MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 2176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008268	TCGA	2	8	106	113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008268	CAAT	2	8	430	437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008268	CGCC	2	8	482	489	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_008268	CCCA	2	8	610	617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_008268	TCGC	2	8	651	658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008268	CACC	2	8	751	758	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_008268	ATTG	2	8	2664	2671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008268	ACCC	2	8	2693	2700	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_008268	AGGA	2	8	8562	8569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008268	CCGA	2	8	8852	8859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008268	CGGA	2	8	9139	9146	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008268	TCGG	2	8	9324	9331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008268	GCCA	2	8	9560	9567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008268	CCCG	2	8	10175	10182	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_008268	ACCA	2	8	10631	10638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008268	GGCC	2	8	11052	11059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008268	CCGG	2	8	11802	11809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008268	GTCG	2	8	12440	12447	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008268	AGGC	2	8	12902	12909	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008268	CCCG	2	8	12983	12990	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_008268	GCAC	2	8	13802	13809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008268	TCTT	2	8	13887	13894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008268	CCGA	2	8	14330	14337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008268	CCGA	2	8	14560	14567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008268	CCTC	2	8	14790	14797	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_008268	GCCG	2	8	14835	14842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008268	GTTC	2	8	15032	15039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008268	GAGC	2	8	16683	16690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008268	CTGG	2	8	16930	16937	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008268	TCGC	2	8	17055	17062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008268	TGGC	2	8	17227	17234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008268	GCCG	2	8	17257	17264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008268	TCGG	2	8	17448	17455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008268	GACC	2	8	17614	17621	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008268	ACCT	2	8	18058	18065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008268	CGCA	2	8	20749	20756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008268	CCTA	2	8	21029	21036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008268	AACC	2	8	21051	21058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008268	CTTC	2	8	21205	21212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008268	CCCA	2	8	21346	21353	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_008268	CGCC	2	8	21521	21528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_008268	CCGA	2	8	21594	21601	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008268	CATC	2	8	21614	21621	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008268	ACAT	2	8	22027	22034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008268	ACCC	2	8	23378	23385	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_008268	CCCA	2	8	24902	24909	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_008268	CTCG	2	8	45644	45651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008268	CGGT	2	8	45665	45672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008268	GATC	2	8	49437	49444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008268	CGTC	2	8	49524	49531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008268	CGAC	2	8	49662	49669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008268	GCGA	2	8	49846	49853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008268	GTCG	2	8	53098	53105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008268	TGAA	2	8	60231	60238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008268	CGGC	2	8	63604	63611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008268	CCGG	2	8	66679	66686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008268	CGAA	2	8	66726	66733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008268	CGGT	2	8	75050	75057	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008268	GCGG	2	8	83428	83435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008268	GGCA	2	8	89709	89716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008268	GGTG	2	8	90506	90513	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008268	GCGG	2	8	94916	94923	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008268	GAAC	2	8	102106	102113	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008268	CGAA	2	8	104962	104969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008268	AGGA	2	8	107653	107660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008268	GGTT	2	8	115877	115884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008268	CGGC	2	8	116068	116075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008268	CCGG	2	8	119982	119989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008268	TCCG	2	8	124326	124333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008268	TCAC	2	8	134535	134542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008268	CGTG	2	8	135226	135233	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008268	CGGT	2	8	139740	139747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008268	GCCC	2	8	144467	144474	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_008268	GACC	2	8	172624	172631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008268	AGGT	2	8	172656	172663	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008268	CCGG	2	8	208839	208846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008268	GGGT	2	8	220455	220462	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008268	CGAC	2	8	221249	221256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008268	GCCG	2	8	237132	237139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008268	TGCA	2	8	237626	237633	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008268	TGCA	2	8	238455	238462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008268	CGAT	2	8	239918	239925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008268	GTTC	2	8	239959	239966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008268	CGTC	2	8	240125	240132	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008268	AACC	2	8	240553	240560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008268	GATC	2	8	240612	240619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008268	GGGC	2	8	244785	244792	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008268	CTCA	2	8	244811	244818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008268	GCAG	2	8	247568	247575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008268	CGAT	2	8	248535	