MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 4335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008269	GGA	2	6	619783	619788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_008269	GTCG	2	8	619819	619826	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_008269	CGG	2	6	619857	619862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_008269	CGG	2	6	619898	619903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_008269	GAG	2	6	620241	620246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_008269	GAG	3	9	620277	620285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_008269	TC	3	6	620328	620333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2508	NC_008269	TCT	2	6	620343	620348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_008269	TTG	2	6	620380	620385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_008269	GAA	2	6	620428	620433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_008269	TCCA	2	8	620603	620610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_008269	AAC	2	6	620631	620636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_008269	TCT	2	6	620642	620647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_008269	GCAT	2	8	621107	621114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_008269	CGGA	2	8	621129	621136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2516	NC_008269	CGG	2	6	621168	621173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_008269	GGC	2	6	621547	621552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_008269	GCC	3	9	621560	621568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_008269	GACC	2	8	621578	621585	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2520	NC_008269	CAA	2	6	621589	621594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_008269	GTGC	2	8	621597	621604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2522	NC_008269	GTGGG	2	10	621702	621711	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_008269	GCG	2	6	621712	621717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_008269	GAG	2	6	621718	621723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_008269	GCG	2	6	621734	621739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_008269	GCC	2	6	621742	621747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2527	NC_008269	AGC	3	9	621749	621757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_008269	TTCC	2	8	621788	621795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2529	NC_008269	GGT	2	6	621822	621827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_008269	GGT	2	6	621921	621926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_008269	CTTC	2	8	621960	621967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2532	NC_008269	GCC	2	6	622012	622017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2533	NC_008269	GTG	2	6	622047	622052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_008269	CACTGC	2	12	623512	623523	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_008269	CG	3	6	623641	623646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2536	NC_008269	GT	3	6	623717	623722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_008269	GGT	2	6	623743	623748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_008269	ATC	2	6	623771	623776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_008269	CG	3	6	623792	623797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_008269	GTT	2	6	623809	623814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_008269	GAA	2	6	623883	623888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_008269	GAG	2	6	623953	623958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_008269	CAGGG	2	10	623984	623993	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2544	NC_008269	ATC	2	6	629216	629221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_008269	GCC	2	6	629480	629485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2546	NC_008269	GAG	2	6	629486	629491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_008269	ACGA	2	8	629509	629516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2548	NC_008269	TCG	2	6	629533	629538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_008269	CAG	2	6	629602	629607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_008269	GC	3	6	637005	637010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2551	NC_008269	CCGG	2	8	637031	637038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2552	NC_008269	CGG	2	6	637046	637051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_008269	CAC	3	9	637058	637066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_008269	AAC	2	6	637083	637088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_008269	GGC	2	6	639669	639674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_008269	GAT	2	6	639678	639683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_008269	CGG	2	6	641668	641673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_008269	CGC	2	6	642332	642337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_008269	GTC	2	6	642368	642373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_008269	GGC	2	6	642389	642394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_008269	GGCC	2	8	642436	642443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2562	NC_008269	CG	3	6	642616	642621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2563	NC_008269	CGG	2	6	642634	642639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_008269	AC	3	6	645764	645769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2565	NC_008269	CAC	2	6	646762	646767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2566	NC_008269	GCG	2	6	646771	646776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_008269	GTA	2	6	646859	646864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_008269	TGG	2	6	646873	646878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_008269	CCG	2	6	646895	646900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_008269	GGT	2	6	647372	647377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_008269	CGG	2	6	647381	647386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_008269	GCT	2	6	647388	647393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_008269	ACC	2	6	650474	650479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2575	NC_008269	CGG	2	6	650538	650543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_008269	CT	3	6	650548	650553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2577	NC_008269	TCG	2	6	650583	650588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_008269	CGG	2	6	650617	650622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_008269	CGC	2	6	650625	650630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2580	NC_008269	AGT	2	6	650698	650703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_008269	GGC	2	6	650867	650872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_008269	GCG	2	6	654027	654032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_008269	GGA	2	6	654046	654051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_008269	GAG	2	6	655505	655510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2587	NC_008269	CGG	2	6	655539	655544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_008269	ACC	2	6	655564	655569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2589	NC_008269	CCA	2	6	655571	655576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_008269	GAC	2	6	655926	655931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2592	NC_008269	CGGT	2	8	656072	656079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2593	NC_008269	CT	3	6	657574	657579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2594	NC_008269	CTG	2	6	657619	657624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2598	NC_008269	TAC	2	6	658384	658389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_008269	ACT	2	6	658420	658425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_008269	GGA	2	6	658488	658493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_008269	GCC	2	6	661085	661090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2602	NC_008269	CGGG	2	8	661113	661120	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2603	NC_008269	GC	3	6	661195	661200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2604	NC_008269	CGG	2	6	661212	661217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_008269	GCT	2	6	661251	661256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_008269	GTG	2	6	661363	661368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_008269	C	6	6	661369	661374	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2608	NC_008269	CCT	2	6	662023	662028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2609	NC_008269	GGT	2	6	662062	662067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_008269	TCC	2	6	662687	662692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2611	NC_008269	CAA	2	6	672305	672310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_008269	CG	3	6	672345	672350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_008269	TCA	2	6	672457	672462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_008269	ATC	2	6	672675	672680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_008269	GCA	2	6	674363	674368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_008269	CGC	3	9	674382	674390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2617	NC_008269	ACC	2	6	674401	674406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_008269	CGC	2	6	674412	674417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2619	NC_008269	ACCC	2	8	674418	674425	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2620	NC_008269	CA	3	6	676184	676189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2621	NC_008269	GAA	2	6	676205	676210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_008269	CGGCG	2	10	678951	678960	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2623	NC_008269	CG	3	6	678965	678970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2624	NC_008269	CCGGAA	2	12	678982	678993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_008269	CAC	2	6	680045	680050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2626	NC_008269	GCG	2	6	680061	680066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_008269	GCAG	2	8	680075	680082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2628	NC_008269	CGA	2	6	680225	680230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_008269	ACC	2	6	680342	680347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2630	NC_008269	ACGCG	2	10	680428	680437	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2631	NC_008269	TGT	2	6	680458	680463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_008269	ATG	2	6	685451	685456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_008269	ACC	2	6	685841	685846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2635	NC_008269	CCG	2	6	685858	685863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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