MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 1097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008271	GCGG	2	8	124505	124512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
502	NC_008271	GGT	2	6	124525	124530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008271	GTTC	2	8	124531	124538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_008271	GAT	2	6	124561	124566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008271	TGGC	2	8	124598	124605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
506	NC_008271	GCC	2	6	124625	124630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_008271	TCGC	2	8	124632	124639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
508	NC_008271	TGC	2	6	124801	124806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_008271	CCG	2	6	124817	124822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_008271	GTTC	2	8	124854	124861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
511	NC_008271	GCG	2	6	124884	124889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_008271	GCC	2	6	127129	127134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_008271	GTCG	2	8	127166	127173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
514	NC_008271	TCG	2	6	127180	127185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008271	CTA	2	6	127199	127204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008271	ACG	2	6	127212	127217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008271	CGG	2	6	128199	128204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_008271	ATG	2	6	128221	128226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008271	GGT	2	6	128259	128264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008271	TCGC	2	8	128298	128305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
521	NC_008271	ACA	2	6	128322	128327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_008271	CTCG	2	8	128416	128423	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
523	NC_008271	CGT	2	6	128479	128484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_008271	GAT	2	6	128500	128505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008271	CCG	2	6	128566	128571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_008271	CTAC	2	8	131180	131187	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_008271	CCA	2	6	131782	131787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_008271	GTG	2	6	131802	131807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008271	G	6	6	131819	131824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008271	TGC	2	6	131833	131838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_008271	GTT	2	6	131918	131923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008271	ACG	2	6	134374	134379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_008271	GAA	2	6	134413	134418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008271	TAGG	2	8	134426	134433	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008271	GTG	2	6	135059	135064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008271	AGGTG	2	10	135070	135079	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008271	CGA	2	6	135083	135088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_008271	CTG	2	6	135171	135176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_008271	ACC	2	6	138153	138158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_008271	CTCCA	2	10	139366	139375	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
541	NC_008271	TCGA	2	8	139376	139383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_008271	CA	3	6	139430	139435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_008271	CGC	2	6	139924	139929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_008271	CA	3	6	139933	139938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_008271	CGATC	2	10	139948	139957	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
546	NC_008271	CTCGG	2	10	140011	140020	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
547	NC_008271	GGA	2	6	140075	140080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008271	ACA	2	6	140092	140097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_008271	AGG	2	6	140499	140504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008271	CTTC	2	8	140574	140581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_008271	TGG	2	6	140618	140623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008271	TGA	2	6	140655	140660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008271	GGC	2	6	140690	140695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_008271	CTGG	2	8	140717	140724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_008271	TGG	2	6	140739	140744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008271	CG	3	6	140772	140777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_008271	CCG	2	6	140778	140783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_008271	GCC	2	6	141833	141838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_008271	CTC	2	6	141862	141867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_008271	GGT	2	6	141878	141883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008271	TCG	2	6	142939	142944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_008271	TCG	2	6	143090	143095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008271	AGT	2	6	143834	143839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008271	TGAC	2	8	144338	144345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_008271	AC	3	6	144366	144371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_008271	CGA	2	6	150466	150471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008271	TAG	2	6	150621	150626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008271	GCC	2	6	152180	152185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_008271	CCGCT	2	10	152229	152238	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
570	NC_008271	GAG	2	6	152266	152271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008271	CGA	2	6	152288	152293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_008271	CCA	2	6	152301	152306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_008271	CGG	2	6	152377	152382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_008271	ACCTG	2	10	152409	152418	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
575	NC_008271	GAT	2	6	152445	152450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008271	GT	3	6	153614	153619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008271	GTCCAG	2	12	153658	153669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_008271	TCT	2	6	153688	153693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008271	TCC	2	6	153696	153701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_008271	CAC	2	6	153720	153725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_008271	CAC	2	6	153733	153738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_008271	GC	3	6	153800	153805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_008271	GAC	2	6	153849	153854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_008271	CTC	2	6	155803	155808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_008271	CGT	2	6	155810	155815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008271	CTC	2	6	157030	157035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_008271	TC	3	6	157062	157067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_008271	GCA	2	6	157096	157101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_008271	CGG	2	6	157143	157148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_008271	TCGA	2	8	157221	157228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
