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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008269	TCGA	2	8	107	114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008269	ACCC	2	8	927	934	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_008269	CAAA	2	8	2780	2787	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008269	ATAC	2	8	2912	2919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008269	TTGG	2	8	2957	2964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008269	GATC	2	8	6319	6326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008269	CTTC	2	8	8131	8138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008269	GCCC	2	8	9516	9523	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_008269	CGGG	2	8	9559	9566	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008269	GGCC	2	8	10302	10309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008269	GGTC	2	8	10666	10673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008269	CGCT	2	8	11364	11371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008269	CTGC	2	8	11464	11471	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008269	GATG	2	8	14348	14355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008269	CGAA	2	8	15205	15212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008269	CTGT	2	8	15263	15270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008269	TTTG	2	8	15392	15399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008269	CTAC	2	8	18854	18861	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008269	CCGG	2	8	21274	21281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008269	CGGC	2	8	24592	24599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008269	ATCA	2	8	25018	25025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008269	CAAC	2	8	26408	26415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008269	CCCA	2	8	26443	26450	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_008269	ATCT	2	8	26475	26482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008269	CAGC	2	8	28697	28704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008269	AAAG	2	8	34104	34111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008269	CCGG	2	8	35660	35667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008269	AGTC	2	8	38797	38804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008269	CAGC	2	8	38926	38933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008269	CCGC	2	8	39260	39267	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_008269	TGGT	2	8	40596	40603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008269	CCGA	2	8	41538	41545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008269	GTCG	2	8	42420	42427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008269	GCCA	2	8	42879	42886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008269	GATT	2	8	42957	42964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008269	GTGC	2	8	44006	44013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008269	TTTG	2	8	63504	63511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008269	CCGC	2	8	63524	63531	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_008269	ACCC	2	8	66072	66079	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_008269	CCTT	2	8	67368	67375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008269	CCGG	2	8	67397	67404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008269	GGAG	2	8	70756	70763	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008269	CCGA	2	8	74513	74520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008269	CAGG	2	8	74603	74610	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008269	CGAC	2	8	76888	76895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008269	CAGC	2	8	81200	81207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008269	CCGC	2	8	81665	81672	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_008269	AGTC	2	8	81886	81893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008269	TTCC	2	8	81914	81921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008269	TTCG	2	8	86088	86095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008269	CTCA	2	8	87709	87716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008269	GCGG	2	8	90650	90657	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008269	CGCC	2	8	95583	95590	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_008269	GAGG	2	8	95614	95621	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008269	ACGG	2	8	95638	95645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008269	GAGC	2	8	95661	95668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008269	CCAG	2	8	96815	96822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008269	CCGC	2	8	97008	97015	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_008269	GTGG	2	8	98188	98195	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008269	AGGA	2	8	99358	99365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008269	CGGT	2	8	105179	105186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008269	CCTG	2	8	105232	105239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008269	CCCG	2	8	105454	105461	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_008269	GATC	2	8	109296	109303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008269	GCTA	2	8	109483	109490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008269	ACGC	2	8	109628	109635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008269	GGTG	2	8	109893	109900	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008269	TCCT	2	8	110207	110214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008269	CGCT	2	8	110490	110497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008269	AGCA	2	8	111079	111086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008269	GTGC	2	8	112106	112113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008269	TGGG	2	8	112127	112134	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008269	GCGG	2	8	113648	113655	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008269	CCGA	2	8	121655	121662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008269	GCGA	2	8	121814	121821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008269	CGGT	2	8	123290	123297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008269	CCAC	2	8	131924	131931	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_008269	CCCG	2	8	135688	135695	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_008269	GGTC	2	8	136967	136974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008269	CGTT	2	8	137111	137118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008269	GCAC	2	8	137216	137223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008269	GAGG	2	8	137248	137255	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008269	CGGC	2	8	137409	137416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008269	ACCG	2	8	137551	137558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008269	CCTG	2	8	138082	138089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008269	GGTC	2	8	138130	138137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008269	GTGC	2	8	143892	143899	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008269	CGGT	2	8	147145	147152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008269	TCGA	2	8	164520	164527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008269	TGCG	2	8	166247	166254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008269	GACA	2	8	170205	170212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008269	TGGG	2	8	170326	170333	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008269	CGAG	2	8	171186	171193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008269	CCGG	2	8	176441	176448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008269	AGCC	2	8	178778	178785	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008269	ACCG	2	8	178815	178822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008269	CAGC	2	8	183013	183020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008269	CGGT	2	8	184467	184474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008269	CATC	2	8	188426	188433	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008269	GGCG	2	8	195541	195548	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008269	ACGC	2	8	196905	196912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008269	GCAC	2	8	197751	197758	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008269	ACAG	2	8	197832	197839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008269	ATGC	2	8	198033	198040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008269	CCGA	2	8	199935	199942	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008269	GGTC	2	8	205889	205896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008269	ACCC	2	8	207664	207671	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_008269	GGAT	2	8	207724	207731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008269	CCGG	2	8	209043	209050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008269	CTCC	2	8	209077	209084	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_008269	TTAT	2	8	216231	216238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008269	AGCA	2	8	216933	216940	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008269	CGCT	2	8	218148	218155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008269	ATCG	2	8	221013	221020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008269	CGAC	2	8	223666	223673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008269	CGCC	2	8	224118	224125	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_008269	GTAT	2	8	225522	225529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008269	GCCC	2	8	226666	226673	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_008269	CGCC	2	8	227511	227518	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_008269	GCCG	2	8	231041	231048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008269	CGGT	2	8	232527	232534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008269	GCGG	2	8	233594	233601	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008269	AACC	2	8	234754	234761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008269	GTCG	2	8	236713	236720	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008269	GCCC	2	8	237126	237133	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_008269	TGCG	2	8	237849	237856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008269	ACCT	2	8	239076	239083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008269	GCAG	2	8	240386	240393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008269	CTGG	2	8	241335	241342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008269	CTGA	2	8	241820	241827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008269	CACG	2	8	242875	242882	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008269	AGGA	2	8	243163	243170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008269	ACCC	2	8	244019	244026	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_008269	GCCG	2	8	244120	244127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008269	GGGC	2	8	244240	244247	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008269	GGTC	2	8	244672	244679	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008269	ACCC	2	8	247928	247935	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_008269	TCAC	2	8	248693	248700	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008269	CAAG	2	8	250482	250489	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008269	GAAA	2	8	250531	250538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008269	ACGC	2	8	253369	253376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008269	GTCG	2	8	256931	256938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008269	GCCG	2	8	257291	257298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008269	GTCG	2	8	258734	258741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008269	TCCC	2	8	263988	263995	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_008269	CACC	2	8	264014	264021	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_008269	CCGA	2	8	264044	264051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008269	CCGT	2	8	265532	265539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008269	TCGA	2	8	267708	267715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008269	CCCG	2	8	269106	269113	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_008269	CCAC	2	8	269141	269148	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
152	NC_008269	GGAA	2	8	269158	269165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_008269	GAAA	2	8	275655	275662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_008269	CCCG	2	8	321122	321129	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
172	NC_008269	TCGA	2	8	324054	324061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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297	NC_008269	TGTA	2	8	516418	516425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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