MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 1646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008378	CGA	2	6	516277	516282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_008378	CGT	2	6	516286	516291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_008378	GCCG	2	8	516301	516308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_008378	CGG	2	6	516360	516365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_008378	GCA	2	6	516377	516382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_008378	CGC	2	6	516426	516431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_008378	CG	3	6	516438	516443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_008378	TCG	2	6	516444	516449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_008378	GCC	2	6	516464	516469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_008378	GTT	2	6	516470	516475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008378	GCT	2	6	516505	516510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_008378	GCC	2	6	516611	516616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_008378	CGG	2	6	516638	516643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_008378	CCG	2	6	516644	516649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_008378	CTG	2	6	516659	516664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_008378	CCGGCA	2	12	516675	516686	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_008378	TCGC	2	8	516704	516711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_008378	GGC	2	6	516725	516730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_008378	AGG	2	6	516768	516773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008378	CTC	2	6	516791	516796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_008378	C	6	6	516803	516808	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1022	NC_008378	GGC	2	6	516830	516835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_008378	TGC	3	9	516873	516881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_008378	CGA	2	6	516883	516888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_008378	TCT	2	6	516921	516926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_008378	ACC	2	6	516989	516994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_008378	GAT	2	6	517024	517029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008378	CGC	2	6	517030	517035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_008378	GCT	2	6	517084	517089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_008378	CCTT	2	8	517122	517129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_008378	ACG	2	6	517136	517141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_008378	TGC	2	6	517143	517148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_008378	TCG	2	6	517185	517190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_008378	GC	3	6	517286	517291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_008378	CG	3	6	517310	517315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_008378	GAA	2	6	517387	517392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008378	ACG	2	6	517416	517421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_008378	GCC	2	6	517451	517456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_008378	AGC	2	6	517531	517536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_008378	GAA	2	6	517539	517544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008378	CTGG	2	8	518107	518114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_008378	GA	3	6	518192	518197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008378	GAT	2	6	518222	518227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008378	AGG	2	6	526372	526377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008378	GCA	2	6	526389	526394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_008378	T	6	6	526398	526403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008378	AGG	2	6	526431	526436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008378	GAA	2	6	526473	526478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008378	GAG	2	6	526485	526490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008378	CGT	2	6	529611	529616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_008378	ATTC	2	8	536686	536693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_008378	TGA	2	6	538236	538241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008378	TTG	2	6	538250	538255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008378	CCT	2	6	538324	538329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_008378	GAA	2	6	538343	538348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008378	TTGT	2	8	538423	538430	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008378	GGA	2	6	538440	538445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008378	CCAAG	2	10	539727	539736	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1059	NC_008378	GCG	2	6	539792	539797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_008378	GAG	2	6	541423	541428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008378	TTC	2	6	543295	543300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_008378	CAA	2	6	543390	543395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_008378	CGG	2	6	545279	545284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_008378	TGC	2	6	545345	545350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_008378	CTG	2	6	546029	546034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_008378	GCG	2	6	546041	546046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_008378	GAG	2	6	546054	546059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008378	C	6	6	547655	547660	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1069	NC_008378	ATC	2	6	548552	548557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_008378	GAG	2	6	548560	548565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008378	GGA	2	6	549691	549696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008378	GCT	2	6	551176	551181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_008378	GGC	2	6	551182	551187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_008378	TCG	2	6	551218	551223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_008378	TGT	2	6	551242	551247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008378	CTG	2	6	551279	551284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_008378	CG	3	6	553304	553309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_008378	CGC	2	6	555936	555941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_008378	GAC	2	6	557280	557285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_008378	CGCCA	2	10	557336	557345	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1081	NC_008378	GGCA	2	8	557462	557469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_008378	GATG	2	8	557536	557543	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008378	GGCTT	2	10	557548	557557	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1084	NC_008378	CAT	2	6	557571	557576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_008378	CTTG	2	8	557704	557711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_008378	ATG	2	6	557798	557803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008378	CCG	2	6	557804	557809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_008378	TGAGT	2	10	557831	557840	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008378	AGA	2	6	558908	558913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008378	GGC	2	6	558942	558947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_008378	CAA	2	6	558995	559000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_008378	TTC	2	6	561001	561006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_008378	ATG	2	6	561090	561095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008378	GAC	2	6	561119	561124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_008378	ATC	2	6	561185	561190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_008378	T	6	6	563825	563830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008378	GCCG	2	8	565905	565912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_008378	TGA	2	6	565927	565932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008378	GC	3	6	568292	568297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_008378	CATA	2	8	568359	568366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_008378	GGGA	2	8	568382	568389	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008378	ATGA	2	8	569013	569020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008378	GCA	3	9	569059	569067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_008378	AGGA	2	8	569121	569128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_008378	GAG	2	6	571146	571151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_008378	CCG	2	6	571771	571776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_008378	CG	3	6	571807	571812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_008378	CGG	2	6	571822	571827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_008378	TGA	2	6	571844	571849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008378	CGC	2	6	571948	571953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_008378	CG	3	6	571994	571999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_008378	CAT	2	6	572019	572024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_008378	ATT	2	6	572066	572071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008378	CGC	2	6	576617	576622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_008378	CGT	2	6	577544	577549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_008378	GGC	2	6	577567	577572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_008378	GAA	2	6	577589	577594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_008378	GCG	2	6	581473	581478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_008378	GGC	2	6	581487	581492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_008378	TAAG	2	8	582536	582543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008378	GTT	2	6	584943	584948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008378	A	6	6	584959	584964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008378	CTC	2	6	587564	587569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_008378	CCG	2	6	587584	587589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_008378	AAT	2	6	587590	587595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008378	GGC	2	6	587670	587675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008378	ATC	2	6	587817	587822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_008378	GCT	2	6	591170	591175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_008378	CAG	2	6	592085	592090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_008378	GCA	2	6	592124	592129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_008378	GC	3	6	592140	592145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_008378	CTG	2	6	593107	593112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_008378	GCCG	2	8	593119	593126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_008378	TTCTGG	2	12	593132	593143	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1165	NC_008378	CGTC	2	8	610698	610705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1178	NC_008378	CGG	2	6	611334	611339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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