NC_009049	AACGG	2	10	3074352	3074361	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
461	NC_009049	CGGGG	2	10	3077749	3077758	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
462	NC_009049	CGGAT	2	10	3100385	3100394	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.