MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 4335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008269	GGCA	2	8	761803	761810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_008269	CGC	2	6	761824	761829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_008269	GGCG	2	8	766264	766271	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_008269	AGC	2	6	766288	766293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_008269	GAGG	2	8	766308	766315	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_008269	AGA	2	6	766318	766323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_008269	TCT	2	6	766361	766366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_008269	GC	3	6	766387	766392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_008269	CGCGT	2	10	766432	766441	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3010	NC_008269	G	6	6	766539	766544	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_008269	GAG	2	6	767467	767472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008269	GGTC	2	8	767491	767498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_008269	CAA	2	6	767573	767578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_008269	GAG	2	6	767594	767599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008269	ACGG	2	8	767607	767614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_008269	GCGTT	2	10	767667	767676	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3017	NC_008269	GAT	2	6	767680	767685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008269	TGG	2	6	767696	767701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_008269	CTG	2	6	767743	767748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_008269	TTG	2	6	767772	767777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008269	GCG	2	6	767856	767861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_008269	CACC	2	8	769326	769333	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3023	NC_008269	ACT	2	6	770118	770123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_008269	CAG	2	6	772264	772269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_008269	CGAC	2	8	772311	772318	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_008269	GGGCGC	2	12	772355	772366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_008269	GCT	2	6	772439	772444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_008269	CT	3	6	775278	775283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_008269	GT	3	6	775381	775386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008269	CGG	2	6	775414	775419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_008269	ACC	2	6	776299	776304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_008269	CCGG	2	8	776356	776363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_008269	TCGG	2	8	776370	776377	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_008269	TGT	2	6	776429	776434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_008269	GTT	2	6	776460	776465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_008269	CGGC	2	8	776524	776531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_008269	TCC	2	6	776606	776611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_008269	GCG	2	6	776612	776617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_008269	GCCC	2	8	776628	776635	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3040	NC_008269	TCG	2	6	777452	777457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_008269	ACTC	2	8	777464	777471	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_008269	CGA	2	6	777482	777487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_008269	GAC	2	6	777503	777508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_008269	GCA	2	6	778808	778813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_008269	GCCAA	2	10	778836	778845	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3046	NC_008269	CAG	2	6	778893	778898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_008269	ACG	2	6	778931	778936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_008269	TCC	2	6	779237	779242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_008269	GCC	2	6	780169	780174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_008269	CAA	2	6	780212	780217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_008269	GT	3	6	780295	780300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_008269	CAA	2	6	780309	780314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_008269	GAG	2	6	780351	780356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008269	GCGGTG	2	12	780410	780421	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3055	NC_008269	GTGC	2	8	780462	780469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_008269	GTG	2	6	780508	780513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_008269	GTT	2	6	780514	780519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008269	GC	3	6	781059	781064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_008269	GCG	2	6	781143	781148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_008269	CGG	2	6	781153	781158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_008269	CGC	2	6	781160	781165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_008269	CGA	2	6	781174	781179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_008269	CG	3	6	781255	781260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_008269	CGC	2	6	781268	781273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_008269	GAA	2	6	781373	781378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_008269	CCG	2	6	782431	782436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_008269	CGC	2	6	782454	782459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_008269	TCA	2	6	782488	782493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_008269	CGA	2	6	782529	782534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_008269	CGA	2	6	782536	782541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_008269	GTC	2	6	782546	782551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_008269	GAG	2	6	782568	782573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_008269	CTGA	2	8	782574	782581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_008269	GGA	2	6	782594	782599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_008269	CGT	2	6	782620	782625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_008269	GCG	2	6	782665	782670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_008269	ATCG	2	8	782676	782683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3078	NC_008269	TC	3	6	782724	782729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_008269	CGAA	2	8	782767	782774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3080	NC_008269	ACG	2	6	782807	782812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_008269	AAG	2	6	782864	782869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_008269	GCC	2	6	782945	782950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_008269	GTT	2	6	782975	782980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_008269	GCG	2	6	782992	782997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_008269	GGA	2	6	784481	784486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_008269	TGA	2	6	784514	784519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_008269	CCA	2	6	784864	784869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_008269	CCA	2	6	784871	784876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_008269	GGT	2	6	784893	784898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_008269	GGA	2	6	784903	784908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_008269	GCG	2	6	785263	785268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_008269	ACG	2	6	785296	785301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_008269	GGC	2	6	785339	785344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_008269	CCG	2	6	785374	785379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_008269	CGG	2	6	785392	785397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_008269	CGC	2	6	785444	785449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_008269	ATG	2	6	786697	786702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_008269	CGT	2	6	786708	786713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_008269	AGG	2	6	786773	786778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_008269	AG	3	6	786793	786798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008269	AGG	2	6	787286	787291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_008269	CGGCT	2	10	790678	790687	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3103	NC_008269	GGC	2	6	790729	790734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_008269	AGGC	2	8	790739	790746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_008269	CAG	2	6	790764	790769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_008269	CTG	2	6	790837	790842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_008269	GCTG	2	8	790851	790858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_008269	TC	3	6	790886	790891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_008269	CCGA	2	8	797729	797736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_008269	TGG	2	6	797779	797784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_008269	GAA	2	6	797811	797816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_008269	TTGCT	2	10	797843	797852	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3113	NC_008269	ACC	2	6	797862	797867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_008269	GGA	2	6	797868	797873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_008269	TGC	2	6	797895	797900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_008269	CG	3	6	797943	797948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_008269	TGC	3	9	797950	797958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_008269	GTC	2	6	797995	798000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_008269	AGGA	2	8	798059	798066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_008269	TG	3	6	798085	798090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008269	TCG	2	6	798094	798099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_008269	TGG	2	6	798117	798122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_008269	GTCG	2	8	798123	798130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3124	NC_008269	CCG	2	6	798166	798171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_008269	TGA	2	6	800620	800625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_008269	CGG	2	6	800772	800777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_008269	GGT	2	6	800969	800974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_008269	CA	3	6	801020	801025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_008269	CGATGT	2	12	801073	801084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3130	NC_008269	GCAA	2	8	801102	801109	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_008269	GGTC	2	8	801110	801117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3132	NC_008269	ACG	2	6	801177	801182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_008269	AC	3	6	801184	801189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3134	NC_008269	CGAAC	2	10	801205	801214	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3135	NC_008269	TCG	2	6	801228	801233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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