MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008380	CG	3	6	4893111	4893116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13002	NC_008380	GGA	2	6	4893122	4893127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_008380	CTG	2	6	4894175	4894180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_008380	CGA	2	6	4894245	4894250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_008380	CG	3	6	4894254	4894259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13006	NC_008380	CGG	2	6	4894312	4894317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_008380	AGAA	2	8	4894321	4894328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_008380	GCA	2	6	4894334	4894339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_008380	GCG	2	6	4894345	4894350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_008380	CAAAAA	2	12	4895318	4895329	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13011	NC_008380	CGG	2	6	4895331	4895336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_008380	T	6	6	4895379	4895384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_008380	GCCG	2	8	4895398	4895405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13014	NC_008380	CAC	2	6	4895413	4895418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13015	NC_008380	CAT	2	6	4895489	4895494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_008380	GCAT	2	8	4897473	4897480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13017	NC_008380	GAC	2	6	4898202	4898207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_008380	AC	3	6	4898206	4898211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13019	NC_008380	GA	3	6	4902988	4902993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_008380	TCA	2	6	4902999	4903004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_008380	CGA	2	6	4903109	4903114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_008380	CGGT	2	8	4903323	4903330	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13023	NC_008380	ATG	2	6	4903363	4903368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_008380	GAC	2	6	4903392	4903397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_008380	CCGCG	2	10	4903433	4903442	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13026	NC_008380	CG	3	6	4903449	4903454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13027	NC_008380	TGC	2	6	4904938	4904943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_008380	GCG	2	6	4904975	4904980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_008380	TCA	2	6	4906022	4906027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_008380	TTC	2	6	4906059	4906064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_008380	CTC	2	6	4906103	4906108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13032	NC_008380	CGA	2	6	4906153	4906158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_008380	A	7	7	4906210	4906216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_008380	T	6	6	4906235	4906240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_008380	A	6	6	4906246	4906251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_008380	CGG	3	9	4906863	4906871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_008380	GTCA	2	8	4906882	4906889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13038	NC_008380	GTA	2	6	4906905	4906910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_008380	CTT	2	6	4906956	4906961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_008380	AAT	2	6	4907110	4907115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_008380	GAA	2	6	4907567	4907572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_008380	GGA	2	6	4907634	4907639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_008380	CGC	2	6	4907743	4907748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13044	NC_008380	CTC	2	6	4911484	4911489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13045	NC_008380	ACA	2	6	4911501	4911506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_008380	GCC	2	6	4911518	4911523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13047	NC_008380	CGA	2	6	4911627	4911632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_008380	CT	3	6	4911720	4911725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13049	NC_008380	CGG	2	6	4911915	4911920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_008380	CCG	2	6	4911940	4911945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_008380	TG	3	6	4912202	4912207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_008380	TCCA	2	8	4912215	4912222	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13053	NC_008380	ATGAA	2	10	4912231	4912240	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_008380	AC	3	6	4912245	4912250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_008380	TAC	2	6	4912265	4912270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_008380	ATTATC	2	12	4912372	4912383	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13057	NC_008380	GCC	2	6	4912804	4912809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13058	NC_008380	GGCA	2	8	4912815	4912822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13059	NC_008380	GCAG	2	8	4912848	4912855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13060	NC_008380	GCC	2	6	4912857	4912862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13061	NC_008380	TCG	2	6	4912914	4912919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_008380	CAC	2	6	4912966	4912971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_008380	CCG	2	6	4913035	4913040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13064	NC_008380	CAC	2	6	4913062	4913067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13065	NC_008380	CGA	2	6	4913222	4913227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13073	NC_008380	GGA	2	6	4915463	4915468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_008380	CAT	2	6	4916496	4916501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13076	NC_008380	ATATT	2	10	4916548	4916557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_008380	CGG	2	6	4916854	4916859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13078	NC_008380	GC	3	6	4916892	4916897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13079	NC_008380	T	6	6	4916939	4916944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13091	NC_008380	TCC	2	6	4924962	4924967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13092	NC_008380	TGC	2	6	4925897	4925902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13094	NC_008380	GGAT	2	8	4925978	4925985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13097	NC_008380	CAC	2	6	4926950	4926955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13098	NC_008380	AGAA	2	8	4926966	4926973	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_008380	ATG	2	6	4928426	4928431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13101	NC_008380	T	7	7	4928472	4928478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_008380	ATC	2	6	4928521	4928526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_008380	TGG	2	6	4929180	4929185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13106	NC_008380	A	6	6	4932949	4932954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_008380	CGG	2	6	4933795	4933800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13110	NC_008380	GCCATC	2	12	4933924	4933935	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13111	NC_008380	TCG	2	6	4933936	4933941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_008380	ATCA	2	8	4933964	4933971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13113	NC_008380	GCATC	2	10	4934029	4934038	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13114	NC_008380	TTTG	2	8	4935886	4935893	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_008380	GATC	2	8	4935907	4935914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13122	NC_008380	GGCC	2	8	4936380	4936387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13123	NC_008380	GA	3	6	4936529	4936534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_008380	TC	3	6	4936557	4936562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13125	NC_008380	GTAT	2	8	4936632	4936639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13254	NC_008380	CG	3	6	4980740	4980745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13384	NC_008380	GCT	2	6	5055602	5055607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13386	NC_008380	TGC	2	6	5056289	5056294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13387	NC_008380	ATC	2	6	5056300	5056305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13388	NC_008380	TCC	2	6	5056313	5056318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13389	NC_008380	GCC	2	6	5056327	5056332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13390	NC_008380	GACC	2	8	5056408	5056415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13391	NC_008380	TCT	2	6	5056443	5056448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13392	NC_008380	GAT	2	6	5056492	5056497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13393	NC_008380	ATC	2	6	5056532	5056537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13394	NC_008380	CGA	2	6	5056641	5056646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13395	NC_008380	AGC	2	6	5056670	5056675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13399	NC_008380	ATCG	2	8	5056909	5056916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13400	NC_008380	GCG	2	6	5057020	5057025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13401	NC_008380	CCTG	2	8	5057129	5057136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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