MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008380	GA	3	6	628875	628880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008380	CCATC	2	10	628987	628996	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1503	NC_008380	TCC	2	6	629562	629567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_008380	ACC	2	6	629581	629586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_008380	AAC	2	6	629603	629608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_008380	T	7	7	629649	629655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_008380	GAA	2	6	629729	629734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008380	ATG	2	6	631494	631499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008380	GA	3	6	631612	631617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_008380	T	6	6	631674	631679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008380	A	6	6	631710	631715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_008380	GCC	2	6	631731	631736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_008380	AG	3	6	631760	631765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_008380	CTG	2	6	635656	635661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_008380	ACT	2	6	635782	635787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_008380	T	6	6	635844	635849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_008380	GC	3	6	635919	635924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_008380	TCC	2	6	636296	636301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_008380	ATG	2	6	636312	636317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008380	CAT	2	6	636346	636351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_008380	ATC	2	6	636407	636412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_008380	AGGC	2	8	636479	636486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_008380	CAAG	2	8	637296	637303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_008380	CTC	2	6	637321	637326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_008380	CGG	2	6	637340	637345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_008380	T	7	7	637360	637366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008380	GGA	2	6	637465	637470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_008380	G	6	6	639301	639306	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_008380	AGA	2	6	639362	639367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_008380	GCC	2	6	639390	639395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_008380	GGA	2	6	641017	641022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008380	GCC	2	6	643243	643248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_008380	ATT	2	6	643285	643290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_008380	CGT	2	6	643408	643413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_008380	TCC	2	6	643426	643431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_008380	CGC	2	6	643447	643452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_008380	TCT	2	6	643475	643480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_008380	ATC	2	6	643735	643740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_008380	T	7	7	643811	643817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008380	ACA	2	6	643877	643882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_008380	ACA	2	6	644412	644417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_008380	AT	3	6	644425	644430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_008380	AGG	2	6	644452	644457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_008380	TCG	2	6	644914	644919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_008380	TCC	2	6	644920	644925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_008380	GGAGAA	2	12	644947	644958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_008380	CCG	2	6	650956	650961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_008380	CCG	2	6	650971	650976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_008380	CCT	2	6	650980	650985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_008380	AAT	2	6	651076	651081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008380	GATT	2	8	651092	651099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008380	TAA	2	6	651120	651125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008380	CCGG	2	8	651631	651638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_008380	TCAT	2	8	651641	651648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_008380	GCC	2	6	652952	652957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_008380	GCG	2	6	652990	652995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_008380	GAAA	2	8	653216	653223	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_008380	CTGG	2	8	654385	654392	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_008380	CGAT	2	8	656379	656386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_008380	CCG	2	6	656393	656398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_008380	CGT	2	6	656424	656429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_008380	GC	3	6	659686	659691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_008380	CTT	2	6	660070	660075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_008380	CAAC	2	8	660122	660129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_008380	GC	3	6	660480	660485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_008380	CT	3	6	660521	660526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_008380	CAT	3	9	660893	660901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_008380	TCT	2	6	660914	660919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_008380	TTG	2	6	660974	660979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_008380	TCC	2	6	661017	661022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_008380	GC	3	6	661038	661043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_008380	CTC	2	6	661331	661336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_008380	GCA	2	6	661361	661366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_008380	TCC	2	6	661376	661381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_008380	CAA	2	6	661424	661429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_008380	GTTG	2	8	661439	661446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_008380	TGA	2	6	661448	661453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_008380	GC	4	8	661488	661495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_008380	GAC	2	6	661529	661534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_008380	GGC	2	6	661804	661809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_008380	CTA	2	6	661838	661843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_008380	TGC	2	6	661911	661916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_008380	ACC	2	6	661930	661935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_008380	GCA	2	6	661978	661983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_008380	G	6	6	662026	662031	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_008380	GGC	2	6	662047	662052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_008380	ATGA	2	8	662136	662143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_008380	CAG	2	6	662160	662165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_008380	GCC	2	6	662214	662219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_008380	CAG	2	6	662253	662258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_008380	CGCC	2	8	662264	662271	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1592	NC_008380	CGA	2	6	662285	662290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_008380	CGC	2	6	662306	662311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_008380	TCCG	2	8	662334	662341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_008380	CGC	2	6	663760	663765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_008380	CGG	2	6	663799	663804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_008380	GACC	2	8	663841	663848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_008380	TTG	2	6	663855	663860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_008380	GC	4	8	666662	666669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_008380	GAA	2	6	666693	666698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_008380	CG	3	6	667649	667654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_008380	AC	3	6	667698	667703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_008380	GGAC	2	8	667723	667730	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_008380	A	6	6	668009	668014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_008380	CGCT	2	8	668059	668066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_008380	AGC	2	6	668149	668154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_008380	CAC	2	6	668198	668203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_008380	TCATT	2	10	668221	668230	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1609	NC_008380	CAT	2	6	668241	668246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_008380	TGCG	2	8	668250	668257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_008380	ATT	2	6	668310	668315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008380	AAT	2	6	668323	668328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_008380	ACC	2	6	668600	668605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_008380	GGC	2	6	668971	668976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_008380	CTT	2	6	669025	669030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_008380	CGT	2	6	669041	669046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_008380	ATG	2	6	669053	669058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_008380	CG	3	6	669060	669065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_008380	GGC	2	6	669087	669092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_008380	CAA	2	6	669093	669098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_008380	AAG	2	6	672622	672627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_008380	GCT	2	6	672630	672635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_008380	GCC	2	6	672646	672651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_008380	TTCGT	2	10	673277	673286	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1625	NC_008380	GCGT	2	8	673316	673323	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_008380	CCG	2	6	673351	673356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_008380	CTGC	2	8	673364	673371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_008380	TCG	2	6	673495	673500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1630	NC_008380	GGA	2	6	674840	674845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_008380	TTC	2	6	674907	674912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_008380	TCC	2	6	674945	674950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_008380	CGG	2	6	674988	674993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_008380	GCC	2	6	675044	675049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1636	NC_008380	GTA	2	6	675088	675093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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