MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008268	TCGCT	2	10	115	124	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008268	GTTCC	2	10	5580	5589	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_008268	GGCGC	2	10	8581	8590	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_008268	TGTGC	2	10	9171	9180	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008268	CGGGA	2	10	9351	9360	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008268	GCACC	2	10	11064	11073	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_008268	GATTC	2	10	12107	12116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008268	CGGCG	2	10	13221	13230	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008268	GGCGC	2	10	13323	13332	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008268	GGGGT	2	10	13392	13401	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008268	GCCCA	2	10	13766	13775	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_008268	CCGCG	2	10	14798	14807	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_008268	CGGGT	2	10	17071	17080	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008268	CGAGC	2	10	20620	20629	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008268	CTCCG	2	10	21923	21932	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_008268	GGTCG	2	10	24693	24702	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008268	TCACC	2	10	26582	26591	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_008268	GCATC	2	10	45811	45820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008268	GGCGG	2	10	49733	49742	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008268	CGCCC	2	10	56827	56836	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_008268	CGGTG	2	10	67845	67854	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008268	CCGGC	2	10	68852	68861	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_008268	GCCGC	2	10	75176	75185	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_008268	GCGCT	2	10	128915	128924	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008268	AACCG	2	10	172374	172383	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008268	CAAAC	2	10	172861	172870	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_008268	GCCCG	2	10	210295	210304	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_008268	AACCA	2	10	210341	210350	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008268	GGCTC	2	10	211190	211199	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_008268	GCGAC	2	10	217028	217037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008268	CCCGG	2	10	238494	238503	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_008268	CACCC	2	10	240595	240604	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
33	NC_008268	ACCTC	2	10	251221	251230	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_008268	TCCGT	2	10	263791	263800	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_008268	GGCAC	2	10	266885	266894	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_008268	CACCG	2	10	306870	306879	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_008268	CGATC	2	10	316077	316086	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_008268	ATCGA	2	10	348921	348930	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008268	GGGTG	2	10	361262	361271	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008268	GTGCC	2	10	367982	367991	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_008268	GGACC	2	10	375139	375148	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_008268	CCGGG	2	10	379346	379355	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_008268	CCGTC	2	10	381632	381641	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_008268	CACCC	2	10	391524	391533	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
45	NC_008268	GTCAC	2	10	400719	400728	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008268	GCGCC	2	10	400758	400767	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_008268	GAAAT	2	10	446794	446803	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008268	CCTCA	2	10	449312	449321	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_008268	CCGGG	2	10	480231	480240	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008268	CTCGT	2	10	484523	484532	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_008268	CCGGC	2	10	505668	505677	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_008268	ACGAG	2	10	517580	517589	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008268	AGCGA	2	10	521328	521337	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008268	CGCGG	2	10	523202	523211	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_008268	ACAGA	2	10	526153	526162	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008268	CGGTG	2	10	532627	532636	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008268	GCGTC	2	10	536794	536803	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_008268	GTGTT	2	10	539756	539765	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008268	CGGAC	2	10	540632	540641	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_008268	GAACC	2	10	541052	541061	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_008268	CCGGC	2	10	541080	541089	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_008268	ACTGG	2	10	542430	542439	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008268	AGTCG	2	10	543476	543485	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008268	GGGAT	2	10	552691	552700	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008268	CGCAG	2	10	569031	569040	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_008268	GCCGC	2	10	572839	572848	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_008268	GTCTG	2	10	575829	575838	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008268	CCCCG	2	10	576466	576475	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
69	NC_008268	CGGAG	2	10	586218	586227	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_008268	ACCGA	2	10	604062	604071	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_008268	GGGTC	2	10	610043	610052	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008268	CGGGG	2	10	618510	618519	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008268	CGATC	2	10	624271	624280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_008268	ACGCC	2	10	624762	624771	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_008268	CCGGG	2	10	625260	625269	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_008268	GATGA	2	10	628065	628074	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008268	CGACC	2	10	634187	634196	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_008268	CCCAT	2	10	638684	638693	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_008268	GCACC	3	15	648171	648185	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_008268	GCGCG	2	10	654406	654415	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_008268	CGGCC	2	10	658927	658936	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_008268	CCCGC	2	10	680246	680255	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
83	NC_008268	CCAGA	2	10	686442	686451	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_008268	CACAA	2	10	687441	687450	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_008268	ACGCA	2	10	709012	709021	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_008268	CGATC	2	10	712313	712322	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_008268	ACCCC	2	10	719536	719545	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
