MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia eutropha H16 chromosome 1

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008313	GGCGCA	2	12	457	468	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008313	CGGTGG	2	12	25724	25735	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008313	CCTTCC	2	12	93280	93291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008313	CCGGCG	2	12	167351	167362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008313	GCCCGC	2	12	167504	167515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008313	CAGGGG	2	12	199322	199333	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008313	ACCAAT	2	12	200369	200380	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008313	GTGGAT	2	12	244269	244280	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008313	ACTGGC	2	12	248048	248059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008313	GGCGCC	2	12	260974	260985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008313	ATTTCC	2	12	279078	279089	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008313	AACGTC	2	12	292794	292805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008313	CCGGTT	2	12	297764	297775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008313	CCCATT	2	12	297856	297867	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008313	TTGCCG	2	12	327897	327908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008313	CATCGC	2	12	328785	328796	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008313	TCTCCC	2	12	352073	352084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008313	TGCACT	2	12	361154	361165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008313	GCGCTG	2	12	378997	379008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008313	CGGGCG	2	12	386404	386415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008313	GCCCGC	2	12	408143	408154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008313	GCGTTC	2	12	558282	558293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008313	CCGGGG	2	12	570433	570444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008313	GCCGGC	2	12	571274	571285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008313	TCTCCC	2	12	600020	600031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008313	GCCACC	2	12	627277	627288	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008313	CAACCC	2	12	643306	643317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008313	CGAAGG	2	12	652368	652379	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008313	CAAGGA	2	12	672084	672095	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008313	CCCGCG	2	12	677558	677569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008313	GGGAGA	2	12	745994	746005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008313	GCCACG	2	12	780081	780092	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008313	CGAACG	2	12	782038	782049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008313	AAAAGG	2	12	787865	787876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008313	GCAGGG	2	12	828680	828691	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008313	TGATGC	2	12	856792	856803	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008313	ATTTTA	2	12	893497	893508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008313	GCATCG	2	12	948326	948337	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008313	TGGCGG	2	12	981310	981321	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008313	TCACCA	2	12	981325	981336	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008313	CTGCGC	2	12	989973	989984	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008313	GCTTTG	2	12	1029388	1029399	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008313	TTTCGG	2	12	1036627	1036638	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008313	CTATTG	2	12	1052415	1052426	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008313	TACAGA	2	12	1063202	1063213	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008313	CTGCGA	2	12	1142232	1142243	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008313	CCGATT	2	12	1179619	1179630	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008313	GGGGTT	2	12	1194361	1194372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008313	GTAAAA	2	12	1220042	1220053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008313	GCCGGG	2	12	1228490	1228501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008313	CGGGGC	2	12	1317169	1317180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008313	TCCCGC	2	12	1330057	1330068	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008313	GTTTTT	2	12	1331649	1331660	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008313	GCGCGA	2	12	1405531	1405542	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008313	TGCCGC	2	12	1411058	1411069	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008313	ACGAAA	2	12	1455770	1455781	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008313	GAGGTG	2	12	1484773	1484784	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008313	AGGCAG	2	12	1485663	1485674	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008313	GCGCGG	2	12	1489458	1489469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008313	TTTTGC	2	12	1539171	1539182	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008313	GCTGAC	2	12	1539260	1539271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008313	CCGCAT	2	12	1539802	1539813	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008313	GAAAAA	2	12	1553737	1553748	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008313	GGCACT	2	12	1602657	1602668	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008313	AAAATT	2	12	1659024	1659035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008313	GGCCTC	2	12	1666563	1666574	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008313	CCGGCC	2	12	1689325	1689336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008313	ACCTCA	2	12	1811492	1811503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008313	CTTCAT	2	12	1827330	1827341	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008313	CTGGCA	2	12	1838896	1838907	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008313	CGGCCT	2	12	1840935	1840946	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008313	ACGCTT	2	12	1841741	1841752	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008313	CGTTGG	2	12	1844589	1844600	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008313	ACCACA	2	12	1844628	1844639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008313	AGGCCG	2	12	1889522	1889533	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008313	CGGACA	2	12	1889637	1889648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008313	TAGCCC	2	12	1910489	1910500	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008313	TCCGGC	2	12	1915059	1915070	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008313	CGAAGA	2	12	1915614	1915625	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008313	