MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 1689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008381	GGA	2	6	99884	99889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008381	TGA	2	6	99928	99933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008381	CGC	2	6	99934	99939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_008381	TCGC	2	8	99985	99992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
505	NC_008381	GCT	3	9	100019	100027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_008381	GCG	2	6	100117	100122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008381	CGG	2	6	100124	100129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008381	CTT	2	6	100130	100135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_008381	CCAG	2	8	100141	100148	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
510	NC_008381	GTCATC	2	12	100185	100196	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_008381	CG	3	6	100321	100326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_008381	GGC	3	9	100374	100382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_008381	TGT	2	6	100388	100393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008381	ATT	2	6	100408	100413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008381	GGC	2	6	100503	100508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008381	GCC	2	6	100516	100521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_008381	GA	3	6	100523	100528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008381	CAAA	2	8	100531	100538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_008381	CAA	2	6	103536	103541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_008381	CCG	2	6	103553	103558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_008381	ATC	2	6	103570	103575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_008381	ATA	2	6	103628	103633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008381	TGA	2	6	103663	103668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008381	CGG	2	6	104158	104163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_008381	ACG	2	6	104865	104870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_008381	CCG	2	6	104888	104893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_008381	CGG	2	6	105283	105288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_008381	GGA	2	6	105292	105297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008381	CCG	2	6	105307	105312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_008381	A	6	6	105350	105355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008381	TTG	2	6	105440	105445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008381	TGT	2	6	106816	106821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008381	GGC	2	6	106845	106850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_008381	GGCGGA	2	12	106860	106871	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
535	NC_008381	ATG	2	6	107166	107171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008381	A	6	6	107207	107212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008381	CCG	2	6	107350	107355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_008381	AT	3	6	107359	107364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008381	GC	3	6	107431	107436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_008381	G	6	6	107458	107463	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008381	CACGC	2	10	107464	107473	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
542	NC_008381	CATGGA	2	12	107513	107524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
543	NC_008381	CAA	2	6	107575	107580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_008381	A	6	6	107579	107584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008381	AGC	2	6	107597	107602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008381	CAAG	2	8	107608	107615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_008381	TCG	2	6	108414	108419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_008381	GATT	2	8	108470	108477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008381	TC	3	6	109165	109170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_008381	TGGT	2	8	109187	109194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008381	GCG	2	6	109213	109218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_008381	ATCCG	2	10	109274	109283	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
553	NC_008381	GGC	2	6	109315	109320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_008381	ATGG	2	8	109374	109381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008381	CTT	2	6	109443	109448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_008381	CAA	2	6	109453	109458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_008381	CAA	2	6	109476	109481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008381	GAG	2	6	109582	109587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008381	TCAA	2	8	109604	109611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_008381	TCAA	2	8	109634	109641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_008381	GTC	2	6	109659	109664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_008381	GCT	2	6	109703	109708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008381	GAG	3	9	109779	109787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008381	ATT	2	6	109867	109872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008381	GAT	2	6	109884	109889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008381	TGT	2	6	110009	110014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008381	TC	3	6	110018	110023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_008381	GGCA	2	8	110053	110060	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
569	NC_008381	A	6	6	110622	110627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008381	ACCC	2	8	110639	110646	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
571	NC_008381	G	6	6	110655	110660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008381	CCGA	2	8	110680	110687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
573	NC_008381	CAT	2	6	110756	110761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_008381	GAA	2	6	110780	110785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008381	GCC	2	6	110832	110837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_008381	GCC	2	6	110857	110862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_008381	CGG	2	6	110933	110938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_008381	TGA	2	6	110950	110955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008381	CAG	2	6	110978	110983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_008381	TGT	2	6	111134	111139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008381	GAG	2	6	111171	111176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008381	CG	3	6	111206	111211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_008381	TGG	2	6	111249	111254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008381	GCC	2	6	111267	111272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_008381	ACGC	2	8	111313	111320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
586	NC_008381	CTT	2	6	111328	111333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_008381	CAC	2	6	111334	111339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_008381	CGT	2	6	111355	111360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_008381	GGA	2	6	111364	111369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008381	CGG	2	6	111390	111395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_008381	ATC	2	6	111446	111451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_008381	TCA	2	6	111486	111491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_008381	GGC	2	6	111500	111505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_008381	CA	3	6	111544	111549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_008381	GCT	2	6	111628	111633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_008381	GC	3	6	111642	111647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_008381	GAG	2	6	111662	111667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008381	GAT	2	6	111695	111700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008381	GTG	2	6	111728	111733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008381	GCA	2	6	111762	111767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_008381	GCT	3	9	111838	111846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_008381	ACA	2	6	111849	111854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008381	GGC	2	6	111895	111900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_008381	GCG	2	6	111936	111941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_008381	CGG	2	6	111943	111948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008381	TGA	2	6	111972	111977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008381	TCG	2	6	112002	112007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_008381	CGG	2	6	112024	112029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_008381	CGAAG	2	10	112042	112051	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
610	NC_008381	GGC	2	6	112193	112198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008381	GAT	2	6	112226	112231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008381	CGG	2	6	112252	112257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_008381	TCGC	2	8	112261	112268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
614	NC_008381	CCG	2	6	112280	112285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_008381	GCGG	2	8	112365	112372	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
616	NC_008381	GCC	2	6	112381	112386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_008381	GA	3	6	112388	112393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008381	CAAA	2	8	112396	112403	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_008381	CTC	2	6	112485	112490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_008381	GCC	2	6	112503	112508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_008381	TGC	2	6	112513	112518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_008381	CGA	2	6	112526	112531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_008381	GCGG	2	8	112538	112545	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
624	NC_008381	GCG	2	6	112569	112574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_008381	CG	3	6	112592	112597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_008381	GTC	2	6	112617	112622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_008381	GCA	2	6	112650	112655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_008381	GCG	2	6	112672	112677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_008381	CGG	3	9	112697	112705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_008381	GC	3	6	112708	112713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_008381	TCG	2	6	112729	112734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_008381	TGA	2	6	112763	112768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008381	GCT	3	9	112808	112816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_008381	CGG	2	6	112828	112833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_008381	AAC	2	6	112878	112883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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637	NC_008381	CGC	2	6	112903	112908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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909	NC_008381	C	6	6	165939	165944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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912	NC_008381	AAC	2	6	168449	168454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
913	NC_008381	CGCA	2	8	168503	168510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
914	NC_008381	GCAA	2	8	168550	168557	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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932	NC_008381	GAT	2	6	173127	173132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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943	NC_008381	AT	3	6	174263	174268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
944	NC_008381	AT	3	6	174348	174353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
945	NC_008381	AT	3	6	174360	174365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
946	NC_008381	GGC	2	6	174914	174919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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