MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008380	GCC	2	6	1369676	1369681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_008380	GAA	2	6	1370333	1370338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_008380	GA	3	6	1370344	1370349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_008380	TTG	2	6	1370423	1370428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_008380	GCG	2	6	1370450	1370455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_008380	GC	3	6	1372096	1372101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_008380	ATA	2	6	1372230	1372235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_008380	TCC	2	6	1372249	1372254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_008380	CCA	2	6	1372329	1372334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_008380	CA	3	6	1374548	1374553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_008380	CGG	2	6	1374641	1374646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_008380	CACGC	2	10	1374804	1374813	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3513	NC_008380	CGA	2	6	1374817	1374822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_008380	GCC	2	6	1376441	1376446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_008380	GCC	2	6	1376471	1376476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_008380	GCAG	2	8	1376506	1376513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_008380	GCG	2	6	1376560	1376565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_008380	GGGA	2	8	1376568	1376575	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_008380	A	6	6	1376623	1376628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_008380	AGG	2	6	1376630	1376635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_008380	TTG	2	6	1377061	1377066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_008380	AAGC	2	8	1377100	1377107	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_008380	CGCC	2	8	1377597	1377604	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3524	NC_008380	GC	3	6	1379583	1379588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_008380	TCC	2	6	1379636	1379641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_008380	GCC	2	6	1379652	1379657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_008380	CTG	2	6	1380644	1380649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_008380	TGG	2	6	1380669	1380674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_008380	GAC	2	6	1380710	1380715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_008380	CGA	2	6	1380736	1380741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_008380	GCG	2	6	1382067	1382072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_008380	TA	3	6	1382093	1382098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_008380	CAT	2	6	1382122	1382127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_008380	GCC	2	6	1382213	1382218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_008380	CT	3	6	1382248	1382253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_008380	GAGGC	2	10	1382274	1382283	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3537	NC_008380	GAG	2	6	1382349	1382354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_008380	GCA	2	6	1382472	1382477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_008380	GCA	2	6	1382508	1382513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_008380	CGA	2	6	1382672	1382677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_008380	GAG	2	6	1382689	1382694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_008380	CGG	2	6	1385107	1385112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_008380	TCC	2	6	1385125	1385130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_008380	AGGAC	2	10	1385147	1385156	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3545	NC_008380	TTTGA	2	10	1385166	1385175	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_008380	CA	3	6	1385202	1385207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_008380	TCG	2	6	1385826	1385831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_008380	GCT	2	6	1386276	1386281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_008380	ACG	2	6	1386310	1386315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_008380	CGA	2	6	1386840	1386845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_008380	ATG	2	6	1386854	1386859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_008380	TCTT	2	8	1387364	1387371	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_008380	TGT	2	6	1387438	1387443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_008380	TGC	2	6	1389722	1389727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_008380	CAT	2	6	1389745	1389750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_008380	CAGC	2	8	1389760	1389767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_008380	CATTC	2	10	1389776	1389785	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3558	NC_008380	CAT	2	6	1389786	1389791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_008380	TGC	2	6	1389825	1389830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_008380	CGG	2	6	1389918	1389923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_008380	AGG	2	6	1389943	1389948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_008380	ACG	2	6	1390893	1390898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_008380	AAGCGC	2	12	1390907	1390918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_008380	CGG	2	6	1390934	1390939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_008380	AGCCC	2	10	1390945	1390954	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3566	NC_008380	GA	3	6	1391447	1391452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_008380	AGC	2	6	1391456	1391461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_008380	GCG	2	6	1391564	1391569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_008380	AC	3	6	1391613	1391618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_008380	TGT	2	6	1391624	1391629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_008380	TGC	2	6	1391687	1391692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_008380	TGA	2	6	1392674	1392679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_008380	AATG	2	8	1392707	1392714	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_008380	AGG	2	6	1392757	1392762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_008380	CG	3	6	1395769	1395774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_008380	AGG	2	6	1395782	1395787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_008380	ACCC	2	8	1397008	1397015	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3578	NC_008380	CTGCC	2	10	1397019	1397028	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3579	NC_008380	GGA	2	6	1397133	1397138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_008380	GTC	2	6	1397983	1397988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_008380	GC	3	6	1398001	1398006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_008380	TCCTC	2	10	1398715	1398724	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3583	NC_008380	TC	3	6	1400680	1400685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_008380	CG	3	6	1400711	1400716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_008380	GC	3	6	1400726	1400731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_008380	CCG	2	6	1400813	1400818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_008380	TGA	2	6	1400823	1400828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_008380	GGGC	2	8	1400942	1400949	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_008380	ATG	2	6	1401078	1401083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_008380	CG	3	6	1402275	1402280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_008380	AGC	2	6	1403142	1403147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_008380	TTTG	2	8	1403225	1403232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_008380	CTT	2	6	1403361	1403366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_008380	CGG	2	6	1403384	1403389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_008380	GCG	2	6	1403449	1403454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_008380	TCC	2	6	1403602	1403607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_008380	T	6	6	1403617	1403622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_008380	CCT	2	6	1403654	1403659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_008380	CGC	2	6	1404328	1404333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_008380	CGG	2	6	1404336	1404341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_008380	GTC	2	6	1404346	1404351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_008380	GGTC	2	8	1406225	1406232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_008380	GAT	2	6	1406248	1406253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_008380	GGA	2	6	1406287	1406292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_008380	GCG	2	6	1406338	1406343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_008380	GCC	2	6	1407928	1407933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_008380	ATCA	2	8	1407946	1407953	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_008380	ATG	2	6	1408720	1408725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_008380	TGC	2	6	1408767	1408772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_008380	GCAAA	2	10	1409332	1409341	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3611	NC_008380	GATC	2	8	1409417	1409424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_008380	ACA	2	6	1409440	1409445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_008380	GGC	2	6	1409451	1409456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_008380	TGT	2	6	1410378	1410383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_008380	CTC	2	6	1411115	1411120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_008380	GGC	2	6	1411172	1411177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_008380	TCG	2	6	1411227	1411232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_008380	CGC	2	6	1411272	1411277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_008380	GCC	2	6	1411883	1411888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_008380	TCG	2	6	1411952	1411957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_008380	ATACC	2	10	1412024	1412033	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3622	NC_008380	C	6	6	1412032	1412037	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3623	NC_008380	CGA	2	6	1412418	1412423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_008380	GGGC	2	8	1413446	1413453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_008380	CGG	2	6	1413463	1413468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_008380	CGG	2	6	1413504	1413509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_008380	CGC	2	6	1413521	1413526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_008380	CGC	2	6	1413540	1413545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_008380	GCT	2	6	1413550	1413555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_008380	TCC	2	6	1413564	1413569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_008380	GGA	2	6	1413579	1413584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_008380	CCG	2	6	1414606	1414611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3633	NC_008380	GCC	2	6	1414645	1414650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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