MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008268	ACA	2	6	1440063	1440068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_008268	CAT	2	6	1440078	1440083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_008268	AGG	2	6	1440093	1440098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_008268	GC	3	6	1441995	1442000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_008268	TCA	2	6	1442052	1442057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_008268	CGA	2	6	1442084	1442089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_008268	CG	3	6	1444554	1444559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_008268	AGTT	2	8	1444587	1444594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_008268	GC	3	6	1444610	1444615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_008268	AGG	2	6	1447531	1447536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_008268	GCC	2	6	1447556	1447561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_008268	AAC	2	6	1447582	1447587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_008268	CCG	2	6	1447591	1447596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_008268	TGCC	2	8	1449064	1449071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_008268	GAA	2	6	1449196	1449201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_008268	C	6	6	1449210	1449215	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3517	NC_008268	GAC	2	6	1449260	1449265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_008268	CA	3	6	1449369	1449374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_008268	T	6	6	1449403	1449408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_008268	GGC	3	9	1449419	1449427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_008268	GTC	2	6	1449483	1449488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_008268	CGG	2	6	1449591	1449596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_008268	CGT	2	6	1451745	1451750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_008268	ACC	2	6	1458721	1458726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_008268	CGGAC	2	10	1459302	1459311	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3526	NC_008268	GAT	2	6	1459318	1459323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_008268	CGG	2	6	1459346	1459351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_008268	AGG	2	6	1459415	1459420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_008268	CG	3	6	1459439	1459444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_008268	GTG	2	6	1461506	1461511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_008268	ACC	2	6	1465102	1465107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_008268	CGC	2	6	1470071	1470076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_008268	CT	3	6	1470083	1470088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_008268	GAA	2	6	1472334	1472339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_008268	CGCGGG	2	12	1472357	1472368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_008268	TCAC	2	8	1472858	1472865	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_008268	AGC	2	6	1472938	1472943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_008268	GCT	2	6	1472951	1472956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_008268	TGC	2	6	1475553	1475558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_008268	GC	3	6	1475557	1475562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_008268	ACC	2	6	1475670	1475675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_008268	TG	3	6	1475823	1475828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_008268	TGG	2	6	1475882	1475887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_008268	AG	3	6	1475944	1475949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_008268	CCA	2	6	1476004	1476009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_008268	GA	3	6	1476016	1476021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_008268	CGG	2	6	1477309	1477314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_008268	CGCC	2	8	1477323	1477330	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3549	NC_008268	GGT	2	6	1477340	1477345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_008268	CCTT	2	8	1478193	1478200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_008268	GGC	2	6	1478266	1478271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_008268	GCA	2	6	1478280	1478285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_008268	CGT	2	6	1478317	1478322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_008268	CCA	2	6	1478421	1478426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_008268	TCC	2	6	1478427	1478432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_008268	GCC	2	6	1478457	1478462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_008268	GAC	2	6	1479758	1479763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_008268	GAGT	2	8	1479770	1479777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_008268	CCAA	2	8	1479790	1479797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_008268	CAGG	2	8	1480434	1480441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_008268	GCCGTC	2	12	1481815	1481826	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_008268	CGA	2	6	1481841	1481846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_008268	CGG	2	6	1482163	1482168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_008268	CCT	3	9	1484751	1484759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_008268	AG	4	8	1484796	1484803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_008268	CGCA	2	8	1484831	1484838	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_008268	TGA	2	6	1486488	1486493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_008268	ACT	2	6	1486495	1486500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_008268	GCGA	2	8	1488442	1488449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_008268	CGA	2	6	1488474	1488479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_008268	AAC	2	6	1488497	1488502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_008268	CATA	2	8	1488537	1488544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_008268	CGC	2	6	1489093	1489098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_008268	GCT	2	6	1491134	1491139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_008268	CTC	2	6	1493712	1493717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_008268	CACG	2	8	1493722	1493729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_008268	TCAC	2	8	1493764	1493771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_008268	ACT	2	6	1493775	1493780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_008268	TCAC	2	8	1494539	1494546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_008268	ATG	2	6	1495953	1495958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_008268	CCAA	2	8	1495979	1495986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_008268	GCG	2	6	1496029	1496034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_008268	CCA	2	6	1496081	1496086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_008268	AGCG	2	8	1496136	1496143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3585	NC_008268	CACCG	2	10	1496272	1496281	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3586	NC_008268	GGC	2	6	1496286	1496291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_008268	GCC	2	6	1496306	1496311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_008268	TCC	2	6	1496594	1496599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_008268	CGA	2	6	1496641	1496646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_008268	GGC	2	6	1497237	1497242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_008268	GTC	2	6	1497248	1497253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_008268	GCC	2	6	1497255	1497260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_008268	TGG	2	6	1497275	1497280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_008268	GGGA	2	8	1497379	1497386	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_008268	CGT	2	6	1498577	1498582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_008268	ACC	2	6	1508223	1508228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_008268	G	6	6	1508352	1508357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_008268	TGC	2	6	1509506	1509511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_008268	G	6	6	1509512	1509517	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_008268	CG	4	8	1509546	1509553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_008268	C	6	6	1509621	1509626	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3602	NC_008268	CGG	2	6	1509659	1509664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_008268	GTC	2	6	1509687	1509692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_008268	GGC	2	6	1509694	1509699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_008268	GCC	2	6	1509707	1509712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_008268	AGC	2	6	1509731	1509736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_008268	CGT	2	6	1509757	1509762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_008268	ATG	2	6	1510552	1510557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_008268	ATC	2	6	1510573	1510578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_008268	CAGC	2	8	1510593	1510600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_008268	CAT	2	6	1510620	1510625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_008268	CCT	2	6	1510641	1510646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_008268	AG	3	6	1512078	1512083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_008268	CA	3	6	1513691	1513696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_008268	ACCG	2	8	1515515	1515522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_008268	CGT	2	6	1526832	1526837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_008268	GCCCA	2	10	1526917	1526926	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3618	NC_008268	GCC	2	6	1526930	1526935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_008268	CAC	2	6	1532658	1532663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_008268	TCCTG	2	10	1532771	1532780	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3621	NC_008268	CCG	2	6	1533530	1533535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_008268	GC	3	6	1534597	1534602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_008268	GTG	2	6	1535037	1535042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_008268	ACC	2	6	1535051	1535056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_008268	GTC	2	6	1535064	1535069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_008268	TCC	2	6	1536271	1536276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_008268	CGA	2	6	1536321	1536326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_008268	GGCC	2	8	1536841	1536848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3629	NC_008268	GGC	2	6	1536896	1536901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3631	NC_008268	TCCG	2	8	1541402	1541409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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