88	NC_008268	CCCGT	2	10	722330	722339	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_008268	ACCGG	2	10	726863	726872	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_008268	GAGTG	2	10	726976	726985	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008268	CTGGT	2	10	726993	727002	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008268	GACGA	2	10	738372	738381	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008268	GCTGT	2	10	741133	741142	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008268	GATCA	2	10	742867	742876	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_008268	GCCGA	2	10	743028	743037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_008268	CGCGG	2	10	749671	749680	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_008268	CGACG	2	10	751348	751357	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_008268	TTGCC	2	10	755229	755238	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_008268	GCGCT	2	10	758707	758716	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_008268	CGGCA	2	10	758972	758981	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_008268	GGCGG	2	10	759510	759519	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
102	NC_008268	GAGCC	2	10	767713	767722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_008268	GACCG	2	10	777374	777383	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_008268	CCGCG	2	10	780666	780675	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_008268	TCGCA	2	10	784779	784788	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_008268	CCGCC	2	10	785568	785577	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
107	NC_008268	CGGGG	2	10	795366	795375	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008268	GATGG	2	10	795623	795632	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008268	CGCTG	2	10	799231	799240	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_008268	ATCAG	2	10	820934	820943	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008268	CGCAC	2	10	827494	827503	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_008268	CGCGG	2	10	835767	835776	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_008268	GAACG	2	10	848211	848220	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008268	GCGGA	2	10	860293	860302	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008268	CAGAA	2	10	864439	864448	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008268	CATCG	2	10	868765	868774	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_008268	CCGGC	2	10	868930	868939	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_008268	TGAAC	2	10	869005	869014	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008268	CCGGT	2	10	889651	889660	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_008268	CCGAT	2	10	897166	897175	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_008268	GTCCT	2	10	897530	897539	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_008268	CGACG	2	10	897608	897617	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_008268	CGACT	2	10	903726	903735	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_008268	CCACG	2	10	925013	925022	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_008268	GCAGG	2	10	941226	941235	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008268	CCCTC	2	10	955079	955088	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
127	NC_008268	TCGAG	2	10	963417	963426	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_008268	CACTG	2	10	964513	964522	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_008268	CAACG	2	10	964550	964559	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008268	ATTCG	2	10	965149	965158	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_008268	TGTGG	2	10	975360	975369	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008268	GCCGG	2	10	983176	983185	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_008268	ACCGA	2	10	998805	998814	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_008268	CTCCC	2	10	1000563	1000572	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
135	NC_008268	ACCAG	2	10	1001210	1001219	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_008268	TGACG	2	10	1001629	1001638	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_008268	CACGA	2	10	1001965	1001974	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_008268	CACAC	2	10	1003152	1003161	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_008268	ACCGG	2	10	1003572	1003581	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_008268	GACGG	2	10	1019752	1019761	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_008268	GGCGC	2	10	1033906	1033915	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_008268	CCGGT	2	10	1034023	1034032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_008268	TGCAT	2	10	1042482	1042491	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008268	CGAGG	2	10	1055501	1055510	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_008268	TCCGT	2	10	1068833	1068842	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_008268	TCGTG	2	10	1099788	1099797	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_008268	CGGAG	2	10	1169416	1169425	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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251	NC_008268	GCCGA	2	10	2867202	2867211	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
252	NC_008268	CCGAC	2	10	2868174	2868183	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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271	NC_008268	TCCCA	2	10	3057394	3057403	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
272	NC_008268	CTTCG	2	10	3057633	3057642	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
273	NC_008268	CGTTT	2	10	3066887	3066896	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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276	NC_008268	CCTGC	2	10	3129447	3129456	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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278	NC_008268	CGCGG	2	10	3147370	3147379	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
279	NC_008268	CGGCT	2	10	3161036	3161045	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
280	NC_008268	ACCAG	2	10	3167974	3167983	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
281	NC_008268	CACGT	2	10	3176529	3176538	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
282	NC_008268	GCACC	2	10	3178677	3178686	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
283	NC_008268	CATCG	2	10	3187481	3187490	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_008268	TCTCG	2	10	3191291	3191300	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
285	NC_008268	GGCCC	2	10	3225501	3225510	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
286	NC_008268	CGACC	2	10	3251695	3251704	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
287	NC_008268	CGGTT	2	10	3257129	3257138	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_008268	CCTTC	2	10	3261530	3261539	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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323	NC_008268	GAGGT	2	10	3450118	3450127	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_008268	TCTGG	2	10	4592074	4592083	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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422	NC_008268	TGTCG	2	10	4639063	4639072	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
423	NC_008268	TCGCT	2	10	4645166	4645175	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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453	NC_008268	TTCGG	2	10	5147313	5147322	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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472	NC_008268	TCGGC	2	10	5558692	5558701	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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477	NC_008268	TTCGA	2	10	5613446	5613455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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479	NC_008268	TGCAC	2	10	5626297	5626306	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
480	NC_008268	GTACG	2	10	5627033	5627042	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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486	NC_008268	CCGAC	2	10	5714007	5714016	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
487	NC_008268	AACCG	2	10	5741258	5741267	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
488	NC_008268	GGGCG	2	10	5742004	5742013	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
489	NC_008268	TCGCG	2	10	5755457	5755466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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