MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008380	CGA	3	9	2289599	2289607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_008380	CGCC	2	8	2289631	2289638	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6003	NC_008380	CCA	2	6	2289745	2289750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_008380	GT	3	6	2289801	2289806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_008380	CGT	2	6	2291161	2291166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_008380	CTAT	2	8	2291229	2291236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6007	NC_008380	AAG	2	6	2291243	2291248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_008380	CGA	2	6	2291529	2291534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_008380	TGA	2	6	2291546	2291551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_008380	TCC	2	6	2291560	2291565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_008380	CAG	2	6	2291598	2291603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_008380	CGC	2	6	2291668	2291673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_008380	GCT	2	6	2291771	2291776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_008380	CG	3	6	2291804	2291809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_008380	AGC	2	6	2291878	2291883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_008380	CCA	2	6	2291990	2291995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_008380	CG	3	6	2292003	2292008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_008380	CG	3	6	2292072	2292077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_008380	AGA	2	6	2292142	2292147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_008380	TCCG	2	8	2292264	2292271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6021	NC_008380	GGC	2	6	2292450	2292455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_008380	CGA	2	6	2292467	2292472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_008380	GAA	2	6	2292486	2292491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_008380	CTT	2	6	2292492	2292497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_008380	GAT	2	6	2292531	2292536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_008380	AAC	2	6	2292640	2292645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_008380	GGA	2	6	2292648	2292653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_008380	AAG	2	6	2292663	2292668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_008380	AG	3	6	2292688	2292693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_008380	GCA	2	6	2292755	2292760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_008380	CGT	2	6	2292866	2292871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_008380	A	6	6	2292890	2292895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_008380	CG	3	6	2292932	2292937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_008380	TGAG	2	8	2292949	2292956	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_008380	CAC	2	6	2293029	2293034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_008380	CGA	2	6	2293214	2293219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_008380	CGT	2	6	2293220	2293225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_008380	TCG	2	6	2293226	2293231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_008380	CTC	2	6	2295418	2295423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_008380	ACT	2	6	2296402	2296407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_008380	GAT	2	6	2296420	2296425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_008380	ATTT	2	8	2296443	2296450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_008380	GT	3	6	2296465	2296470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_008380	GTCG	2	8	2296553	2296560	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_008380	AGGGA	2	10	2296565	2296574	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_008380	TTCA	2	8	2296606	2296613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6047	NC_008380	ACGC	2	8	2296681	2296688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_008380	ATG	2	6	2296694	2296699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_008380	GC	3	6	2296720	2296725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_008380	AAG	2	6	2296753	2296758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_008380	CGC	2	6	2296905	2296910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_008380	GGA	2	6	2296912	2296917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_008380	GTG	2	6	2296969	2296974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_008380	GTT	2	6	2297004	2297009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_008380	GAT	3	9	2297019	2297027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_008380	CGC	2	6	2297048	2297053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_008380	GGA	2	6	2297153	2297158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_008380	ATAG	2	8	2297168	2297175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_008380	GTCG	2	8	2297177	2297184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_008380	GAT	2	6	2297219	2297224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_008380	CGGG	2	8	2297244	2297251	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6062	NC_008380	TCT	2	6	2297313	2297318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_008380	TGA	2	6	2297374	2297379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_008380	CG	3	6	2297540	2297545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_008380	GAC	2	6	2297587	2297592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_008380	GCC	2	6	2297702	2297707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_008380	CG	3	6	2297738	2297743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_008380	GATC	2	8	2297751	2297758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_008380	CCA	2	6	2298429	2298434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_008380	TTG	2	6	2298471	2298476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_008380	CG	3	6	2298492	2298497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_008380	CAT	2	6	2298628	2298633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_008380	GA	3	6	2299252	2299257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_008380	TGT	2	6	2299355	2299360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_008380	CAT	2	6	2299375	2299380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_008380	AATACG	2	12	2299402	2299413	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6077	NC_008380	CCG	2	6	2299421	2299426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_008380	CAG	2	6	2299488	2299493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_008380	CGA	2	6	2300064	2300069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_008380	TCT	2	6	2300083	2300088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_008380	CGT	2	6	2300089	2300094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_008380	TGC	2	6	2302809	2302814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_008380	GCG	2	6	2302857	2302862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_008380	GTC	2	6	2302894	2302899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_008380	AGGA	2	8	2302937	2302944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_008380	GCA	2	6	2305721	2305726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_008380	TAC	2	6	2308496	2308501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_008380	TGT	2	6	2308503	2308508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_008380	ACA	2	6	2308529	2308534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_008380	GCC	2	6	2308570	2308575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_008380	A	6	6	2308619	2308624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_008380	AGG	2	6	2308645	2308650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_008380	AGC	2	6	2308693	2308698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_008380	GCT	2	6	2308720	2308725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_008380	T	6	6	2309279	2309284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_008380	TTC	2	6	2309381	2309386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_008380	CA	3	6	2309518	2309523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_008380	GT	3	6	2309547	2309552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_008380	AT	3	6	2309558	2309563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_008380	CAG	2	6	2309597	2309602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_008380	CGT	2	6	2309666	2309671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_008380	AG	3	6	2309762	2309767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_008380	TTCG	2	8	2309821	2309828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_008380	TGGGT	2	10	2309833	2309842	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_008380	CAT	2	6	2309869	2309874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_008380	TCAAGG	2	12	2309904	2309915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6107	NC_008380	GAA	2	6	2309938	2309943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_008380	GAC	2	6	2309948	2309953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_008380	AGC	2	6	2311506	2311511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_008380	CGA	2	6	2311520	2311525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_008380	GCG	2	6	2311555	2311560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_008380	CT	3	6	2311613	2311618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_008380	CGT	2	6	2311645	2311650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_008380	CATTTT	2	12	2317949	2317960	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6115	NC_008380	CGG	2	6	2317973	2317978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_008380	T	6	6	2317981	2317986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_008380	CAA	2	6	2318144	2318149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_008380	TTC	2	6	2318217	2318222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_008380	AGCG	2	8	2318223	2318230	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_008380	AGC	2	6	2318232	2318237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_008380	CT	3	6	2318275	2318280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_008380	TTG	2	6	2318309	2318314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_008380	GGC	2	6	2319164	2319169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_008380	GTG	2	6	2319205	2319210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_008380	A	6	6	2319226	2319231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_008380	CGG	2	6	2319327	2319332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_008380	TTC	2	6	2319361	2319366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6129	NC_008380	CGC	2	6	2319712	2319717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6252	NC_008380	GCC	2	6	2385825	2385830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6254	NC_008380	C	6	6	2385874	2385879	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6255	NC_008380	GC	3	6	2385941	2385946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6256	NC_008380	CCGA	2	8	2386024	2386031	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6257	NC_008380	CGCTGC	2	12	2386053	2386064	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6258	NC_008380	TAC	2	6	2386079	2386084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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