MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008380	TCGA	2	8	460369	460376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_008380	GCC	2	6	461471	461476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_008380	CGC	2	6	461528	461533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_008380	CTTG	2	8	461610	461617	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_008380	AAG	2	6	461682	461687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008380	GTG	2	6	462280	462285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008380	GCG	2	6	462287	462292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008380	GCC	2	6	462298	462303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_008380	CG	3	6	462808	462813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_008380	GCC	2	6	465310	465315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_008380	CG	3	6	465324	465329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_008380	GCA	2	6	465356	465361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_008380	ATG	2	6	465411	465416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008380	CGG	2	6	465453	465458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_008380	TGAA	2	8	465492	465499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008380	TCGA	3	12	465502	465513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_008380	CGG	2	6	465559	465564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008380	ATG	2	6	466506	466511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008380	GAC	2	6	466535	466540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008380	TA	3	6	466554	466559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008380	ATC	2	6	466601	466606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_008380	CAT	2	6	466629	466634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_008380	AGA	2	6	467918	467923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008380	AT	3	6	467931	467936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008380	CTCG	2	8	467995	468002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_008380	GAA	2	6	468007	468012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008380	GCG	2	6	468059	468064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_008380	TCC	2	6	468072	468077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_008380	A	6	6	469638	469643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008380	ATG	2	6	470267	470272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008380	CGG	2	6	474533	474538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_008380	GCC	2	6	474565	474570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_008380	CGG	2	6	475515	475520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_008380	GTC	2	6	476602	476607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_008380	AGA	2	6	477292	477297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008380	CAG	2	6	478152	478157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_008380	CTGC	2	8	478236	478243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_008380	CGG	2	6	479824	479829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_008380	CGA	2	6	481800	481805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_008380	GTG	2	6	483068	483073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008380	AAT	2	6	484031	484036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008380	CGT	2	6	484077	484082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_008380	T	6	6	484215	484220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008380	CTGC	2	8	484225	484232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_008380	GAA	2	6	484259	484264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008380	TGGC	2	8	484340	484347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_008380	TCGA	2	8	484367	484374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_008380	CGA	2	6	484402	484407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_008380	GACCC	2	10	484440	484449	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1050	NC_008380	GAAG	2	8	484475	484482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008380	CG	3	6	484520	484525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_008380	GA	3	6	484639	484644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008380	CCTG	2	8	485403	485410	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_008380	CG	3	6	485420	485425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_008380	GAC	2	6	485450	485455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_008380	GAG	2	6	485489	485494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008380	TCCG	2	8	486124	486131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_008380	TGA	2	6	486215	486220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008380	CG	3	6	486317	486322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_008380	GCT	2	6	487426	487431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_008380	GCA	2	6	487437	487442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_008380	TGC	2	6	487861	487866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_008380	GC	3	6	487868	487873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_008380	CGC	2	6	487886	487891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_008380	TGGG	2	8	488175	488182	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008380	CG	3	6	488188	488193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_008380	A	6	6	488203	488208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008380	GAA	2	6	488532	488537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008380	GTTC	2	8	488586	488593	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_008380	CG	3	6	488610	488615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_008380	AGCA	2	8	488627	488634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_008380	TCA	2	6	488658	488663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_008380	CGT	2	6	488670	488675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_008380	GCGG	2	8	489476	489483	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_008380	CTT	2	6	489525	489530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_008380	GAAAA	2	10	489540	489549	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008380	CCG	2	6	489553	489558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_008380	CGCC	2	8	491763	491770	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1079	NC_008380	GC	3	6	491819	491824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_008380	TGGT	2	8	491907	491914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008380	ATTT	2	8	491926	491933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008380	CTT	2	6	491955	491960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_008380	GTT	2	6	491983	491988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_008380	CGGG	2	8	491996	492003	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_008380	GCT	2	6	492091	492096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_008380	TAA	2	6	492270	492275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008380	AGG	2	6	492334	492339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008380	TAAAA	2	10	494399	494408	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008380	CGC	2	6	494431	494436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_008380	GCG	2	6	494443	494448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_008380	GAC	2	6	494458	494463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_008380	GCT	2	6	494469	494474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_008380	GGC	2	6	494528	494533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_008380	TGC	2	6	494539	494544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_008380	CGAGA	2	10	494553	494562	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_008380	CCA	2	6	496331	496336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_008380	GCG	2	6	496422	496427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_008380	GGCG	2	8	496466	496473	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_008380	TCT	2	6	496484	496489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_008380	CGCT	2	8	496527	496534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_008380	CGGC	2	8	496605	496612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_008380	TCT	2	6	496715	496720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_008380	TTGT	2	8	496726	496733	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008380	GCCG	2	8	497552	497559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_008380	TCG	2	6	499541	499546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_008380	TC	3	6	499558	499563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_008380	CCG	2	6	499609	499614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_008380	TTCG	2	8	499744	499751	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_008380	CAA	2	6	499774	499779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_008380	CGC	2	6	499853	499858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_008380	CG	3	6	499882	499887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_008380	TA	3	6	499908	499913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008380	ATT	2	6	499916	499921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008380	GTTT	2	8	499942	499949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008380	CGC	2	6	500048	500053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_008380	TAT	2	6	500072	500077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008380	GC	3	6	500084	500089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_008380	GTG	2	6	500121	500126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008380	AGA	2	6	502084	502089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008380	TCA	3	9	502334	502342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_008380	AGGC	2	8	502527	502534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_008380	TCGG	2	8	502541	502548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_008380	GTC	2	6	502583	502588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_008380	CAC	2	6	502594	502599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_008380	CTT	2	6	502636	502641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_008380	CT	3	6	502680	502685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_008380	CA	3	6	502700	502705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_008380	AGC	2	6	502760	502765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_008380	ACT	2	6	502768	502773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_008380	GCC	2	6	502801	502806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_008380	GC	3	6	502812	502817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_008380	GCG	2	6	502822	502827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_008380	GT	3	6	503388	503393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008380	TC	3	6	503441	503446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_008380	CTCTT	2	10	503454	503463	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1136	NC_008380	GC	3	6	505717	505722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_008380	CGAAA	2	10	505869	505878	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1401	NC_008380	TGA	2	6	597690	597695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1403	NC_008380	ATC	2	6	598285	598290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1405	NC_008380	CGGG	2	8	598416	598423	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1406	NC_008380	A	7	7	599649	599655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_008380	CAC	2	6	599735	599740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1409	NC_008380	GCT	2	6	599767	599772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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