MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008380	ATT	2	6	2139819	2139824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_008380	GTT	2	6	2139860	2139865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_008380	A	6	6	2139971	2139976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_008380	CCA	2	6	2140034	2140039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_008380	GTG	2	6	2140085	2140090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_008380	CGA	2	6	2140737	2140742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_008380	CTC	2	6	2140792	2140797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_008380	TCC	2	6	2140803	2140808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_008380	T	6	6	2141706	2141711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_008380	CGC	2	6	2141717	2141722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_008380	CAT	2	6	2141740	2141745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_008380	CGC	2	6	2141755	2141760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_008380	CGG	2	6	2141763	2141768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_008380	CGGA	2	8	2141771	2141778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_008380	CCG	2	6	2141815	2141820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_008380	CATT	2	8	2141880	2141887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_008380	GAT	2	6	2141896	2141901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_008380	T	7	7	2141901	2141907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_008380	GTG	2	6	2141931	2141936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_008380	GTT	2	6	2141967	2141972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_008380	T	6	6	2142920	2142925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_008380	TGT	2	6	2145996	2146001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_008380	CAA	2	6	2146060	2146065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_008380	TTA	2	6	2146081	2146086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008380	T	6	6	2146093	2146098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_008380	GTC	2	6	2146196	2146201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_008380	CTG	2	6	2146209	2146214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_008380	GAA	2	6	2147523	2147528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_008380	GAG	2	6	2147531	2147536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_008380	CTT	2	6	2147554	2147559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_008380	ACG	2	6	2147625	2147630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_008380	TGG	4	12	2147640	2147651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_008380	GGCA	2	8	2147712	2147719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_008380	TAG	2	6	2147735	2147740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_008380	T	7	7	2147751	2147757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_008380	GTC	2	6	2147864	2147869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_008380	AGC	2	6	2147908	2147913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_008380	GGT	2	6	2148047	2148052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_008380	CGC	2	6	2148134	2148139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_008380	TCGC	2	8	2148144	2148151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_008380	GCC	2	6	2148195	2148200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_008380	GAAA	2	8	2148215	2148222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_008380	TGCG	2	8	2149888	2149895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_008380	CTT	2	6	2149896	2149901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_008380	CCGG	2	8	2149938	2149945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_008380	TTC	2	6	2149952	2149957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_008380	TCC	2	6	2150329	2150334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_008380	GA	3	6	2150353	2150358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_008380	GAT	2	6	2150429	2150434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_008380	GGC	2	6	2150500	2150505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_008380	T	6	6	2156904	2156909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_008380	GCG	2	6	2156925	2156930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_008380	CCG	2	6	2156943	2156948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_008380	T	6	6	2156952	2156957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_008380	GC	3	6	2158122	2158127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_008380	CATG	2	8	2159638	2159645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5557	NC_008380	TGG	2	6	2159656	2159661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_008380	CCA	2	6	2159662	2159667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_008380	GCG	2	6	2161477	2161482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_008380	AATCGG	2	12	2161527	2161538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5561	NC_008380	GCA	2	6	2161552	2161557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_008380	GCG	2	6	2161601	2161606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_008380	ACG	2	6	2161671	2161676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_008380	GAT	2	6	2164394	2164399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_008380	GC	3	6	2164439	2164444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_008380	A	7	7	2164535	2164541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_008380	GCC	2	6	2166262	2166267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_008380	GCC	2	6	2166294	2166299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_008380	GAC	2	6	2166325	2166330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_008380	CCT	2	6	2167275	2167280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_008380	TGCGA	2	10	2167411	2167420	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5572	NC_008380	CGG	2	6	2167444	2167449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_008380	AG	3	6	2167538	2167543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_008380	CCG	2	6	2167552	2167557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_008380	GAG	2	6	2167567	2167572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_008380	TCG	2	6	2167961	2167966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_008380	CG	3	6	2171788	2171793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5578	NC_008380	G	6	6	2172334	2172339	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_008380	GCC	2	6	2174021	2174026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_008380	ACG	2	6	2174042	2174047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_008380	CTT	2	6	2174061	2174066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_008380	TCT	2	6	2174089	2174094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_008380	CGG	2	6	2174111	2174116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_008380	TC	3	6	2174126	2174131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_008380	TA	3	6	2174145	2174150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_008380	ATG	2	6	2174211	2174216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_008380	T	6	6	2174239	2174244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_008380	CCG	2	6	2174276	2174281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_008380	CCA	2	6	2174285	2174290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_008380	TCGA	2	8	2174335	2174342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5591	NC_008380	GAG	2	6	2174359	2174364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_008380	GATG	2	8	2174410	2174417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_008380	GA	3	6	2174515	2174520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_008380	CAG	2	6	2174558	2174563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_008380	TGA	2	6	2174589	2174594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_008380	AT	3	6	2174600	2174605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_008380	T	6	6	2174696	2174701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_008380	GCT	2	6	2174779	2174784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_008380	TCC	2	6	2174785	2174790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_008380	TGG	2	6	2174866	2174871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_008380	GGC	2	6	2174872	2174877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_008380	GAC	2	6	2174880	2174885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_008380	CGC	2	6	2174923	2174928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5604	NC_008380	CGCC	2	8	2174962	2174969	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5605	NC_008380	CGG	2	6	2174981	2174986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_008380	TGAC	2	8	2174998	2175005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5607	NC_008380	GAG	3	9	2175012	2175020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_008380	GC	3	6	2175039	2175044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_008380	GAG	3	9	2175048	2175056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_008380	GCCGG	2	10	2175110	2175119	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5611	NC_008380	AAT	2	6	2175182	2175187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_008380	TGC	2	6	2175334	2175339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_008380	TCG	2	6	2177093	2177098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_008380	CGC	2	6	2177191	2177196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_008380	AGGCAT	2	12	2177218	2177229	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5616	NC_008380	TC	3	6	2177312	2177317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5617	NC_008380	GTT	2	6	2177359	2177364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_008380	CG	3	6	2177447	2177452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5619	NC_008380	CGT	2	6	2177466	2177471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_008380	AACG	2	8	2177481	2177488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5621	NC_008380	GCC	2	6	2177502	2177507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_008380	CGC	2	6	2179091	2179096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_008380	AAC	2	6	2179123	2179128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_008380	TGG	2	6	2179171	2179176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_008380	CAA	2	6	2179618	2179623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_008380	GCG	2	6	2179663	2179668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_008380	TGC	2	6	2179702	2179707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_008380	GCC	2	6	2179725	2179730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5629	NC_008380	TATC	2	8	2181520	2181527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5631	NC_008380	AGG	2	6	2181601	2181606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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