MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008380	CGG	2	6	227273	227278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_008380	GCC	2	6	227306	227311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_008380	AAG	2	6	227323	227328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008380	GCCG	2	8	227350	227357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_008380	GCA	2	6	227384	227389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_008380	TCGA	2	8	228783	228790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
507	NC_008380	TAA	2	6	228985	228990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008380	GAT	2	6	229060	229065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008380	GCA	2	6	229098	229103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_008380	GCG	2	6	229111	229116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_008380	CTGG	2	8	229187	229194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
512	NC_008380	CCG	3	9	229198	229206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_008380	GAT	2	6	229285	229290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008380	GAAT	2	8	230413	230420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008380	ATC	2	6	230422	230427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008380	GAT	2	6	230448	230453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008380	GAC	2	6	230954	230959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_008380	AC	3	6	231088	231093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_008380	T	6	6	231135	231140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008380	TCG	2	6	231167	231172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_008380	AT	3	6	231183	231188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008380	T	6	6	231226	231231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008380	CTT	2	6	231234	231239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_008380	CGGC	2	8	231319	231326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_008380	GGA	2	6	231353	231358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008380	GGT	2	6	231684	231689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008380	CGG	2	6	231705	231710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_008380	CCG	2	6	231739	231744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_008380	GC	3	6	231896	231901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_008380	G	6	6	231914	231919	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008380	GGT	2	6	231925	231930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008380	GGA	2	6	231960	231965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008380	CAA	2	6	231980	231985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_008380	CGA	2	6	233009	233014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_008380	ATG	2	6	237929	237934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008380	CAT	2	6	237963	237968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_008380	TCCT	2	8	240623	240630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_008380	GAAC	2	8	240722	240729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_008380	AAGG	2	8	240760	240767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008380	TTCT	2	8	241418	241425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_008380	TTTC	2	8	241434	241441	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_008380	ATC	2	6	241486	241491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_008380	GA	3	6	243745	243750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008380	GGC	2	6	243779	243784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_008380	TGC	2	6	243803	243808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008380	CG	3	6	243833	243838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_008380	GTC	2	6	245138	245143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_008380	CGTT	2	8	245155	245162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
549	NC_008380	ACG	2	6	245184	245189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_008380	A	6	6	245682	245687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008380	GCG	2	6	245763	245768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_008380	TGT	2	6	245885	245890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008380	GCC	2	6	246210	246215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_008380	CGGAA	2	10	250028	250037	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
555	NC_008380	GCGCCG	2	12	254847	254858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_008380	AGA	2	6	254881	254886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008380	CCG	3	9	254940	254948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_008380	GAC	2	6	254970	254975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_008380	GC	3	6	254985	254990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_008380	AG	4	8	255029	255036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008380	ATG	2	6	255680	255685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008380	GAC	2	6	255709	255714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008380	CAT	2	6	255739	255744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_008380	TC	3	6	255747	255752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_008380	GAC	2	6	255771	255776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_008380	CCG	2	6	256748	256753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_008380	CGCGC	2	10	258204	258213	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
568	NC_008380	GGC	2	6	258251	258256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008380	GCC	2	6	258264	258269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_008380	TGCATG	2	12	258273	258284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
571	NC_008380	GGA	2	6	260974	260979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008380	ACCT	2	8	262897	262904	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_008380	GAC	3	9	264467	264475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_008380	GAG	2	6	264483	264488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008380	CA	4	8	264507	264514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_008380	TG	3	6	264525	264530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008380	A	6	6	264543	264548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008380	TC	3	6	265514	265519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_008380	AG	3	6	265544	265549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008380	GGC	2	6	266582	266587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_008380	GCA	2	6	266645	266650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_008380	CG	3	6	266691	266696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_008380	A	6	6	266713	266718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008380	CGGG	2	8	267080	267087	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
585	NC_008380	CTA	2	6	267237	267242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008380	CGA	2	6	267302	267307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_008380	A	6	6	267312	267317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008380	AGAA	2	8	267344	267351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008380	TCGA	2	8	267394	267401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_008380	CCG	2	6	267405	267410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_008380	GCA	2	6	270443	270448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_008380	TGC	2	6	270486	270491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_008380	GGCA	2	8	270493	270500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
594	NC_008380	GCC	2	6	271453	271458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_008380	TCAT	2	8	271505	271512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_008380	ATG	2	6	272687	272692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_008380	GAC	2	6	272716	272721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_008380	ATC	2	6	272782	272787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_008380	CG	3	6	272800	272805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_008380	GGC	2	6	274042	274047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_008380	TGC	2	6	274090	274095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_008380	CGA	2	6	274104	274109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008380	TCCG	2	8	276984	276991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
604	NC_008380	CGAT	2	8	277499	277506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_008380	CGA	2	6	277507	277512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008380	CGG	2	6	277540	277545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_008380	TGAG	2	8	277598	277605	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_008380	CGT	2	6	277633	277638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_008380	TCG	2	6	277661	277666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_008380	CGA	2	6	277795	277800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008380	TTGAA	2	10	279768	279777	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008380	CCA	2	6	279797	279802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_008380	ATG	3	9	279834	279842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008380	CCG	2	6	280006	280011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_008380	ATCAA	2	10	280822	280831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
616	NC_008380	TCG	2	6	280838	280843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_008380	GGC	2	6	281524	281529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_008380	GGC	3	9	281550	281558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_008380	AGA	2	6	281606	281611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008380	TTGAA	2	10	281639	281648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008380	ACG	2	6	281670	281675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_008380	CCG	2	6	283457	283462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_008380	GGAA	2	8	283465	283472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008380	ACC	2	6	286573	286578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_008380	GCC	2	6	286585	286590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_008380	TA	3	6	287024	287029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008380	TGG	2	6	287035	287040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008380	CGC	2	6	287053	287058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_008380	CTGG	2	8	287527	287534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
630	NC_008380	GAATG	2	10	287606	287615	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008380	AGA	2	6	287622	287627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008380	AGC	2	6	287776	287781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_008380	TA	3	6	287838	287843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008380	CAT	2	6	288695	288700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_008380	TTAA	2	8	288712	288719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_008380	GC	3	6	288780	288785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_008380	GGT	2	6	290719	290724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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