MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 plasmid pRSPH01

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009040	GGGA	2	8	6827	6834	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009040	CGCC	2	8	6840	6847	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009040	CCGC	2	8	19430	19437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_009040	CCGG	2	8	19491	19498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009040	CGTC	2	8	19687	19694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009040	GCAG	2	8	19884	19891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009040	GAGC	2	8	22900	22907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009040	CGCC	2	8	25058	25065	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_009040	GCCG	2	8	25104	25111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009040	CGGG	2	8	25408	25415	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009040	GCCG	2	8	25419	25426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009040	GACG	2	8	25688	25695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009040	CATT	2	8	26566	26573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009040	CTGG	2	8	31366	31373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009040	GGGC	2	8	31378	31385	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009040	GGGC	2	8	31429	31436	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009040	GGCA	2	8	31511	31518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009040	GCCC	2	8	33262	33269	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_009040	CGGC	2	8	34384	34391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009040	CGGT	2	8	37719	37726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009040	GGGC	2	8	38792	38799	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009040	GGGC	2	8	38817	38824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009040	CGAC	2	8	38841	38848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009040	CCCG	2	8	38901	38908	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_009040	GGGC	2	8	39494	39501	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009040	GCCC	2	8	39900	39907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_009040	GCCC	2	8	40180	40187	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_009040	GAGG	2	8	40213	40220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009040	CGAC	2	8	47366	47373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009040	TCCG	2	8	47882	47889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009040	ATGA	2	8	48105	48112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009040	AATT	2	8	48535	48542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009040	GGCC	2	8	48750	48757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009040	TGGC	2	8	49566	49573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009040	GCGG	2	8	49677	49684	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009040	GCTG	2	8	49694	49701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009040	CTGG	2	8	49754	49761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009040	AACG	2	8	49886	49893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009040	CCAA	2	8	50137	50144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009040	ATGA	2	8	50272	50279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009040	GTCC	2	8	50879	50886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009040	GCTC	2	8	56782	56789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009040	CCGG	2	8	59891	59898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009040	GACC	2	8	60460	60467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009040	CAGG	2	8	61572	61579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009040	GACC	2	8	61761	61768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009040	CGGA	2	8	65873	65880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009040	CGTC	2	8	69596	69603	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009040	CAGT	2	8	70838	70845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009040	CGGA	2	8	70860	70867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009040	TTCC	2	8	71003	71010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009040	GTCG	2	8	71870	71877	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009040	CCGG	2	8	72945	72952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009040	GCCT	2	8	78650	78657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009040	GGGA	2	8	81236	81243	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009040	CCGG	2	8	82472	82479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009040	CCGG	2	8	83529	83536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009040	CGCC	2	8	89491	89498	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_009040	GGGA	2	8	91677	91684	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009040	CGGG	2	8	100508	100515	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009040	CCAT	2	8	100670	100677	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009040	CGGA	2	8	102518	102525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009040	CCCG	2	8	105262	105269	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_009040	GCCC	2	8	105552	105559	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_009040	GCGG	2	8	105874	105881	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009040	GCGG	2	8	105905	105912	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009040	CCCG	2	8	109425	109432	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_009040	GCCG	2	8	109519	109526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009040	CGGG	2	8	110042	110049	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009040	CGGG	2	8	110065	110072	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009040	CGGG	2	8	110090	110097	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009040	GTCC	2	8	110123	110130	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009040	CGGG	2	8	110762	110769	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009040	GACC	2	8	110795	110802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009040	CCGG	2	8	110986	110993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009040	TCTT	2	8	111155	111162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009040	TGGC	2	8	111189	111196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009040	CGCC	2	8	111770	111777	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_009040	CGGG	2	8	112484	112491	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009040	CGGC	2	8	114229	114236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009040	CCGC	2	8	114371	114378	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_009040	GCCC	2	8	119283	119290	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.