MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 4335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008269	ACA	2	6	249305	249310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_008269	TAT	2	6	249313	249318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008269	ATTAG	2	10	249324	249333	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008269	CTA	2	6	249454	249459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_008269	GTT	2	6	250200	250205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008269	AAG	2	6	250293	250298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008269	ATG	2	6	250301	250306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008269	TTGCGG	2	12	250348	250359	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1009	NC_008269	GAT	2	6	250412	250417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008269	GA	3	6	250435	250440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008269	CAAG	2	8	250482	250489	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_008269	GTC	2	6	250500	250505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_008269	GAAA	2	8	250531	250538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008269	GGT	2	6	252142	252147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008269	CA	3	6	252172	252177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_008269	GCC	2	6	252259	252264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_008269	GAA	2	6	252272	252277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008269	CG	3	6	252279	252284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_008269	TCG	2	6	252741	252746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008269	TCG	2	6	252788	252793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_008269	CAC	2	6	252864	252869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_008269	ACGC	2	8	253369	253376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_008269	TCC	2	6	253388	253393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_008269	CGCGC	2	10	253402	253411	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1025	NC_008269	TGG	2	6	253553	253558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008269	GCT	3	9	253573	253581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_008269	AGG	2	6	253616	253621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008269	TC	3	6	256820	256825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_008269	CCG	3	9	256843	256851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_008269	GCC	2	6	256880	256885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_008269	GTCG	2	8	256931	256938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_008269	TGA	2	6	257146	257151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008269	ACG	2	6	257209	257214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_008269	ACC	2	6	257217	257222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_008269	GCCG	2	8	257291	257298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_008269	TCGGA	2	10	257899	257908	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_008269	CT	3	6	257924	257929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_008269	CCT	2	6	257966	257971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_008269	GGT	2	6	258726	258731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008269	GTCG	2	8	258734	258741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_008269	CGC	2	6	258840	258845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_008269	GTG	2	6	258859	258864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008269	ACC	2	6	258874	258879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_008269	CTG	2	6	258894	258899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_008269	CAC	2	6	259898	259903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_008269	TGC	2	6	259909	259914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_008269	CTC	2	6	259952	259957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_008269	AGC	2	6	259960	259965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_008269	GGC	2	6	261105	261110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_008269	GAC	2	6	261155	261160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_008269	GCG	2	6	261678	261683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_008269	GAC	2	6	261689	261694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_008269	TCG	2	6	262165	262170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_008269	GAG	2	6	262272	262277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008269	GGT	2	6	262339	262344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008269	CGG	2	6	262361	262366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_008269	TCCC	2	8	263988	263995	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1058	NC_008269	CACC	2	8	264014	264021	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1059	NC_008269	CCGA	2	8	264044	264051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_008269	CGA	2	6	264099	264104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_008269	CTG	2	6	264168	264173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_008269	CG	3	6	265526	265531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_008269	CCGT	2	8	265532	265539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_008269	CG	3	6	265542	265547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_008269	GGTCG	4	20	265551	265570	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1066	NC_008269	TCG	2	6	266731	266736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_008269	CGA	2	6	267621	267626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_008269	CGCGGT	2	12	267661	267672	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_008269	TCGA	2	8	267708	267715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_008269	CG	3	6	267716	267721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_008269	GC	3	6	269076	269081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_008269	CCCG	2	8	269106	269113	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1073	NC_008269	CCAC	2	8	269141	269148	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1074	NC_008269	CAC	3	9	269146	269154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_008269	GGAA	2	8	269158	269165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008269	GGGT	2	8	269771	269778	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008269	GAC	2	6	269780	269785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_008269	GGC	2	6	269811	269816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_008269	GCCGG	2	10	269860	269869	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1080	NC_008269	CAC	2	6	270453	270458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_008269	A	6	6	271247	271252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008269	CCG	2	6	273410	273415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_008269	GGC	2	6	273453	273458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_008269	GCG	3	9	273489	273497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_008269	GAC	2	6	273515	273520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_008269	CTG	2	6	273523	273528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_008269	CCCG	2	8	273564	273571	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1088	NC_008269	G	6	6	273576	273581	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008269	CCG	2	6	275548	275553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_008269	CG	4	8	275576	275583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_008269	GAAA	2	8	275655	275662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008269	AAC	2	6	275719	275724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_008269	ACG	2	6	275730	275735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_008269	CGC	2	6	275772	275777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_008269	CAG	2	6	276671	276676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_008269	CAC	2	6	277552	277557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_008269	CGA	2	6	277566	277571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_008269	TCA	2	6	277604	277609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_008269	ATC	2	6	277610	277615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_008269	GTCC	2	8	278243	278250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_008269	CGG	2	6	278556	278561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_008269	CA	3	6	278601	278606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_008269	C	6	6	278643	278648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1104	NC_008269	CTGGTG	2	12	278651	278662	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1105	NC_008269	CCT	2	6	278666	278671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_008269	C	6	6	278683	278688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1107	NC_008269	CCA	3	9	278691	278699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_008269	CA	3	6	278749	278754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_008269	CAC	2	6	278800	278805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_008269	CGT	2	6	278820	278825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008269	TCC	3	9	278850	278858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_008269	GTG	2	6	279400	279405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008269	TGC	2	6	280215	280220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_008269	TGG	2	6	280237	280242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008269	ACC	2	6	280250	280255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_008269	CA	3	6	280360	280365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_008269	CGC	2	6	281482	281487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_008269	GTA	2	6	281549	281554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008269	CCGCGG	2	12	281578	281589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_008269	CGA	2	6	281593	281598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_008269	TGC	3	9	283616	283624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_008269	CGA	2	6	283729	283734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_008269	TCG	2	6	283821	283826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_008269	CGT	2	6	283827	283832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_008269	CG	3	6	283837	283842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_008269	CGA	2	6	283857	283862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008269	CCG	3	9	283929	283937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_008269	GTG	2	6	283949	283954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008269	GCA	2	6	284063	284068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_008269	CGA	2	6	284125	284130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_008269	CCG	2	6	284150	284155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_008269	GCG	2	6	284172	284177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_008269	TTC	2	6	284178	284183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_008269	CCGC	2	8	284209	284216	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1135	NC_008269	CGGCC	2	10	284222	284231	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1251	NC_008269	TCCGG	2	10	321770	321779	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1252	NC_008269	GCG	2	6	321826	321831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_008269	CGGCC	2	10	323329	323338	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1404	NC_008269	CGCGG	2	10	347096	347105	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1471	NC_008269	CGGG	2	8	352272	352279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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