MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 4335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008269	TCG	2	6	121745	121750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_008269	GCGA	2	8	121814	121821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_008269	CGC	2	6	121871	121876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_008269	CCG	2	6	121932	121937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_008269	GCG	2	6	121956	121961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_008269	CGA	2	6	121990	121995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008269	TTC	2	6	122001	122006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008269	GCACC	2	10	122021	122030	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
509	NC_008269	CGA	2	6	122050	122055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_008269	CAG	2	6	123181	123186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_008269	CGGT	2	8	123290	123297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
512	NC_008269	TCC	2	6	123305	123310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_008269	TGC	2	6	123328	123333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_008269	CCT	2	6	123340	123345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_008269	GTC	2	6	123366	123371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008269	CGA	3	9	123380	123388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008269	CGG	2	6	124485	124490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_008269	CCAGG	2	10	124504	124513	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
519	NC_008269	CCACGA	2	12	124520	124531	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
520	NC_008269	CAG	2	6	124592	124597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_008269	GCC	2	6	124822	124827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_008269	AGG	2	6	124927	124932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008269	TGC	2	6	128686	128691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_008269	CGC	2	6	129921	129926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_008269	CG	3	6	129978	129983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_008269	GTG	2	6	130100	130105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008269	CCCTG	2	10	131163	131172	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
528	NC_008269	CGA	2	6	131346	131351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_008269	CTG	2	6	131429	131434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_008269	AC	4	8	131439	131446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_008269	AC	3	6	131471	131476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_008269	CGA	2	6	131894	131899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_008269	AC	3	6	131918	131923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_008269	CCAC	2	8	131924	131931	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
535	NC_008269	CGA	2	6	131938	131943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_008269	GGA	2	6	131967	131972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008269	TGC	2	6	132010	132015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_008269	CAC	2	6	132032	132037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_008269	ACA	3	9	132064	132072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_008269	TATGCA	2	12	132628	132639	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
541	NC_008269	CGT	2	6	132643	132648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_008269	CCGTC	2	10	132678	132687	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
543	NC_008269	GAT	2	6	132688	132693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008269	CAC	2	6	133544	133549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_008269	TCC	2	6	135658	135663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_008269	CCCG	2	8	135688	135695	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
547	NC_008269	AC	3	6	135754	135759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_008269	ATC	2	6	136955	136960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_008269	GGTC	2	8	136967	136974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
550	NC_008269	TGA	2	6	136988	136993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008269	GAG	2	6	137002	137007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008269	CGTT	2	8	137111	137118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_008269	GC	3	6	137130	137135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_008269	CG	3	6	137159	137164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_008269	GCG	2	6	137180	137185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_008269	TTG	2	6	137192	137197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008269	TCG	2	6	137207	137212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008269	GCAC	2	8	137216	137223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_008269	GAGG	2	8	137248	137255	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008269	CGACC	2	10	137264	137273	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
561	NC_008269	GTC	2	6	137287	137292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_008269	GTG	2	6	137383	137388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008269	CGGC	2	8	137409	137416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_008269	GCG	2	6	137424	137429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_008269	GAG	2	6	137455	137460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008269	CG	3	6	137465	137470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_008269	GTC	2	6	137473	137478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_008269	GCA	2	6	137505	137510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008269	TGG	2	6	137543	137548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008269	ACCG	2	8	137551	137558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
571	NC_008269	GCGGTC	2	12	137561	137572	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_008269	GCG	2	6	137586	137591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_008269	CGG	3	9	137601	137609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_008269	CGA	2	6	137650	137655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_008269	GC	3	6	137682	137687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_008269	GCT	2	6	137758	137763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_008269	GGACC	2	10	137815	137824	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
578	NC_008269	CGA	2	6	137884	137889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008269	GGA	2	6	137963	137968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008269	CCTG	2	8	138082	138089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
581	NC_008269	GCT	2	6	138101	138106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_008269	ATC	3	9	138120	138128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_008269	GGTC	2	8	138130	138137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_008269	CCA	2	6	138193	138198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_008269	TGC	2	6	138220	138225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008269	GCA	2	6	138238	138243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_008269	CGA	2	6	138391	138396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_008269	TCG	2	6	138444	138449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_008269	CGA	2	6	138592	138597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_008269	TGG	2	6	138598	138603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008269	GCT	2	6	138646	138651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_008269	CCA	2	6	138664	138669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_008269	GCA	2	6	138678	138683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_008269	GTC	2	6	138710	138715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_008269	CCG	3	9	138739	138747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_008269	ATC	2	6	138833	138838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008269	GC	3	6	138844	138849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_008269	CAC	2	6	138863	138868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_008269	CGC	2	6	140630	140635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_008269	CAC	2	6	140669	140674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_008269	CAC	2	6	140700	140705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_008269	GGCAC	2	10	140735	140744	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
603	NC_008269	GAT	2	6	143592	143597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008269	GCA	2	6	143631	143636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_008269	CGA	2	6	143725	143730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008269	GC	3	6	143747	143752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_008269	GGC	2	6	143780	143785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_008269	CG	3	6	143790	143795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_008269	GGC	2	6	143850	143855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_008269	GTGC	2	8	143892	143899	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
611	NC_008269	GCC	2	6	143925	143930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_008269	GCC	3	9	143932	143940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_008269	ACG	2	6	144391	144396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_008269	CTC	2	6	144429	144434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_008269	GTC	2	6	146343	146348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_008269	TCG	2	6	146356	146361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_008269	CGG	2	6	146369	146374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_008269	CTG	2	6	146985	146990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_008269	TCG	2	6	147013	147018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_008269	GC	3	6	147041	147046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_008269	TCG	2	6	147103	147108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_008269	CA	3	6	147118	147123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_008269	CCA	2	6	147134	147139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_008269	CGGT	2	8	147145	147152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_008269	TCA	2	6	147206	147211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_008269	GAT	2	6	147214	147219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008269	CCG	3	9	147227	147235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_008269	CCG	2	6	147251	147256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_008269	CAC	2	6	147402	147407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_008269	GC	3	6	147434	147439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_008269	CAG	2	6	147516	147521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_008269	ACC	2	6	147550	147555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_008269	CCG	2	6	147556	147561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_008269	GGCCG	2	10	147599	147608	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
635	NC_008269	CT	4	8	147636	147643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_008269	ACG	2	6	149273	149278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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