MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 4335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008269	TCG	2	6	894765	894770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_008269	CGA	2	6	894771	894776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_008269	AATG	2	8	894812	894819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_008269	CGA	2	6	894823	894828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_008269	GCC	2	6	894829	894834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_008269	AAG	3	9	894839	894847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_008269	TCG	2	6	894872	894877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_008269	CAG	2	6	894931	894936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_008269	CGC	2	6	894940	894945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_008269	GTGC	2	8	895495	895502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_008269	CGA	2	6	895528	895533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_008269	CTGC	2	8	895570	895577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_008269	TC	3	6	895611	895616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_008269	GTG	2	6	895660	895665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_008269	GGT	2	6	895738	895743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_008269	CGT	2	6	896158	896163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_008269	AGA	2	6	896170	896175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_008269	TCC	2	6	896277	896282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_008269	GCG	3	9	896298	896306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_008269	CGC	2	6	896385	896390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_008269	GGC	2	6	896408	896413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_008269	CGC	2	6	896417	896422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_008269	ATCCG	2	10	896523	896532	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3524	NC_008269	TCC	2	6	896574	896579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_008269	CGA	2	6	896643	896648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_008269	GT	3	6	897913	897918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_008269	AAG	2	6	897941	897946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_008269	TCG	2	6	898011	898016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_008269	ACC	2	6	898030	898035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_008269	ACA	2	6	898037	898042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_008269	ACA	2	6	898189	898194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_008269	CGA	2	6	898253	898258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_008269	GGGGT	2	10	898267	898276	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_008269	CAG	2	6	898293	898298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_008269	CAC	2	6	898313	898318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_008269	CCA	2	6	898358	898363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_008269	GTT	2	6	898404	898409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_008269	CGGC	2	8	898516	898523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_008269	GT	3	6	898646	898651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_008269	GTG	2	6	898676	898681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_008269	GCT	2	6	898737	898742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_008269	TGGG	2	8	898776	898783	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_008269	CTTT	2	8	898836	898843	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_008269	CAG	2	6	898878	898883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_008269	CGA	2	6	898939	898944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_008269	CCG	2	6	898996	899001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_008269	CAC	2	6	899008	899013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_008269	CAG	2	6	899028	899033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_008269	GGA	2	6	899190	899195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_008269	CGA	2	6	899199	899204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_008269	TTGG	2	8	899244	899251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_008269	GAG	2	6	899303	899308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_008269	TCC	2	6	899585	899590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_008269	CGG	2	6	899629	899634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_008269	CTC	2	6	899697	899702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_008269	G	6	6	901696	901701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_008269	GTCG	2	8	901708	901715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_008269	CGT	2	6	902839	902844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_008269	TCG	2	6	902877	902882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_008269	AAG	2	6	903393	903398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_008269	GATC	2	8	903415	903422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3562	NC_008269	GGA	2	6	903446	903451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_008269	TGGT	2	8	904318	904325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_008269	GGCT	2	8	904393	904400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3565	NC_008269	TGC	2	6	904457	904462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_008269	CTC	2	6	904487	904492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_008269	GC	3	6	904577	904582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_008269	GAA	2	6	904604	904609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_008269	GAT	2	6	905916	905921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_008269	GAG	2	6	905989	905994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_008269	GCGA	2	8	905995	906002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3572	NC_008269	CGC	2	6	906764	906769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_008269	TCG	2	6	906899	906904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_008269	ACT	2	6	906941	906946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_008269	GA	3	6	906947	906952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_008269	TCG	2	6	907082	907087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_008269	TG	3	6	907273	907278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_008269	GCTA	2	8	907281	907288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_008269	AGC	2	6	907326	907331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_008269	TGG	2	6	907335	907340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_008269	TCGC	2	8	907373	907380	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_008269	CAA	2	6	907419	907424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_008269	GAA	2	6	907712	907717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_008269	TTCA	2	8	907744	907751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3585	NC_008269	CAG	2	6	908419	908424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_008269	GTAC	2	8	908455	908462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_008269	CGA	2	6	908592	908597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_008269	CGGC	2	8	910399	910406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_008269	ACT	2	6	910444	910449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_008269	CGA	2	6	910474	910479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_008269	AAC	2	6	910494	910499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_008269	CGCC	2	8	910534	910541	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3593	NC_008269	GAG	2	6	910551	910556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_008269	GCTC	2	8	910566	910573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_008269	GCG	2	6	910645	910650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_008269	CGG	3	9	910675	910683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_008269	TGC	2	6	911600	911605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_008269	GTC	2	6	911629	911634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_008269	GGC	2	6	911643	911648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_008269	CGG	2	6	911788	911793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_008269	TCT	2	6	911812	911817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_008269	CGT	2	6	911852	911857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_008269	GC	3	6	911885	911890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_008269	CGAC	2	8	911990	911997	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_008269	TGGG	2	8	912004	912011	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_008269	TGC	2	6	912022	912027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_008269	GCTT	2	8	912039	912046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_008269	GTA	2	6	913636	913641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_008269	TC	3	6	913702	913707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_008269	GAT	2	6	913748	913753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_008269	TGT	2	6	914074	914079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_008269	TGC	2	6	914087	914092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_008269	ACC	2	6	914834	914839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_008269	TCG	2	6	914868	914873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_008269	ATC	2	6	914959	914964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_008269	GGC	2	6	915317	915322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_008269	GGC	2	6	915324	915329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_008269	G	6	6	915354	915359	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_008269	GGCC	2	8	915760	915767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_008269	CGG	2	6	915952	915957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_008269	AAC	2	6	915966	915971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_008269	CCG	2	6	915973	915978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_008269	GT	3	6	915982	915987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_008269	CCG	2	6	915999	916004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_008269	ACG	2	6	917042	917047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3627	NC_008269	GAA	2	6	917660	917665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_008269	GAGC	2	8	917715	917722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_008269	GGA	2	6	917730	917735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_008269	TGG	2	6	917743	917748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_008269	TGGC	2	8	917750	917757	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3632	NC_008269	TC	3	6	917846	917851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3634	NC_008269	CGT	2	6	917890	917895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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