MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 1602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008384	TGC	2	6	209974	209979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_008384	CGGC	2	8	210002	210009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_008384	GCCCA	2	10	210030	210039	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
504	NC_008384	GAG	2	6	210087	210092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008384	GCA	2	6	210122	210127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_008384	CGGAC	2	10	210158	210167	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
507	NC_008384	CGGCCG	2	12	210168	210179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_008384	GC	3	6	210186	210191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_008384	AT	3	6	210242	210247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008384	CAACGT	5	30	211843	211872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_008384	CGG	2	6	211889	211894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_008384	CGG	2	6	211908	211913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_008384	GCTTTG	2	12	211990	212001	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
514	NC_008384	ATG	2	6	212084	212089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008384	CGT	2	6	212858	212863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008384	CCG	2	6	212864	212869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_008384	TCT	3	9	213541	213549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_008384	TTC	2	6	213624	213629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_008384	GTT	2	6	213663	213668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008384	GA	3	6	215945	215950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008384	TA	3	6	219604	219609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008384	CGG	2	6	219664	219669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008384	AGAGG	2	10	219677	219686	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008384	CTG	2	6	221923	221928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_008384	TGGC	2	8	221950	221957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
526	NC_008384	CTG	2	6	221966	221971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_008384	GCA	2	6	222007	222012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_008384	GCC	2	6	222024	222029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_008384	CTTC	2	8	223244	223251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_008384	GCG	2	6	223258	223263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_008384	TC	3	6	223266	223271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_008384	A	6	6	223320	223325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008384	GCC	2	6	223430	223435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_008384	CTG	2	6	223477	223482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_008384	ACA	2	6	223530	223535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_008384	GTG	2	6	224456	224461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008384	GAT	2	6	225411	225416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008384	AG	3	6	225459	225464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008384	ATG	2	6	225472	225477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008384	CAT	2	6	225506	225511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_008384	ACGG	2	8	225541	225548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
542	NC_008384	AAG	2	6	229882	229887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008384	CTA	2	6	229900	229905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_008384	CTG	2	6	229956	229961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_008384	CT	3	6	230983	230988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_008384	CGT	2	6	231002	231007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_008384	CTC	2	6	231016	231021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_008384	ACA	2	6	231026	231031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_008384	CTG	2	6	231920	231925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_008384	GCC	2	6	234288	234293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_008384	TCC	2	6	235342	235347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_008384	GCG	2	6	235379	235384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_008384	GCC	2	6	235397	235402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_008384	CGT	2	6	237151	237156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_008384	GAA	2	6	237179	237184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008384	CTG	2	6	237186	237191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_008384	GCA	2	6	237221	237226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008384	TGC	2	6	237258	237263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_008384	AGT	2	6	237315	237320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008384	CGC	2	6	237334	237339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_008384	G	6	6	237370	237375	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008384	TC	3	6	239967	239972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_008384	GAT	2	6	240403	240408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008384	GGC	2	6	240430	240435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_008384	CGT	2	6	240501	240506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_008384	GGCA	2	8	240583	240590	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
567	NC_008384	GAC	2	6	240603	240608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_008384	TCG	2	6	240698	240703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008384	ATGATT	2	12	240746	240757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008384	AGG	2	6	240758	240763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008384	CTC	2	6	241018	241023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_008384	GCA	2	6	241042	241047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_008384	TTGCC	2	10	241066	241075	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
574	NC_008384	ATG	2	6	241094	241099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008384	GGT	2	6	242911	242916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008384	GAG	2	6	242935	242940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008384	GCC	2	6	243213	243218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_008384	AAG	2	6	243291	243296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008384	CGG	2	6	243314	243319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_008384	ACG	2	6	243331	243336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_008384	AG	3	6	243370	243375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008384	AT	3	6	243383	243388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008384	AT	3	6	245077	245082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008384	GTTG	2	8	245088	245095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008384	CCT	2	6	245239	245244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_008384	CTC	2	6	245282	245287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_008384	ATG	2	6	246927	246932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008384	CAT	2	6	246961	246966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_008384	AAC	2	6	250410	250415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_008384	GAGG	2	8	250451	250458	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008384	CG	3	6	250473	250478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_008384	CA	3	6	250519	250524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_008384	GTT	2	6	250554	250559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008384	TGG	2	6	250585	250590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008384	GCG	2	6	250603	250608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_008384	CG	3	6	250636	250641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_008384	CG	3	6	253349	253354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_008384	AGC	2	6	253404	253409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_008384	C	6	6	253414	253419	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
600	NC_008384	TAT	2	6	253450	253455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008384	CGC	2	6	253486	253491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_008384	GGC	2	6	253526	253531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008384	CTG	2	6	253558	253563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_008384	GGC	2	6	253599	253604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_008384	CCA	2	6	253681	253686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_008384	CGA	2	6	254552	254557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_008384	TGT	2	6	254585	254590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_008384	TTGA	2	8	254665	254672	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008384	ATT	2	6	254679	254684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008384	GAC	2	6	255812	255817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008384	TCC	2	6	256856	256861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_008384	CTT	2	6	256867	256872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_008384	GTC	2	6	258390	258395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_008384	GGGA	2	8	258406	258413	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008384	CTCC	2	8	260646	260653	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
616	NC_008384	CG	3	6	260675	260680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_008384	GC	3	6	260685	260690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
618	NC_008384	CAA	2	6	260704	260709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_008384	GCCG	2	8	260710	260717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_008384	GGC	2	6	260736	260741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_008384	TGAT	2	8	262910	262917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008384	AAG	2	6	266001	266006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008384	CAA	2	6	266018	266023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_008384	AGG	2	6	266064	266069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008384	CGT	2	6	268285	268290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_008384	TGC	2	6	268316	268321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_008384	GCT	2	6	268369	268374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_008384	TCC	2	6	268501	268506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_008384	CAGC	2	8	268553	268560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
630	NC_008384	GCC	2	6	268580	268585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_008384	GAC	2	6	268610	268615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_008384	GAC	2	6	268726	268731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_008384	GAC	2	6	268804	268809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_008384	CG	3	6	268857	268862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_008384	CGCCGA	2	12	268868	268879	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
636	NC_008384	TGG	2	6	268895	268900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_008384	CCGCT	2	10	372393	372402	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

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