MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 4335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008269	ACG	2	6	365132	365137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_008269	CGT	2	6	365238	365243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_008269	GCG	2	6	365248	365253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_008269	ACG	3	9	365257	365265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_008269	GTG	2	6	365317	365322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008269	TCGC	2	8	365344	365351	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_008269	CCG	2	6	365360	365365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_008269	TCG	2	6	365383	365388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_008269	CAA	2	6	365405	365410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_008269	CTC	2	6	365415	365420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_008269	GGAT	2	8	365491	365498	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_008269	CAG	2	6	365502	365507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_008269	GC	3	6	365603	365608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_008269	TGC	2	6	365645	365650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_008269	CAG	2	6	365945	365950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_008269	CCT	2	6	367872	367877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_008269	GAGT	2	8	367878	367885	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_008269	TCT	2	6	367922	367927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_008269	GTG	2	6	368066	368071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008269	CG	3	6	368089	368094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_008269	GGTT	2	8	368113	368120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_008269	CAC	2	6	368225	368230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_008269	TCG	2	6	368237	368242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_008269	G	7	7	368256	368262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008269	GCAG	2	8	369392	369399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_008269	G	7	7	369474	369480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008269	CTG	2	6	369494	369499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_008269	CCCG	2	8	369501	369508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1529	NC_008269	GCC	2	6	369999	370004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_008269	GCA	2	6	370802	370807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_008269	AG	3	6	370811	370816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008269	CTC	2	6	370861	370866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_008269	CAG	2	6	370879	370884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_008269	ACC	2	6	370915	370920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_008269	TGG	2	6	370981	370986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_008269	CGA	2	6	371001	371006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_008269	CGC	2	6	371007	371012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_008269	GCT	2	6	371035	371040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_008269	GC	3	6	371111	371116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_008269	GGGC	2	8	371117	371124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_008269	CCG	2	6	371129	371134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_008269	CGA	2	6	371164	371169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_008269	CCG	2	6	371178	371183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_008269	CGG	2	6	371196	371201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_008269	CGT	3	9	371205	371213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_008269	CAG	2	6	371894	371899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_008269	GCA	2	6	371906	371911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_008269	ACG	2	6	371944	371949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_008269	CAT	2	6	371998	372003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_008269	CAG	2	6	372004	372009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_008269	CGG	2	6	372012	372017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_008269	GTC	2	6	372109	372114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_008269	CCGG	2	8	373429	373436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_008269	AGG	2	6	373482	373487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_008269	TCCG	2	8	373861	373868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_008269	CAC	2	6	373901	373906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_008269	CTCA	2	8	373981	373988	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_008269	GCC	2	6	373993	373998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_008269	CCG	3	9	374010	374018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_008269	GC	3	6	374055	374060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_008269	CG	3	6	374113	374118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_008269	TCG	2	6	374152	374157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_008269	CGT	2	6	374162	374167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_008269	GTCC	2	8	374178	374185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_008269	CGG	3	9	374189	374197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_008269	CTC	2	6	374238	374243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_008269	TCG	2	6	374248	374253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_008269	ACC	2	6	374254	374259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_008269	GCC	2	6	374284	374289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_008269	TCG	2	6	374290	374295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_008269	TCC	2	6	374296	374301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_008269	TCC	2	6	374320	374325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_008269	GGT	2	6	374330	374335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_008269	ACCG	2	8	374424	374431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_008269	ACC	2	6	374468	374473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_008269	ATC	2	6	374490	374495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_008269	ACCTC	2	10	374575	374584	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1578	NC_008269	GAC	2	6	374585	374590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_008269	CGA	2	6	374618	374623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_008269	AGA	3	9	374624	374632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008269	GCA	2	6	374669	374674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_008269	CTC	2	6	374675	374680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_008269	CCG	2	6	374737	374742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_008269	CCG	2	6	374750	374755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_008269	CGGCA	2	10	374776	374785	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1586	NC_008269	C	6	6	374787	374792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1587	NC_008269	CGT	2	6	374801	374806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_008269	CGA	2	6	374837	374842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_008269	TCA	2	6	375339	375344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_008269	CCG	2	6	375380	375385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_008269	GCG	2	6	375451	375456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_008269	CCGGTC	2	12	375496	375507	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_008269	GGT	2	6	375519	375524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_008269	CGG	2	6	375585	375590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_008269	GCC	2	6	375905	375910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_008269	CAT	2	6	375966	375971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_008269	GGGC	2	8	377056	377063	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1598	NC_008269	AAGT	2	8	377072	377079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_008269	GAG	2	6	377087	377092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_008269	TGA	2	6	378244	378249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_008269	CGG	2	6	378279	378284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_008269	AGG	2	6	378324	378329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_008269	GCGG	2	8	378357	378364	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_008269	TGC	2	6	378429	378434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_008269	GCG	2	6	378437	378442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_008269	CTG	2	6	380347	380352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_008269	CG	3	6	380399	380404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_008269	GCA	2	6	380413	380418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_008269	GCG	2	6	380425	380430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_008269	GC	3	6	380453	380458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_008269	AGG	2	6	380466	380471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008269	TCGT	2	8	380479	380486	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_008269	CGG	2	6	380520	380525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_008269	GGTG	2	8	380610	380617	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_008269	ACG	2	6	380660	380665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_008269	CGG	2	6	380690	380695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_008269	TGCGA	2	10	380761	380770	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1618	NC_008269	GTG	2	6	380832	380837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_008269	CGG	2	6	380910	380915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_008269	GCG	2	6	380945	380950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_008269	CGG	2	6	380976	380981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_008269	TGGGGT	2	12	381076	381087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_008269	CCCG	2	8	381090	381097	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1624	NC_008269	GAC	2	6	381100	381105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_008269	TCC	2	6	381119	381124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_008269	CTGC	2	8	381150	381157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_008269	TTC	2	6	381286	381291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_008269	GGT	2	6	381298	381303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_008269	GTC	2	6	381310	381315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_008269	GCT	2	6	381329	381334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_008269	GGC	2	6	381367	381372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_008269	CGG	2	6	382968	382973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_008269	GAG	2	6	383035	383040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_008269	GT	3	6	386233	386238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_008269	GCG	2	6	386314	386319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_008269	CCGA	2	8	386374	386381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1637	NC_008269	ACAG	2	8	386408	386415	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1638	NC_008269	TCG	2	6	386461	386466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1643	NC_008269	CGA	2	6	386731	386736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1657	NC_008269	GCG	2	6	388778	388783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1661	NC_008269	ACGA	2	8	388891	388898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1666	NC_008269	CAG	2	6	389407	389412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1759	NC_008269	CGA	2	6	403081	403086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1762	NC_008269	CAC	2	6	403155	403160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1763	NC_008269	TCCG	2	8	403169	403176	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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