MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 16926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008435	CG	3	6	3231088	3231093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10002	NC_008435	CGCGA	2	10	3233519	3233528	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10003	NC_008435	CCT	2	6	3233862	3233867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10004	NC_008435	GC	3	6	3234630	3234635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_008435	GC	3	6	3234678	3234683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10006	NC_008435	GTC	2	6	3234697	3234702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_008435	ATTT	2	8	3235574	3235581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_008435	CG	3	6	3235638	3235643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_008435	CGG	2	6	3237354	3237359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_008435	CG	3	6	3237417	3237422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_008435	CG	3	6	3237426	3237431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_008435	CGCC	2	8	3237987	3237994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10013	NC_008435	GC	4	8	3238011	3238018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10014	NC_008435	TCGA	2	8	3238051	3238058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10015	NC_008435	GCC	2	6	3238089	3238094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10016	NC_008435	GC	3	6	3238095	3238100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10017	NC_008435	AATCA	2	10	3238232	3238241	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10018	NC_008435	AGC	2	6	3238363	3238368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_008435	ACG	2	6	3239152	3239157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_008435	GGCC	2	8	3239174	3239181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_008435	TTC	2	6	3239277	3239282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_008435	CCGG	2	8	3239300	3239307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10023	NC_008435	CG	3	6	3239346	3239351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10024	NC_008435	TCC	3	9	3242504	3242512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_008435	CGCA	2	8	3242552	3242559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10026	NC_008435	T	6	6	3242562	3242567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_008435	TGAG	2	8	3242608	3242615	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_008435	CGGT	2	8	3242667	3242674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10029	NC_008435	TCG	2	6	3242722	3242727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_008435	CTC	2	6	3242803	3242808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10031	NC_008435	ATT	2	6	3242976	3242981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_008435	GAAGCC	2	12	3243060	3243071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_008435	CATT	3	12	3243101	3243112	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10034	NC_008435	TCA	2	6	3243195	3243200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_008435	TGG	2	6	3243210	3243215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_008435	TGG	2	6	3243274	3243279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_008435	CAG	2	6	3243358	3243363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_008435	TGAG	2	8	3243702	3243709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_008435	CGAG	2	8	3243735	3243742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10040	NC_008435	TCGT	2	8	3243779	3243786	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10041	NC_008435	CGG	2	6	3243822	3243827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_008435	CGA	2	6	3243902	3243907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_008435	CT	3	6	3244230	3244235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10044	NC_008435	CGC	2	6	3244867	3244872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_008435	CTGC	2	8	3244873	3244880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10046	NC_008435	GCG	2	6	3244887	3244892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_008435	GC	3	6	3244918	3244923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_008435	GGC	2	6	3245560	3245565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_008435	CGC	3	9	3245753	3245761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10050	NC_008435	GAT	2	6	3245886	3245891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_008435	GAC	2	6	3246701	3246706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_008435	GCG	2	6	3246818	3246823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_008435	GC	3	6	3247254	3247259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10054	NC_008435	A	6	6	3247298	3247303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_008435	GC	3	6	3247327	3247332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10056	NC_008435	GC	4	8	3247596	3247603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10057	NC_008435	GGGC	2	8	3247866	3247873	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10058	NC_008435	TTC	2	6	3247879	3247884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_008435	TCG	2	6	3248027	3248032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_008435	CCCG	2	8	3248055	3248062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10061	NC_008435	GC	4	8	3248133	3248140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10062	NC_008435	GCG	2	6	3248186	3248191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_008435	GA	3	6	3248192	3248197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_008435	CGC	2	6	3248213	3248218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10065	NC_008435	CG	3	6	3248228	3248233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10066	NC_008435	GAC	2	6	3248243	3248248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_008435	CGG	2	6	3248424	3248429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_008435	CGC	2	6	3248437	3248442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_008435	AGC	2	6	3248491	3248496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_008435	CG	3	6	3248559	3248564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10071	NC_008435	CAA	2	6	3248588	3248593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_008435	TGG	2	6	3248594	3248599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_008435	CCA	2	6	3248615	3248620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10074	NC_008435	TCG	2	6	3248628	