591	NC_008271	CAC	2	6	158213	158218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_008271	GCA	2	6	158311	158316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_008271	ACGC	2	8	158317	158324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
594	NC_008271	TGC	2	6	158327	158332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_008271	GCC	2	6	159261	159266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_008271	CTT	2	6	160246	160251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008271	TCCC	2	8	161419	161426	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
598	NC_008271	CGCA	2	8	161455	161462	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_008271	GGC	2	6	161465	161470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_008271	ACG	2	6	161501	161506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_008271	GAG	2	6	162537	162542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008271	CAT	2	6	164245	164250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008271	GCC	2	6	164278	164283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_008271	CTCGC	2	10	164311	164320	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
605	NC_008271	CCG	2	6	164363	164368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_008271	TC	3	6	164377	164382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_008271	CG	3	6	164390	164395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_008271	GAA	2	6	164403	164408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008271	TCGA	2	8	164428	164435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_008271	CGC	2	6	164539	164544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_008271	TCG	2	6	164584	164589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_008271	TCG	2	6	164599	164604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_008271	CGATT	2	10	164637	164646	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
614	NC_008271	CAC	2	6	164658	164663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_008271	CTC	2	6	167382	167387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_008271	TGC	2	6	167418	167423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_008271	ACG	2	6	167448	167453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_008271	CT	3	6	168623	168628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_008271	GAA	2	6	168650	168655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008271	CGTG	2	8	168660	168667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_008271	GTTC	2	8	170377	170384	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
622	NC_008271	CA	4	8	170409	170416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_008271	CTT	2	6	172393	172398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_008271	CGAA	2	8	172400	172407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_008271	CGA	2	6	172420	172425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_008271	GA	3	6	172566	172571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008271	GCC	2	6	172588	172593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_008271	TG	3	6	172637	172642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008271	ATC	2	6	172755	172760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_008271	GC	3	6	172762	172767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_008271	CAT	2	6	172865	172870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_008271	TCGT	2	8	173012	173019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_008271	CGGG	2	8	173035	173042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
634	NC_008271	CTG	2	6	173075	173080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_008271	CGAT	2	8	175737	175744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_008271	CGG	2	6	175762	175767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_008271	GTC	2	6	175768	175773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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774	NC_008271	CCG	2	6	230096	230101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
775	NC_008271	GCG	2	6	230111	230116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
776	NC_008271	CCG	2	6	230129	230134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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778	NC_008271	GCC	2	6	232158	232163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
779	NC_008271	GCG	2	6	232285	232290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
780	NC_008271	GAG	2	6	232323	232328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
781	NC_008271	GAG	2	6	232355	232360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
782	NC_008271	AGG	2	6	232441	232446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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784	NC_008271	GAC	2	6	232487	232492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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792	NC_008271	CGA	2	6	233273	233278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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795	NC_008271	CCG	2	6	233362	233367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
796	NC_008271	CCG	2	6	233372	233377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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799	NC_008271	CCG	2	6	233436	233441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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801	NC_008271	C	7	7	234161	234167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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803	NC_008271	CG	3	6	236826	236831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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805	NC_008271	TCC	2	6	237168	237173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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807	NC_008271	GCC	3	9	238742	238750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
808	NC_008271	CAC	2	6	238751	238756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
809	NC_008271	CGGG	2	8	240190	240197	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
810	NC_008271	CAG	2	6	240232	240237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
811	NC_008271	GAC	2	6	240255	240260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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847	NC_008271	GCG	2	6	246698	246703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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908	NC_008271	CTG	2	6	259598	259603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1000	NC_008271	TCCG	2	8	311559	311566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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