MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008380	GGA	2	6	1956027	1956032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_008380	CG	3	6	1957176	1957181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_008380	GAG	2	6	1957199	1957204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_008380	TCC	2	6	1958589	1958594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_008380	GAA	2	6	1960292	1960297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_008380	CTT	2	6	1960305	1960310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_008380	AGA	2	6	1960428	1960433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_008380	GAT	2	6	1960455	1960460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_008380	GAT	2	6	1960564	1960569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_008380	TGC	2	6	1960595	1960600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_008380	GAC	2	6	1960605	1960610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_008380	GA	3	6	1960613	1960618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_008380	AAGG	2	8	1961992	1961999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008380	TGAC	2	8	1962017	1962024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_008380	AGC	2	6	1962046	1962051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_008380	TGG	2	6	1962066	1962071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_008380	TGC	2	6	1962102	1962107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_008380	CT	3	6	1962998	1963003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_008380	GCG	2	6	1963033	1963038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_008380	CG	3	6	1965774	1965779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_008380	CG	4	8	1965796	1965803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_008380	TGC	2	6	1965846	1965851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_008380	GAT	2	6	1965853	1965858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_008380	CGA	2	6	1965919	1965924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_008380	CCT	2	6	1969011	1969016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_008380	ATG	2	6	1969034	1969039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_008380	AG	4	8	1969048	1969055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_008380	GGA	2	6	1969122	1969127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_008380	CAC	2	6	1969634	1969639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_008380	GCG	2	6	1970017	1970022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_008380	TCGC	2	8	1970032	1970039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_008380	GC	3	6	1970061	1970066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_008380	ACG	2	6	1970133	1970138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_008380	ACG	2	6	1970160	1970165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_008380	CGA	2	6	1970167	1970172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_008380	CG	3	6	1970205	1970210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_008380	GTCG	2	8	1970232	1970239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_008380	CGG	3	9	1970267	1970275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_008380	CTT	2	6	1971926	1971931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_008380	CGTC	2	8	1971940	1971947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_008380	GCG	3	9	1971953	1971961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_008380	GAG	2	6	1971969	1971974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008380	TGA	2	6	1973391	1973396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_008380	ACG	2	6	1973403	1973408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_008380	GCG	2	6	1973416	1973421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_008380	AGG	2	6	1973451	1973456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_008380	CCA	2	6	1974191	1974196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_008380	CGAAA	2	10	1974261	1974270	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5049	NC_008380	TCG	2	6	1974296	1974301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_008380	TTG	2	6	1974319	1974324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_008380	GCC	2	6	1974360	1974365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_008380	CCG	2	6	1974447	1974452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_008380	CCTC	2	8	1977091	1977098	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5054	NC_008380	TGA	2	6	1977131	1977136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008380	AAC	2	6	1977187	1977192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_008380	TCGA	2	8	1978371	1978378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_008380	GAG	2	6	1978379	1978384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_008380	TCC	2	6	1979080	1979085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_008380	GA	3	6	1979119	1979124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_008380	CCCT	2	8	1979138	1979145	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5061	NC_008380	CCT	2	6	1979804	1979809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_008380	ATG	2	6	1979843	1979848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_008380	CGA	2	6	1979893	1979898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_008380	GC	3	6	1979929	1979934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_008380	GTC	2	6	1979968	1979973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_008380	ACA	2	6	1979995	1980000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_008380	CA	3	6	1979999	1980004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_008380	GCG	2	6	1981657	1981662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_008380	GCAAG	2	10	1981697	1981706	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5070	NC_008380	GTC	2	6	1981722	1981727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_008380	CCTG	2	8	1981735	1981742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_008380	GAA	2	6	1981760	1981765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_008380	GTGC	2	8	1981820	1981827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_008380	TCG	2	6	1981839	1981844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_008380	AGACG	2	10	1981847	1981856	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5076	NC_008380	TTC	2	6	1981881	1981886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_008380	GCAA	2	8	1981893	1981900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5078	NC_008380	AGGC	4	16	1981903	1981918	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_008380	CG	3	6	1983174	1983179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_008380	CGA	2	6	1983183	1983188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5082	NC_008380	TG	3	6	1983287	1983292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_008380	ACG	2	6	1983311	1983316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_008380	TTCGA	2	10	1983326	1983335	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5085	NC_008380	CGAC	2	8	1983427	1983434	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_008380	GGC	2	6	1983456	1983461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5089	NC_008380	AAG	2	6	1983550	1983555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_008380	GGC	2	6	1983590	1983595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_008380	AC	3	6	1983599	1983604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_008380	GGA	2	6	1983613	1983618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_008380	TCG	2	6	1984348	1984353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_008380	GATC	2	8	1990143	1990150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_008380	TGC	2	6	1990681	1990686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5098	NC_008380	ATC	2	6	1990801	1990806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_008380	TTC	2	6	1990832	1990837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_008380	AATG	2	8	1990908	1990915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_008380	GC	3	6	1992112	1992117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_008380	TTC	2	6	1997991	1997996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_008380	ATCCT	2	10	1998138	1998147	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5104	NC_008380	GGC	2	6	1998216	1998221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5107	NC_008380	ACG	2	6	1998744	1998749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5109	NC_008380	GCC	2	6	1998884	1998889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_008380	GAC	3	9	1998924	1998932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_008380	GTT	2	6	1998967	1998972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_008380	GCGA	2	8	1998985	1998992	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_008380	GAA	2	6	1999055	1999060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008380	TAT	2	6	1999142	1999147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008380	CTC	2	6	1999172	1999177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_008380	CCG	2	6	1999187	1999192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_008380	GCGT	2	8	1999272	1999279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_008380	ACG	2	6	1999321	1999326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_008380	CT	3	6	1999350	1999355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_008380	CGCA	2	8	1999387	1999394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_008380	GC	3	6	1999409	1999414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_008380	CGC	2	6	2000915	2000920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_008380	TTG	2	6	2000927	2000932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_008380	TTG	2	6	2000996	2001001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_008380	TGGAA	2	10	2001006	2001015	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_008380	GA	3	6	2001045	2001050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_008380	CGA	2	6	2001104	2001109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5129	NC_008380	CAG	2	6	2001279	2001284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5131	NC_008380	CCG	2	6	2001367	2001372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5262	NC_008380	ATG	2	6	2064788	2064793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_008380	ATG	2	6	2064819	2064824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5266	NC_008380	GCCG	2	8	2065482	2065489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5293	NC_008380	CCT	2	6	2078479	2078484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5387	NC_008380	GCA	2	6	2118049	2118054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5390	NC_008380	CAT	2	6	2122249	2122254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5392	NC_008380	GCG	2	6	2123375	2123380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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