MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008381	GC	4	8	4102	4109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008381	TC	3	6	4364	4369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008381	AT	3	6	9801	9806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008381	CG	3	6	16524	16529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008381	TG	3	6	16727	16732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008381	TG	3	6	35217	35222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008381	GC	3	6	35518	35523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008381	CG	3	6	40512	40517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008381	AT	3	6	46304	46309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008381	CG	3	6	46348	46353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008381	GC	3	6	46761	46766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008381	GC	3	6	47179	47184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008381	GC	3	6	49528	49533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008381	AG	3	6	57294	57299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008381	GC	3	6	57368	57373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008381	GA	3	6	57435	57440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008381	CT	3	6	58445	58450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008381	GC	3	6	58931	58936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008381	GC	3	6	63806	63811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008381	GT	3	6	64012	64017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008381	GC	3	6	64616	64621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008381	TC	3	6	65318	65323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008381	GA	3	6	67057	67062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008381	CG	3	6	67288	67293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008381	CT	3	6	67788	67793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008381	AG	3	6	75611	75616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008381	AG	3	6	75766	75771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008381	AG	3	6	76539	76544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008381	TG	3	6	76911	76916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008381	CG	3	6	76980	76985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008381	GC	3	6	79060	79065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008381	CG	3	6	79236	79241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008381	AC	3	6	80349	80354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008381	CG	3	6	87904	87909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008381	GC	3	6	88121	88126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008381	GC	4	8	89174	89181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008381	AT	3	6	89632	89637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008381	GC	3	6	89800	89805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008381	GC	3	6	89934	89939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008381	GC	3	6	89948	89953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008381	TG	3	6	90398	90403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008381	GC	3	6	91009	91014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008381	AT	3	6	91808	91813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008381	CG	3	6	92600	92605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008381	TC	3	6	96666	96671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008381	GC	3	6	97801	97806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008381	GC	5	10	97910	97919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008381	CG	3	6	99872	99877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008381	CG	3	6	100321	100326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008381	GA	3	6	100523	100528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008381	AT	3	6	107359	107364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008381	GC	3	6	107431	107436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008381	TC	3	6	109165	109170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008381	TC	3	6	110018	110023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008381	CG	3	6	111206	111211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008381	CA	3	6	111544	111549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008381	GC	3	6	111642	111647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008381	GA	3	6	112388	112393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008381	CG	3	6	112592	112597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008381	GC	3	6	112708	112713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008381	GC	3	6	113128	113133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008381	CG	3	6	113519	113524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008381	GC	3	6	119145	119150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008381	CT	3	6	122562	122567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008381	GC	3	6	126534	126539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008381	AT	3	6	127999	128004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008381	GC	3	6	135376	135381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008381	GA	3	6	137708	137713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008381	CA	3	6	138118	138123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008381	TC	3	6	138296	138301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008381	GC	3	6	138630	138635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008381	GC	3	6	138671	138676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008381	CA	3	6	138794	138799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008381	CG	4	8	139498	139505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008381	CG	3	6	139540	139545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008381	GC	3	6	140484	140489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008381	CG	3	6	140647	140652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008381	TA	3	6	141274	141279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008381	GC	3	6	143654	143659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008381	CG	4	8	143815	143822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008381	CG	3	6	143928	143933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008381	AT	3	6	144013	144018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008381	GC	3	6	145648	145653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008381	GC	3	6	145880	145885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008381	GC	3	6	146929	146934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008381	AC	3	6	147044	147049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008381	AT	3	6	148807	148812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008381	CA	3	6	149483	149488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008381	AC	3	6	150414	150419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008381	AG	3	6	154684	154689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008381	TC	3	6	154917	154922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008381	TG	3	6	155536	155541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008381	GA	3	6	158477	158482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008381	GC	3	6	161728	161733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008381	CG	3	6	164979	164984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008381	CT	3	6	165211	165216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008381	TA	3	6	172861	172866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008381	CT	3	6	174223	174228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008381	AT	3	6	174263	174268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008381	AT	3	6	174348	174353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008381	AT	3	6	174360	174365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008381	GC	3	6	176260	176265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008381	GC	3	6	177430	177435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008381	GC	3	6	178994	178999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008381	TG	3	6	184905	184910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008381	TC	3	6	193621	193626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008381	AC	3	6	194622	194627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008381	AG	3	6	196339	196344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008381	GC	3	6	205171	205176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008381	GC	3	6	209710	209715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008381	CG	3	6	209727	209732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008381	GC	4	8	209738	209745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008381	CT	3	6	209912	209917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008381	CA	3	6	215325	215330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008381	CT	3	6	216467	216472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008381	AT	3	6	216668	216673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008381	AT	3	6	216701	216706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008381	GA	3	6	220115	220120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008381	TC	3	6	220492	220497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008381	TA	3	6	226516	226521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008381	GA	3	6	238712	238717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008381	AG	3	6	238770	238775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008381	AG	3	6	239980	239985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008381	AT	3	6	247037	247042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008381	GC	4	8	247174	247181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008381	TA	3	6	247240	247245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008381	GC	4	8	258032	258039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008381	CG	3	6	258193	258198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008381	CA	3	6	268404	268409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008381	TA	3	6	275688	275693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008381	AT	3	6	279263	279268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008381	GA	3	6	290086	290091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008381	TG	3	6	295598	295603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008381	CG	3	6	300310	300315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008381	AT	3	6	311109	311114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008381	GA	3	6	311128	311133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008381	GA	3	6	314935	314940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008381	GC	3	6	321733	321738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008381	CG	3	6	322104	322109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008381	GA	3	6	322212	322217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008381	CT	3	6	324416	324421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008381	TC	3	6	324925	324930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008381	TA	3	6	328085	328090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008381	GC	3	6	330005	330010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008381	GC	3	6	332152	332157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008381	CT	3	6	333659	333664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008381	CG	3	6	333727	333732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008381	CT	3	6	333779	333784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008381	GC	4	8	336304	336311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008381	CT	3	6	343421	343426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008381	CG	3	6	351893	351898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008381	GC	3	6	356003	356008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008381	GC	3	6	356013	356018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_008381	GA	4	8	363081	363088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008381	TC	3	6	370492	370497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_008381	CG	3	6	405356	405361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_008381	GC	3	6	413616	413621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_008381	AC	3	6	418441	418446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_008381	CT	3	6	419756	419761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_008381	AT	3	6	419765	419770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008381	TC	4	8	422006	422013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_008381	CG	3	6	424096	424101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_008381	GA	3	6	431066	431071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008381	TA	3	6	432008	432013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_008381	AT	3	6	432027	432032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008381	CA	3	6	432065	432070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
167	NC_008381	CT	3	6	438862	438867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_008381	TG	3	6	466340	466345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_008381	GC	4	8	466424	466431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
170	NC_008381	GC	3	6	467897	467902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
171	NC_008381	CG	3	6	470169	470174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
172	NC_008381	GC	3	6	470244	470249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_008381	AT	3	6	473682	473687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_008381	AT	3	6	473753	473758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_008381	AG	3	6	475111	475116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
176	NC_008381	TA	3	6	475148	475153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_008381	AC	3	6	476232	476237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
178	NC_008381	CG	3	6	484477	484482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
179	NC_008381	CG	3	6	485101	485106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.