3248633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_008435	TGCG	2	8	3248653	3248660	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10076	NC_008435	GTG	2	6	3248687	3248692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_008435	CGC	2	6	3248811	3248816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10078	NC_008435	ATCGC	2	10	3248867	3248876	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10079	NC_008435	TCG	2	6	3248901	3248906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_008435	GCC	2	6	3248922	3248927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10081	NC_008435	AAGC	2	8	3249974	3249981	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10082	NC_008435	CG	3	6	3249995	3250000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10083	NC_008435	GCT	2	6	3250003	3250008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_008435	GC	3	6	3250050	3250055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10085	NC_008435	CGA	2	6	3250066	3250071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_008435	GCA	2	6	3250080	3250085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_008435	TCG	2	6	3250114	3250119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_008435	GGGT	2	8	3250239	3250246	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_008435	GTTG	2	8	3250274	3250281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_008435	GC	3	6	3250609	3250614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10091	NC_008435	CG	4	8	3250641	3250648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10092	NC_008435	GCCC	3	12	3250664	3250675	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10093	NC_008435	TCC	2	6	3251077	3251082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10094	NC_008435	GCC	2	6	3251139	3251144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10095	NC_008435	CGA	2	6	3251191	3251196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_008435	GC	3	6	3251291	3251296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10097	NC_008435	CCGCT	2	10	3251323	3251332	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10098	NC_008435	CGC	2	6	3251333	3251338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10099	NC_008435	GA	3	6	3251370	3251375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_008435	CGG	2	6	3252330	3252335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_008435	CAT	2	6	3252341	3252346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_008435	CG	3	6	3252362	3252367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_008435	ACT	2	6	3252378	3252383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_008435	GTT	2	6	3252502	3252507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_008435	GCA	2	6	3252616	3252621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_008435	CGA	2	6	3252664	3252669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_008435	TCC	2	6	3252678	3252683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10108	NC_008435	CGCC	2	8	3252895	3252902	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10109	NC_008435	CGG	2	6	3252906	3252911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_008435	CG	3	6	3252934	3252939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10111	NC_008435	ACA	2	6	3254419	3254424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_008435	AG	3	6	3258326	3258331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_008435	GC	3	6	3258343	3258348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10114	NC_008435	GGCC	2	8	3258844	3258851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_008435	CG	3	6	3258866	3258871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10116	NC_008435	CGC	2	6	3258901	3258906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10117	NC_008435	CGC	2	6	3258909	3258914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10118	NC_008435	GGGC	2	8	3258940	3258947	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10119	NC_008435	GC	3	6	3259973	3259978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_008435	GC	3	6	3259984	3259989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10121	NC_008435	TGT	2	6	3260006	3260011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_008435	CG	3	6	3260041	3260046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10123	NC_008435	GCCC	2	8	3260059	3260066	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10124	NC_008435	GAT	2	6	3260084	3260089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_008435	GAC	2	6	3261031	3261036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_008435	T	6	6	3264671	3264676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_008435	GC	3	6	3264726	3264731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10128	NC_008435	GCG	2	6	3264744	3264749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_008435	CGA	2	6	3265204	3265209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_008435	CGC	2	6	3266577	3266582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10131	NC_008435	CCAAA	2	10	3266596	3266605	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10132	NC_008435	CAG	2	6	3266617	3266622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_008435	GCG	2	6	3266646	3266651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_008435	CCG	3	9	3266660	3266668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10136	NC_008435	CG	3	6	3268165	3268170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10137	NC_008435	CGCGG	2	10	3268237	3268246	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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10139	NC_008435	ATCG	2	8	3268394	3268401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10140	NC_008435	GCG	2	6	3268406	3268411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10153	NC_008435	CGC	2	6	3271203	3271208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10255	NC_008435	CGG	2	6	3300009	3300014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10257	NC_008435	GCAA	2	8	3300141	3300148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10271	NC_008435	CGGC	2	8	3310480	3310487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10353	NC_008435	CGAT	2	8	3349125	3349132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10374	NC_008435	TTG	2	6	3353296	3353301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10384	NC_008435	GC	3	6	3360941	3360946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10385	NC_008435	GCG	2	6	3360960	3360965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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