MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 1689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008381	TCT	2	6	182633	182638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_008381	GGT	2	6	182656	182661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008381	TAA	2	6	182686	182691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008381	GAG	2	6	182706	182711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008381	GGC	2	6	182734	182739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_008381	GTC	2	6	182748	182753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_008381	GTG	2	6	183078	183083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008381	CGG	2	6	183156	183161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_008381	TGC	2	6	183179	183184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_008381	CAT	2	6	184726	184731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_008381	TGC	2	6	184779	184784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_008381	GAC	2	6	184820	184825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_008381	CGC	2	6	184853	184858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_008381	CAT	2	6	184886	184891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_008381	ATTG	2	8	184899	184906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008381	TG	3	6	184905	184910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008381	GCGCCG	2	12	184969	184980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_008381	CTA	2	6	185030	185035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_008381	CGC	2	6	185096	185101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_008381	AGCTG	2	10	185246	185255	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_008381	GGC	2	6	185257	185262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_008381	G	6	6	185263	185268	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008381	CCT	2	6	185286	185291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_008381	TCCAT	2	10	186300	186309	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_008381	GAT	2	6	186311	186316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008381	CAAT	2	8	186328	186335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_008381	A	6	6	186400	186405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008381	CAA	2	6	186477	186482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_008381	CAA	2	6	186490	186495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_008381	CGA	2	6	186523	186528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_008381	AAC	2	6	186529	186534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_008381	TGC	2	6	190945	190950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_008381	TGG	2	6	191083	191088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008381	AGG	2	6	191089	191094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008381	GCC	2	6	191501	191506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_008381	AGAC	2	8	191890	191897	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_008381	TCC	2	6	192006	192011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_008381	GAC	2	6	192650	192655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_008381	TC	3	6	193621	193626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_008381	TGC	2	6	193646	193651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_008381	TGA	2	6	193698	193703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008381	CCG	2	6	193785	193790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_008381	CTG	2	6	193792	193797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_008381	CCT	2	6	194262	194267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_008381	CCAT	2	8	194325	194332	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_008381	GCC	2	6	194349	194354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_008381	TCTT	2	8	194398	194405	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_008381	CTG	2	6	194437	194442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_008381	CATG	2	8	194454	194461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_008381	GCG	2	6	194474	194479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_008381	CAGG	2	8	194593	194600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_008381	AC	3	6	194622	194627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_008381	TTG	2	6	194637	194642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008381	T	7	7	194673	194679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008381	AG	3	6	196339	196344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008381	ATT	2	6	196362	196367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008381	TGC	2	6	196408	196413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_008381	CTG	2	6	198086	198091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008381	CGC	3	9	198189	198197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_008381	GCT	2	6	198217	198222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_008381	CCG	2	6	198226	198231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_008381	CTC	2	6	200991	200996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_008381	TGTCG	2	10	202002	202011	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1064	NC_008381	CAC	2	6	202026	202031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_008381	AAT	2	6	202115	202120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008381	GAT	2	6	202309	202314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008381	GCT	2	6	202372	202377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_008381	CTG	2	6	202495	202500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_008381	GCCAGC	2	12	202502	202513	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_008381	ACA	2	6	202534	202539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_008381	TCA	2	6	202553	202558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_008381	GGA	2	6	202748	202753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008381	AAAT	2	8	202754	202761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008381	AGG	2	6	202766	202771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008381	ACA	2	6	202824	202829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_008381	ATC	2	6	204447	204452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_008381	TTGCCA	2	12	204566	204577	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_008381	CCG	2	6	204667	204672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_008381	AGC	2	6	204695	204700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_008381	TCG	2	6	204740	204745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_008381	CGG	2	6	205124	205129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_008381	GC	3	6	205171	205176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_008381	GGC	2	6	205215	205220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_008381	TAGAA	2	10	205230	205239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008381	TGTT	2	8	205343	205350	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008381	TGCC	2	8	205471	205478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_008381	GGC	2	6	205487	205492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_008381	GAT	2	6	205572	205577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008381	GCGA	2	8	205629	205636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_008381	CAT	2	6	205660	205665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_008381	GCG	2	6	205754	205759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_008381	AAG	2	6	205775	205780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008381	TCG	3	9	205803	205811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_008381	TGG	2	6	205836	205841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008381	GAC	2	6	205875	205880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_008381	GTT	2	6	205933	205938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008381	GAA	2	6	205965	205970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008381	CCA	2	6	206056	206061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_008381	GTC	2	6	206234	206239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_008381	GAC	2	6	206251	206256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_008381	CGC	2	6	209706	209711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_008381	GC	3	6	209710	209715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_008381	CG	3	6	209727	209732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_008381	GC	4	8	209738	209745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_008381	CGC	3	9	209754	209762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_008381	GAC	2	6	209774	209779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_008381	GTG	2	6	209874	209879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008381	GTT	2	6	209880	209885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008381	CTC	2	6	209895	209900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_008381	CT	3	6	209912	209917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_008381	CGC	2	6	215248	215253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_008381	CGC	2	6	215296	215301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_008381	CA	3	6	215325	215330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_008381	TAT	2	6	215433	215438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008381	GAA	2	6	215462	215467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008381	ATG	2	6	215507	215512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008381	GCG	2	6	216352	216357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_008381	AATT	2	8	216374	216381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008381	CT	3	6	216467	216472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_008381	CGC	2	6	216473	216478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_008381	TGT	2	6	216578	216583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008381	TTG	2	6	216638	216643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008381	AT	3	6	216668	216673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008381	T	8	8	216692	216699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008381	AT	3	6	216701	216706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008381	GCG	2	6	217302	217307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008381	TTGA	2	8	217334	217341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008381	AAC	2	6	217407	217412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_008381	CGC	2	6	217435	217440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_008381	GTC	2	6	217482	217487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_008381	GAC	2	6	217527	217532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_008381	T	7	7	217567	217573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008381	GCT	2	6	217574	217579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_008381	ATG	2	6	217598	217603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1264	NC_008381	GGA	2	6	282928	282933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_008381	TCC	2	6	295352	295357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1274	NC_008381	GGC	2	6	295522	295527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1283	NC_008381	GCC	2	6	295852	295857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1285	NC_008381	GACG	2	8	300351	300358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1312	NC_008381	GA	3	6	311128	311133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1382	NC_008381	GCG	2	6	331326	331331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1383	NC_008381	CTG	2	6	331332	331337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1389	NC_008381	GC	3	6	332152	332157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1390	NC_008381	GGC	2	6	332173	332178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1398	NC_008381	CT	3	6	333779	333784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1399	NC_008381	GGC	2	6	333905	333910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1400	NC_008381	GGCG	2	8	336095	336102	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1401	NC_008381	GGC	2	6	336121	336126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1403	NC_008381	GAA	2	6	336164	336169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_008381	CGT	2	6	336206	336211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_008381	TCA	2	6	336276	336281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1431	NC_008381	GCG	2	6	343575	343580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1435	NC_008381	TTG	2	6	352488	352493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_008381	CTC	2	6	354252	354257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1439	NC_008381	ATA	2	6	354411	354416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1441	NC_008381	GCT	2	6	354499	354504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1442	NC_008381	CGG	2	6	354631	354636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_008381	GC	3	6	356013	356018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1445	NC_008381	GAG	2	6	356036	356041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_008381	GCG	2	6	357804	357809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_008381	CGTT	2	8	369637	369644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1455	NC_008381	CGG	2	6	370513	370518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1499	NC_008381	GCG	2	6	405375	405380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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