MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 1646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008378	TCC	2	6	289590	289595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_008378	CTGC	2	8	289600	289607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
503	NC_008378	ATG	2	6	289614	289619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008378	GC	3	6	289663	289668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_008378	CGG	2	6	289670	289675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_008378	AGC	2	6	289697	289702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008378	CCGG	2	8	289733	289740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_008378	GAT	2	6	289805	289810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008378	TCC	2	6	289859	289864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_008378	TCCTG	2	10	289866	289875	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
511	NC_008378	AGG	2	6	289887	289892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008378	GCAAA	2	10	289905	289914	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
513	NC_008378	TCG	2	6	291208	291213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_008378	CCG	2	6	291360	291365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_008378	GAC	2	6	293379	293384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008378	AGG	2	6	293474	293479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008378	GCCG	2	8	294541	294548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_008378	CCCA	2	8	294576	294583	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
519	NC_008378	ATC	2	6	294595	294600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_008378	CG	3	6	294627	294632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_008378	GCA	2	6	294637	294642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_008378	TCT	2	6	294648	294653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008378	TCA	2	6	294663	294668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_008378	CGA	2	6	294776	294781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_008378	T	6	6	296959	296964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008378	GCG	2	6	297541	297546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_008378	TCC	2	6	301022	301027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_008378	GGC	2	6	301032	301037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_008378	CTC	2	6	301044	301049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_008378	CGC	2	6	301054	301059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_008378	GCC	2	6	301089	301094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_008378	TTG	2	6	301115	301120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008378	GCC	2	6	301142	301147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_008378	GAG	2	6	301195	301200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008378	CCG	2	6	301262	301267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_008378	ATC	2	6	301277	301282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_008378	GGA	2	6	301285	301290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008378	CG	3	6	302328	302333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_008378	CG	3	6	302346	302351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_008378	CGG	2	6	306701	306706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_008378	GCC	2	6	306720	306725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_008378	GAAA	2	8	308403	308410	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008378	TCG	2	6	308519	308524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_008378	TAT	2	6	309391	309396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008378	AT	3	6	309401	309406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008378	TC	3	6	309464	309469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_008378	CCT	2	6	312139	312144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_008378	CCGC	2	8	312161	312168	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
549	NC_008378	GAC	2	6	313402	313407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_008378	A	6	6	313484	313489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008378	CGA	2	6	314151	314156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_008378	CT	3	6	314171	314176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_008378	GCC	2	6	314178	314183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_008378	TCA	2	6	315722	315727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_008378	ACC	2	6	317333	317338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_008378	GC	3	6	321164	321169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_008378	CTG	2	6	321181	321186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008378	CCT	2	6	321203	321208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_008378	CGCC	2	8	321336	321343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
560	NC_008378	GC	3	6	321347	321352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_008378	A	7	7	321354	321360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008378	A	6	6	321375	321380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008378	TCA	2	6	321396	321401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_008378	TC	3	6	323201	323206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_008378	ATT	2	6	323237	323242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008378	AGG	2	6	323334	323339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008378	CCTC	2	8	323350	323357	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
568	NC_008378	CCG	2	6	324404	324409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_008378	TCC	2	6	324448	324453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_008378	ATG	2	6	329910	329915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008378	CGA	2	6	329921	329926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_008378	GAT	2	6	329962	329967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008378	CG	3	6	330016	330021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_008378	GCG	2	6	331929	331934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_008378	TCT	2	6	332014	332019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_008378	AGC	2	6	332089	332094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_008378	GCGA	2	8	332099	332106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
578	NC_008378	CCG	2	6	338269	338274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_008378	CCCAG	2	10	338278	338287	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
580	NC_008378	TCG	2	6	338355	338360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_008378	TGA	2	6	338396	338401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008378	TGA	2	6	338448	338453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008378	T	7	7	338457	338463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008378	CTA	2	6	338505	338510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_008378	T	6	6	342811	342816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008378	GAC	2	6	343397	343402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_008378	GC	3	6	343418	343423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_008378	CGG	2	6	343464	343469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_008378	GCGG	2	8	346476	346483	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
590	NC_008378	GAT	2	6	346518	346523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008378	TGC	2	6	346553	346558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_008378	GAC	2	6	346668	346673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_008378	AC	3	6	346747	346752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_008378	AAC	2	6	346756	346761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_008378	GCG	2	6	346812	346817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_008378	GTC	2	6	346843	346848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008378	AGA	2	6	348164	348169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008378	TGT	2	6	348185	348190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008378	GCCA	2	8	348238	348245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
600	NC_008378	AAG	2	6	352562	352567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008378	CATC	2	8	355475	355482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_008378	AAC	2	6	356460	356465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008378	CAAG	2	8	357447	357454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_008378	GAA	2	6	357483	357488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008378	GTC	2	6	359069	359074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008378	GCG	2	6	359139	359144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_008378	AGC	2	6	359157	359162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_008378	TTC	2	6	359188	359193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_008378	AGA	2	6	365817	365822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008378	TGT	2	6	365829	365834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008378	GCT	2	6	365867	365872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_008378	CG	3	6	367192	367197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_008378	GCCG	2	8	367241	367248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_008378	GCT	2	6	367279	367284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_008378	CGGAG	2	10	367313	367322	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
616	NC_008378	GC	5	10	367341	367350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_008378	GCT	2	6	367368	367373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_008378	CG	3	6	367374	367379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_008378	TCC	2	6	367916	367921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_008378	CTCTG	2	10	367961	367970	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
621	NC_008378	CGA	2	6	367991	367996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_008378	T	6	6	368045	368050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008378	TTC	2	6	368129	368134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_008378	TG	3	6	368138	368143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008378	TCA	2	6	368566	368571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_008378	TGGTG	2	10	368584	368593	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008378	GGC	2	6	368596	368601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_008378	ATGG	2	8	371251	371258	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008378	AGACG	2	10	371277	371286	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
630	NC_008378	GCTTG	2	10	371926	371935	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
631	NC_008378	TC	3	6	372768	372773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_008378	TGGC	2	8	372843	372850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
633	NC_008378	TGC	2	6	373937	373942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_008378	GTC	2	6	377046	377051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_008378	CGAC	2	8	377099	377106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
636	NC_008378	CTC	2	6	377125	377130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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638	NC_008378	TCC	2	6	379473	379478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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