CTTGAT	2	12	1923153	1923164	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008313	CCCGTT	2	12	1938083	1938094	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008313	TTGTGG	2	12	1941126	1941137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008313	TCCGGG	2	12	1954534	1954545	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008313	GGGTCA	2	12	1956393	1956404	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008313	ACGCGG	2	12	1957484	1957495	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008313	TGTCGT	2	12	1967488	1967499	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008313	AGCCGA	2	12	1990701	1990712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008313	CCACTC	2	12	1990979	1990990	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008313	CGCGCA	2	12	1995075	1995086	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008313	TGGGCG	2	12	2000449	2000460	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008313	CAACTA	2	12	2017798	2017809	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008313	GCGCTC	2	12	2035775	2035786	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008313	GGGCTC	2	12	2093160	2093171	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008313	AAGCCG	2	12	2127796	2127807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008313	TCGGCT	2	12	2183507	2183518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008313	CGGTGC	2	12	2183738	2183749	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008313	ATTCAA	2	12	2231147	2231158	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008313	GGGAGA	2	12	2249063	2249074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008313	CTGCGC	2	12	2294389	2294400	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008313	CACCGT	2	12	2309245	2309256	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008313	AATGTT	2	12	2326315	2326326	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008313	CAGCGC	2	12	2347589	2347600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008313	GCCGGC	2	12	2349735	2349746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008313	CATGGT	2	12	2368971	2368982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_008313	GGTGCA	2	12	2384766	2384777	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008313	TGCCAG	2	12	2405525	2405536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008313	CTTTTA	2	12	2410658	2410669	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008313	GAGTTT	2	12	2418281	2418292	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008313	GTTTGT	2	12	2453450	2453461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008313	AGATCG	2	12	2480761	2480772	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008313	GCAAAG	2	12	2488287	2488298	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008313	AACGTA	2	12	2498847	2498858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_008313	CCGGCG	2	12	2504526	2504537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008313	CCCGCC	2	12	2507840	2507851	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
115	NC_008313	CCACCG	2	12	2536207	2536218	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008313	AGCGCC	2	12	2547524	2547535	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008313	TGCGGA	2	12	2557668	2557679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_008313	CGCGCC	2	12	2559024	2559035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_008313	TGGACG	2	12	2643241	2643252	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_008313	CATCTC	2	12	2646485	2646496	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008313	TTGTCA	2	12	2721921	2721932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008313	GCCGGC	2	12	2732529	2732540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008313	GCCGGC	2	12	2813464	2813475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008313	GCGATA	2	12	2831914	2831925	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008313	GAAAAG	2	12	2832090	2832101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008313	ACTGCC	2	12	2842605	2842616	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008313	ACGGCA	2	12	2844107	2844118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008313	TGCAGT	2	12	2848393	2848404	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008313	CCGCGC	2	12	2853773	2853784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008313	GCCGGC	2	12	2857265	2857276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008313	AGCGCC	2	12	2893046	2893057	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008313	GCGGCA	2	12	2903255	2903266	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008313	GGCGCA	2	12	2928374	2928385	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008313	AAAAGC	2	12	2928441	2928452	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_008313	GGGAGC	2	12	2986077	2986088	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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137	NC_008313	GCAAAG	2	12	2998215	2998226	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_008313	AATCCC	2	12	2998692	2998703	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008313	CGGCCC	2	12	3026544	3026555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_008313	GCCCCC	2	12	3030532	3030543	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
141	NC_008313	CCATGC	2	12	3088314	3088325	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008313	CCATAT	2	12	3180523	3180534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008313	CCCGCA	2	12	3254088	3254099	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_008313	TTTTTG	2	12	3274913	3274924	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008313	CGCCGG	2	12	3290256	3290267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008313	CCGGCA	2	12	3337218	3337229	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008313	GGCTCG	2	12	3373894	3373905	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008313	GCAGCG	2	12	3384221	3384232	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008313	ATTGTT	2	12	3393381	3393392	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008313	TGACGG	2	12	3407944	3407955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_008313	CGCCAG	2	12	3408110	3408121	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008313	CCATAA	2	12	3415318	3415329	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_008313	CCCACC	2	12	3482493	3482504	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
156	NC_008313	CCCATT	2	12	3493290	3493301	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_008313	CCGCGC	2	12	3515755	3515766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_008313	GCTGCG	2	12	3551056	3551067	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_008313	GGGAAA	2	12	3557413	3557424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_008313	TGAGGT	2	12	3575345	3575356	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.