248542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008268	GCAC	2	8	248568	248575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008268	CCCA	2	8	250454	250461	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_008268	ATGG	2	8	257655	257662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008268	AGCG	2	8	257689	257696	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008268	CTGC	2	8	266924	266931	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008268	ATCC	2	8	268825	268832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008268	GCAA	2	8	276036	276043	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008268	CGGG	2	8	277366	277373	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008268	CCGG	2	8	306795	306802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008268	GATC	2	8	313169	313176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008268	GCGG	2	8	323806	323813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008268	TGGA	2	8	326258	326265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008268	ACTC	2	8	326813	326820	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008268	AAGG	2	8	333521	333528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008268	GCCG	2	8	335289	335296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008268	GACG	2	8	335945	335952	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008268	CGGC	2	8	335955	335962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008268	TCTG	2	8	346069	346076	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008268	GCGT	2	8	353784	353791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008268	TCCG	2	8	356880	356887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008268	CGCC	2	8	356909	356916	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_008268	CCCT	2	8	357135	357142	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_008268	GATC	2	8	361336	361343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008268	CGAT	2	8	361385	361392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008268	CCGA	2	8	363695	363702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008268	CCAC	2	8	366117	366124	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_008268	GACG	2	8	366174	366181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008268	GTGG	2	8	367103	367110	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008268	ACCC	2	8	367119	367126	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_008268	GCAT	2	8	368133	368140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008268	CGGA	2	8	375018	375025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008268	AGGG	2	8	375211	375218	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008268	GAAC	2	8	379404	379411	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008268	GGCG	2	8	381398	381405	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008268	GACT	2	8	381577	381584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008268	CGGA	3	12	381764	381775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008268	TGAG	2	8	381839	381846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008268	CCAA	2	8	383926	383933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008268	AGCA	2	8	388507	388514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008268	CTCG	2	8	389950	389957	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008268	GCCG	2	8	390012	390019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008268	CCGC	2	8	391664	391671	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_008268	ACAG	2	8	394665	394672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008268	TAAT	2	8	398329	398336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008268	CCCG	2	8	400697	400704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_008268	CCGA	2	8	404486	404493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008268	TCCG	2	8	405080	405087	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008268	ACGA	2	8	406810	406817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008268	GCCG	2	8	411146	411153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008268	CTGA	2	8	413421	413428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008268	CAGG	2	8	423309	423316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008268	GACA	2	8	424844	424851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008268	AGCC	2	8	425871	425878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008268	GTCT	2	8	425894	425901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008268	CGGG	2	8	426547	426554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008268	TCGC	2	8	428320	428327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008268	ATGA	2	8	428406	428413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008268	CCCG	2	8	431068	431075	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_008268	CGGC	2	8	434529	434536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008268	ACGG	2	8	435264	435271	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008268	TCGG	2	8	435274	435281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008268	AGAC	2	8	436515	436522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_008268	TCCT	2	8	437572	437579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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159	NC_008268	TGCG	2	8	462834	462841	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_008268	GGGA	2	8	476437	476444	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008268	TCGG	2	8	480258	480265	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_008268	GTGG	2	8	505700	505707	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_008268	CTGA	2	8	579622	579629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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447	NC_008268	GTGA	2	8	1265432	1265439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_008268	CGAT	2	8	1281729	1281736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_008268	TTCG	2	8	1317381	1317388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_008268	GCCG	2	8	1419313	1419320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
482	NC_008268	ATCG	2	8	1420566	1420573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
483	NC_008268	TCGA	2	8	1432199	1432206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
484	NC_008268	CGGT	2	8	1438797	1438804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_008268	AGTT	2	8	1444587	1444594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_008268	CGCC	2	8	1477323	1477330	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
489	NC_008268	CCTT	2	8	1478193	1478200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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494	NC_008268	GCGA	2	8	1488442	1488449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
495	NC_008268	CATA	2	8	1488537	1488544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
496	NC_008268	CACG	2	8	1493722	1493729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_008268	TCAC	2	8	1493764	1493771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
498	NC_008268	TCAC	2	8	1494539	1494546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_008268	AGCG	2	8	1496136	1496143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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