MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008378	TG	3	6	9583	9588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008378	GC	3	6	10111	10116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008378	GA	3	6	11637	11642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008378	CG	3	6	20121	20126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008378	CT	3	6	24856	24861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008378	CT	3	6	24865	24870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008378	CG	3	6	27768	27773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008378	GA	3	6	38273	38278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008378	GA	3	6	45038	45043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008378	AG	4	8	45066	45073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008378	AG	3	6	45099	45104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008378	GA	3	6	47206	47211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008378	TA	3	6	57456	57461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008378	CG	3	6	65170	65175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008378	CG	3	6	67197	67202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008378	CG	3	6	73066	73071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008378	GC	3	6	82944	82949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008378	AT	3	6	88180	88185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008378	GT	3	6	88246	88251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008378	AG	3	6	95945	95950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008378	AT	3	6	97969	97974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008378	AG	3	6	99311	99316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008378	CG	3	6	102490	102495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008378	GC	3	6	104906	104911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008378	CG	3	6	105073	105078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008378	CG	3	6	105579	105584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008378	CG	3	6	131510	131515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008378	TG	3	6	134622	134627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008378	CG	3	6	148670	148675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008378	GA	3	6	168762	168767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008378	AG	3	6	189869	189874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008378	CG	3	6	190575	190580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008378	GT	3	6	192676	192681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008378	TC	4	8	209133	209140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008378	GC	3	6	212727	212732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008378	TA	4	8	212921	212928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008378	CG	3	6	213132	213137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008378	AG	3	6	213182	213187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008378	GT	3	6	220480	220485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008378	CT	3	6	225005	225010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008378	GA	3	6	226986	226991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008378	AT	4	8	250270	250277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008378	GC	3	6	256785	256790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008378	GC	3	6	256802	256807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008378	CG	3	6	284850	284855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008378	TG	3	6	286762	286767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008378	TG	4	8	288013	288020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008378	GC	3	6	289663	289668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008378	CG	3	6	294627	294632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008378	CG	3	6	302328	302333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008378	CG	3	6	302346	302351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008378	AT	3	6	309401	309406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008378	TC	3	6	309464	309469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008378	CT	3	6	314171	314176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008378	GC	3	6	321164	321169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008378	GC	3	6	321347	321352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008378	TC	3	6	323201	323206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008378	CG	3	6	330016	330021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008378	GC	3	6	343418	343423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008378	AC	3	6	346747	346752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008378	CG	3	6	367192	367197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008378	GC	5	10	367341	367350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008378	CG	3	6	367374	367379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008378	TG	3	6	368138	368143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008378	TC	3	6	372768	372773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008378	GC	3	6	378407	378412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008378	GA	3	6	391082	391087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008378	TA	3	6	394081	394086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008378	GA	3	6	399493	399498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008378	AG	3	6	400830	400835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008378	GC	3	6	405165	405170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008378	GC	3	6	405702	405707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008378	GA	3	6	406574	406579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008378	TC	3	6	406829	406834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008378	CG	3	6	406951	406956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008378	TC	3	6	407293	407298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008378	GA	3	6	407472	407477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008378	CG	3	6	407478	407483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008378	CG	3	6	407516	407521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008378	GC	3	6	407608	407613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008378	GA	3	6	407785	407790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008378	GC	3	6	408032	408037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008378	GC	3	6	411014	411019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008378	AG	3	6	411732	411737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008378	GT	3	6	411800	411805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008378	CG	4	8	431127	431134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008378	GC	3	6	431698	431703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008378	AG	3	6	432508	432513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008378	CG	3	6	436819	436824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008378	GC	3	6	456814	456819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008378	GC	3	6	461201	461206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008378	CA	4	8	461354	461361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008378	CG	3	6	463029	463034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008378	GC	3	6	466986	466991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008378	GC	3	6	467002	467007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008378	CG	3	6	469632	469637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008378	TC	3	6	470883	470888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008378	CA	3	6	472249	472254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008378	CG	4	8	482559	482566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008378	GT	3	6	482736	482741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008378	CG	3	6	483872	483877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008378	CG	3	6	493378	493383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008378	AG	3	6	493460	493465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008378	CG	3	6	495099	495104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008378	TC	3	6	495147	495152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008378	GC	3	6	513307	513312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008378	CG	3	6	515184	515189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008378	CG	3	6	515348	515353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008378	GC	3	6	515741	515746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008378	GC	3	6	516041	516046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008378	GC	3	6	516145	516150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008378	CG	3	6	516438	516443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008378	GC	3	6	517286	517291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008378	CG	3	6	517310	517315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008378	GA	3	6	518192	518197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008378	CG	3	6	553304	553309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008378	GC	3	6	568292	568297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008378	CG	3	6	571807	571812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008378	CG	3	6	571994	571999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008378	GC	3	6	592140	592145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008378	GC	3	6	593687	593692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008378	CG	3	6	598585	598590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008378	TC	3	6	598599	598604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008378	GA	3	6	622246	622251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008378	GC	3	6	622290	622295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008378	CT	3	6	622333	622338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008378	GA	3	6	622468	622473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008378	TC	3	6	624953	624958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008378	CG	3	6	628709	628714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008378	CG	3	6	630908	630913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008378	CA	3	6	633355	633360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008378	TC	3	6	634731	634736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008378	GC	3	6	644223	644228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008378	GC	3	6	644348	644353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008378	AT	3	6	645981	645986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008378	GC	3	6	659035	659040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008378	TG	3	6	664254	664259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008378	GA	3	6	670660	670665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008378	GC	3	6	673989	673994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008378	CG	3	6	676638	676643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008378	TA	3	6	693236	693241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008378	CT	3	6	694200	694205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008378	TG	3	6	695702	695707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008378	CG	3	6	695712	695717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008378	CG	4	8	698213	698220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008378	CG	3	6	699847	699852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008378	CG	3	6	700068	700073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008378	CG	3	6	700608	700613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008378	AT	3	6	706748	706753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008378	CG	3	6	706808	706813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008378	GA	3	6	715782	715787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008378	GA	3	6	723918	723923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008378	GC	4	8	725606	725613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.